MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	GAAAAT	2	12	10669	10680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011742	AAGGGA	2	12	86773	86784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011742	GTAGTG	2	12	205180	205191	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011742	TGTTGA	2	12	263508	263519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011742	CTTTTC	2	12	279499	279510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011742	TTTTCT	2	12	329438	329449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011742	CTATTT	2	12	330475	330486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011742	TGTCTG	2	12	347132	347143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011742	TTTATT	2	12	364309	364320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011742	AACAAT	2	12	410870	410881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011742	TATTGA	2	12	413716	413727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011742	TTTTCA	2	12	475992	476003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011742	CAGGCG	2	12	494836	494847	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011742	TTTCTG	2	12	521198	521209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011742	AATATG	2	12	605983	605994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011742	TGCAAA	2	12	636794	636805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011742	CATGAG	2	12	678727	678738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011742	ATTTTT	2	12	731899	731910	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011742	TTTACC	2	12	742811	742822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011742	TTTTCT	2	12	798172	798183	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011742	CTGGGT	2	12	805481	805492	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011742	TAACCG	2	12	923700	923711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011742	AACGCT	2	12	932954	932965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011742	TTTGCC	2	12	933668	933679	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011742	AAATAA	2	12	961674	961685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011742	CTGGAA	2	12	971238	971249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011742	AAAGAT	2	12	994031	994042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011742	ATAATG	2	12	1031335	1031346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011742	TGGTAA	2	12	1055116	1055127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011742	TGTTAA	2	12	1063560	1063571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011742	TTCACT	2	12	1080705	1080716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011742	CAAAAA	2	12	1107164	1107175	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011742	ACAGGA	2	12	1196776	1196787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011742	AAAATG	2	12	1227676	1227687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011742	AGTGAA	2	12	1239175	1239186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011742	AGGGGG	2	12	1239597	1239608	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011742	CTTATT	2	12	1309359	1309370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011742	CAAAAG	2	12	1316410	1316421	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011742	CTGATC	2	12	1326888	1326899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011742	GGAAAA	2	12	1345186	1345197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011742	AAAGTT	2	12	1378208	1378219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011742	TATAAC	2	12	1427436	1427447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011742	TAAATT	2	12	1473354	1473365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011742	GTTAAT	2	12	1538316	1538327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011742	AAAAAC	2	12	1564683	1564694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011742	CGTTGT	2	12	1566071	1566082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011742	ACCGTT	2	12	1572255	1572266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011742	TGGTTA	2	12	1581084	1581095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011742	CAAAAA	2	12	1619541	1619552	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011742	ATACTT	2	12	1705325	1705336	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011742	AAAATA	2	12	1718983	1718994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011742	TGTTTT	2	12	1719616	1719627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011742	AAGACT	2	12	1719876	1719887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011742	GAACAG	2	12	1767481	1767492	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011742	ACAGCG	2	12	1829560	1829571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011742	TATTAC	2	12	1832595	1832606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011742	ATCAGA	2	12	1832888	1832899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011742	TTTCTT	2	12	1845048	1845059	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011742	AATTCA	2	12	1938834	1938845	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011742	ATATTT	2	12	1940821	1940832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011742	TCTTAT	2	12	1952642	1952653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011742	ACAGAC	2	12	2031293	2031304	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011742	ATTTTT	2	12	2038067	2038078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011742	CTGATA	2	12	2047156	2047167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011742	TTTTGT	2	12	2119902	2119913	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011742	ACCAAT	2	12	2193223	2193234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011742	TCTTCC	2	12	2299708	2299719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011742	ATGCTA	2	12	2322972	2322983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011742	ACCAAT	2	12	2391033	2391044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011742	TAAATG	2	12	2434864	2434875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011742	TGTCAC	2	12	2448498	2448509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011742	AGCGGA	2	12	2451634	2451645	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011742	AGAAAA	2	12	2458777	2458788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011742	GTTATG	2	12	2569749	2569760	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011742	TCGATA	2	12	2580375	2580386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011742	CAAGTG	2	12	2586718	2586729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011742	TGCCAG	2	12	2676226	2676237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011742	TCCTTC	2	12	2682459	2682470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011742	TGAGCG	2	12	2716935	2716946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011742	TGGACA	2	12	2726945	2726956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011742	ATATAG	2	12	2871163	2871174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011742	TGATAT	2	12	2909022	2909033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011742	TGATAT	2	12	2909162	2909173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011742	TGACGC	2	12	2960469	2960480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011742	AATGAT	2	12	2988384	2988395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011742	GGTTTT	2	12	3004361	3004372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011742	ACAAGA	2	12	3008691	3008702	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011742	TTTGTT	2	12	3033515	3033526	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011742	ATCGCG	2	12	3151699	3151710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011742	GTAAGG	2	12	3166374	3166385	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011742	ACTGAG	2	12	3190483	3190494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011742	CGTAAA	2	12	3242301	3242312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011742	TAATGA	2	12	3261271	3261282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011742	TTTTTA	2	12	3286053	3286064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011742	TTTTCG	2	12	3319417	3319428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011742	ATTTAA	2	12	3332621	3332632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011742	ATAAAA	2	12	3384501	3384512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011742	ATTTAA	2	12	3395241	3395252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011742	AGTTGT	2	12	3426537	3426548	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011742	CTTTTT	2	12	3431214	3431225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011742	AATGAT	2	12	3432049	3432060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011742	TCTCCC	2	12	3453900	3453911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011742	TTTTAT	2	12	3489440	3489451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011742	AAGCGA	2	12	3494838	3494849	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011742	ACAGAA	2	12	3542235	3542246	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011742	AGCGTT	2	12	3624023	3624034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011742	TTTATA	2	12	3640704	3640715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011742	AATTTA	2	12	3746748	3746759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011742	CGCTCG	2	12	3758768	3758779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011742	ACGCCA	2	12	3759700	3759711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011742	TGATAA	2	12	3773557	3773568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011742	AAGATA	2	12	3844367	3844378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011742	AGATGC	2	12	3859836	3859847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011742	TGAAAA	2	12	3883723	3883734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011742	TTGATC	2	12	3907190	3907201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011742	ACTGCG	2	12	3907328	3907339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011742	ATCAGC	2	12	3908783	3908794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011742	GCGGAC	2	12	3909161	3909172	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011742	GCCAGC	2	12	3923102	3923113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011742	CTGAAG	2	12	3925555	3925566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011742	CTTTTT	2	12	4149712	4149723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011742	GCCATA	2	12	4203011	4203022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011742	CAGACG	2	12	4204208	4204219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011742	AAATGG	2	12	4283867	4283878	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011742	GGGAGT	2	12	4313295	4313306	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011742	GCTGAA	2	12	4322453	4322464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011742	GCTGAA	2	12	4322550	4322561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011742	ATAAAA	2	12	4325172	4325183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011742	ATTTTT	2	12	4389307	4389318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011742	TCATTT	2	12	4456113	4456124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011742	TAACCA	2	12	4475587	4475598	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011742	ATTTAT	2	12	4524759	4524770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011742	GTCTTT	2	12	4533568	4533579	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011742	CTGATA	2	12	4601284	4601295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_011742	ATATTG	2	12	4621526	4621537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011742	GAGAAA	2	12	4623947	4623958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011742	TGACGG	2	12	4623982	4623993	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_011742	TTTTGT	2	12	4679447	4679458	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_011742	TTTAAT	2	12	4746955	4746966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_011742	AACAGG	2	12	4887112	4887123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_011742	TTCCTT	2	12	4970753	4970764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011742	GTAAAA	2	12	5021296	5021307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.