MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 2675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218556941
2	NC_011742	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218556942
3	NC_011742	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	218556947
4	NC_011742	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	218556947
5	NC_011742	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	218556948
6	NC_011742	CGCGC	2	10	10831	10840	0 %	0 %	40 %	60 %	218556950
7	NC_011742	GTTTC	2	10	11727	11736	0 %	60 %	20 %	20 %	218556951
8	NC_011742	CTGGA	2	10	18097	18106	20 %	20 %	40 %	20 %	218556956
9	NC_011742	ACCAC	2	10	18936	18945	40 %	0 %	0 %	60 %	218556957
10	NC_011742	TCCTT	2	10	19775	19784	0 %	60 %	0 %	40 %	218556957
11	NC_011742	CCGAT	2	10	20467	20476	20 %	20 %	20 %	40 %	218556958
12	NC_011742	GCGAA	2	10	34359	34368	40 %	0 %	40 %	20 %	218556971
13	NC_011742	CCGTT	2	10	35253	35262	0 %	40 %	20 %	40 %	218556971
14	NC_011742	CACGG	2	10	35630	35639	20 %	0 %	40 %	40 %	218556971
15	NC_011742	CGAAT	2	10	39083	39092	40 %	20 %	20 %	20 %	218556977
16	NC_011742	CCATG	2	10	40620	40629	20 %	20 %	20 %	40 %	218556978
17	NC_011742	CCGTA	2	10	42265	42274	20 %	20 %	20 %	40 %	218556979
18	NC_011742	TTAAA	2	10	43003	43012	60 %	40 %	0 %	0 %	218556979
19	NC_011742	ACCCA	2	10	43746	43755	40 %	0 %	0 %	60 %	218556980
20	NC_011742	TTTGA	2	10	45372	45381	20 %	60 %	20 %	0 %	218556981
21	NC_011742	CGGCG	2	10	45623	45632	0 %	0 %	60 %	40 %	218556981
22	NC_011742	AATCA	2	10	45905	45914	60 %	20 %	0 %	20 %	218556982
23	NC_011742	CGGTT	2	10	46860	46869	0 %	40 %	40 %	20 %	218556983
24	NC_011742	TGGCG	2	10	48552	48561	0 %	20 %	60 %	20 %	218556985
25	NC_011742	TGCAC	2	10	50314	50323	20 %	20 %	20 %	40 %	218556986
26	NC_011742	AACGT	2	10	54720	54729	40 %	20 %	20 %	20 %	218556991
27	NC_011742	GCGTC	2	10	57704	57713	0 %	20 %	40 %	40 %	218556994
28	NC_011742	ATGTT	2	10	58518	58527	20 %	60 %	20 %	0 %	218556995
29	NC_011742	TGCGT	2	10	59237	59246	0 %	40 %	40 %	20 %	218556995
30	NC_011742	AAAGT	2	10	65004	65013	60 %	20 %	20 %	0 %	218556998
31	NC_011742	CAGCG	2	10	68704	68713	20 %	0 %	40 %	40 %	218557001
32	NC_011742	TCGCG	2	10	69974	69983	0 %	20 %	40 %	40 %	218557001
33	NC_011742	TTTTC	2	10	74394	74403	0 %	80 %	0 %	20 %	218557004
34	NC_011742	AAAGC	2	10	74698	74707	60 %	0 %	20 %	20 %	218557005
35	NC_011742	CAGCA	2	10	75335	75344	40 %	0 %	20 %	40 %	218557006
36	NC_011742	TTGCT	2	10	79432	79441	0 %	60 %	20 %	20 %	218557010
37	NC_011742	GATGG	2	10	80168	80177	20 %	20 %	60 %	0 %	218557010
38	NC_011742	ATTTT	2	10	80996	81005	20 %	80 %	0 %	0 %	218557011
39	NC_011742	GGGAG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	80 %	0 %	218557011
40	NC_011742	ACCGG	2	10	82165	82174	20 %	0 %	40 %	40 %	218557013
41	NC_011742	CCTGG	2	10	82421	82430	0 %	20 %	40 %	40 %	218557013
42	NC_011742	ATGCG	2	10	83866	83875	20 %	20 %	40 %	20 %	218557014
43	NC_011742	GACCG	2	10	84688	84697	20 %	0 %	40 %	40 %	218557015
44	NC_011742	ATGTT	2	10	87234	87243	20 %	60 %	20 %	0 %	218557017
45	NC_011742	AAAAC	2	10	87649	87658	80 %	0 %	0 %	20 %	218557017
46	NC_011742	TGCAT	2	10	88176	88185	20 %	40 %	20 %	20 %	218557018
47	NC_011742	ATTCC	2	10	88346	88355	20 %	40 %	0 %	40 %	218557018
48	NC_011742	AGTTC	2	10	93439	93448	20 %	40 %	20 %	20 %	218557022
49	NC_011742	TGCCT	2	10	93539	93548	0 %	40 %	20 %	40 %	218557023
50	NC_011742	CGTGG	2	10	94812	94821	0 %	20 %	60 %	20 %	218557024
51	NC_011742	TATCG	2	10	95319	95328	20 %	40 %	20 %	20 %	218557024
52	NC_011742	GGGCT	2	10	99191	99200	0 %	20 %	60 %	20 %	218557027
53	NC_011742	GCCTG	2	10	99651	99660	0 %	20 %	40 %	40 %	218557028
54	NC_011742	TCTGG	2	10	100898	100907	0 %	40 %	40 %	20 %	218557029
55	NC_011742	ACCGT	2	10	101564	101573	20 %	20 %	20 %	40 %	218557029
56	NC_011742	ATCAG	2	10	103337	103346	40 %	20 %	20 %	20 %	218557031
57	NC_011742	AGCCG	2	10	105105	105114	20 %	0 %	40 %	40 %	218557032
58	NC_011742	GCGCA	2	10	107433	107442	20 %	0 %	40 %	40 %	218557034
59	NC_011742	CCGGC	2	10	111397	111406	0 %	0 %	40 %	60 %	218557038
60	NC_011742	TGGTC	2	10	111551	111560	0 %	40 %	40 %	20 %	218557038
61	NC_011742	CGCGG	2	10	114603	114612	0 %	0 %	60 %	40 %	218557041
62	NC_011742	CATCG	2	10	116860	116869	20 %	20 %	20 %	40 %	218557044
63	NC_011742	TAACG	2	10	117554	117563	40 %	20 %	20 %	20 %	218557044
64	NC_011742	ATGCC	2	10	118013	118022	20 %	20 %	20 %	40 %	218557044
65	NC_011742	AATGC	2	10	119296	119305	40 %	20 %	20 %	20 %	218557045
66	NC_011742	TCTGT	2	10	120243	120252	0 %	60 %	20 %	20 %	218557047
67	NC_011742	GCAGG	2	10	122675	122684	20 %	0 %	60 %	20 %	218557050
68	NC_011742	TCATT	2	10	127715	127724	20 %	60 %	0 %	20 %	218557054
69	NC_011742	CGAAG	2	10	128494	128503	40 %	0 %	40 %	20 %	218557055
70	NC_011742	ACACG	2	10	128627	128636	40 %	0 %	20 %	40 %	218557055
71	NC_011742	TCGCG	2	10	128888	128897	0 %	20 %	40 %	40 %	218557055
72	NC_011742	GCATC	2	10	128978	128987	20 %	20 %	20 %	40 %	218557055
73	NC_011742	GACTG	2	10	130296	130305	20 %	20 %	40 %	20 %	218557057
74	NC_011742	AGAGC	2	10	130706	130715	40 %	0 %	40 %	20 %	218557057
75	NC_011742	CTTCT	2	10	135967	135976	0 %	60 %	0 %	40 %	218557060
76	NC_011742	TCTGG	2	10	139334	139343	0 %	40 %	40 %	20 %	218557061
77	NC_011742	GGGCA	2	10	140745	140754	20 %	0 %	60 %	20 %	218557062
78	NC_011742	CAGCG	2	10	141024	141033	20 %	0 %	40 %	40 %	218557063
79	NC_011742	ACGAC	2	10	142304	142313	40 %	0 %	20 %	40 %	218557064
80	NC_011742	GCGCG	2	10	147063	147072	0 %	0 %	60 %	40 %	218557067
81	NC_011742	CCGTC	2	10	147854	147863	0 %	20 %	20 %	60 %	218557068
82	NC_011742	GTGAA	2	10	147864	147873	40 %	20 %	40 %	0 %	218557068
83	NC_011742	GTTCA	2	10	148251	148260	20 %	40 %	20 %	20 %	218557069
84	NC_011742	ATCCA	2	10	148577	148586	40 %	20 %	0 %	40 %	218557069
85	NC_011742	CTTTA	2	10	149840	149849	20 %	60 %	0 %	20 %	218557071
86	NC_011742	TGGTG	2	10	153681	153690	0 %	40 %	60 %	0 %	218557075
87	NC_011742	GGGAG	2	10	153705	153714	20 %	0 %	80 %	0 %	218557075
88	NC_011742	CGCCA	2	10	156482	156491	20 %	0 %	20 %	60 %	218557078
89	NC_011742	ATTTT	2	10	156655	156664	20 %	80 %	0 %	0 %	218557078
90	NC_011742	GTTGG	2	10	156776	156785	0 %	40 %	60 %	0 %	218557078
91	NC_011742	CTGTA	2	10	157393	157402	20 %	40 %	20 %	20 %	218557079
92	NC_011742	TCCTG	2	10	157553	157562	0 %	40 %	20 %	40 %	218557079
93	NC_011742	ATTTT	2	10	157985	157994	20 %	80 %	0 %	0 %	218557080
94	NC_011742	CATAA	2	10	158252	158261	60 %	20 %	0 %	20 %	218557080
95	NC_011742	TTGTT	2	10	159064	159073	0 %	80 %	20 %	0 %	218557082
96	NC_011742	TTCAA	2	10	159214	159223	40 %	40 %	0 %	20 %	218557082
97	NC_011742	GCGAG	2	10	164468	164477	20 %	0 %	60 %	20 %	218557086
98	NC_011742	TGGCG	2	10	164905	164914	0 %	20 %	60 %	20 %	218557086
99	NC_011742	ACCAC	2	10	167809	167818	40 %	0 %	0 %	60 %	218557090
100	NC_011742	GGCGT	2	10	169512	169521	0 %	20 %	60 %	20 %	218557091
101	NC_011742	CGACG	2	10	170551	170560	20 %	0 %	40 %	40 %	218557091
102	NC_011742	AAAAC	2	10	174436	174445	80 %	0 %	0 %	20 %	218557093
103	NC_011742	TGGTT	2	10	174693	174702	0 %	60 %	40 %	0 %	218557093
104	NC_011742	TGGTC	2	10	176816	176825	0 %	40 %	40 %	20 %	218557095
105	NC_011742	TGGCG	2	10	178061	178070	0 %	20 %	60 %	20 %	218557096
106	NC_011742	CGGCG	2	10	178691	178700	0 %	0 %	60 %	40 %	218557096
107	NC_011742	TTCCA	2	10	179302	179311	20 %	40 %	0 %	40 %	218557096
108	NC_011742	GACCG	2	10	179827	179836	20 %	0 %	40 %	40 %	218557097
109	NC_011742	GGTCC	2	10	183625	183634	0 %	20 %	40 %	40 %	218557101
110	NC_011742	ACGGG	2	10	185542	185551	20 %	0 %	60 %	20 %	218557103
111	NC_011742	TGCGC	2	10	187249	187258	0 %	20 %	40 %	40 %	218557104
112	NC_011742	GTGAT	2	10	187701	187710	20 %	40 %	40 %	0 %	218557104
113	NC_011742	GTGAT	2	10	187992	188001	20 %	40 %	40 %	0 %	218557104
114	NC_011742	GCCAG	2	10	191669	191678	20 %	0 %	40 %	40 %	218557108
115	NC_011742	GGCGT	2	10	192507	192516	0 %	20 %	60 %	20 %	218557108
116	NC_011742	GTTCT	2	10	193110	193119	0 %	60 %	20 %	20 %	218557108
117	NC_011742	CTGAA	2	10	195102	195111	40 %	20 %	20 %	20 %	218557110
118	NC_011742	AAGCG	2	10	195166	195175	40 %	0 %	40 %	20 %	218557110
119	NC_011742	TGGTG	2	10	196949	196958	0 %	40 %	60 %	0 %	218557112
120	NC_011742	TGCAC	2	10	197075	197084	20 %	20 %	20 %	40 %	218557112
121	NC_011742	TGCGC	2	10	197468	197477	0 %	20 %	40 %	40 %	218557112
122	NC_011742	CATGG	2	10	199169	199178	20 %	20 %	40 %	20 %	218557114
123	NC_011742	CAGAT	2	10	200208	200217	40 %	20 %	20 %	20 %	218557115
124	NC_011742	ACTTT	2	10	200341	200350	20 %	60 %	0 %	20 %	218557115
125	NC_011742	GACGT	2	10	204261	204270	20 %	20 %	40 %	20 %	218557118
126	NC_011742	ATGCC	2	10	208656	208665	20 %	20 %	20 %	40 %	218557123
127	NC_011742	TGGCC	2	10	209982	209991	0 %	20 %	40 %	40 %	218557125
128	NC_011742	ACCGC	2	10	209995	210004	20 %	0 %	20 %	60 %	218557125
129	NC_011742	GTAAC	2	10	210725	210734	40 %	20 %	20 %	20 %	218557125
130	NC_011742	AGCCG	2	10	211353	211362	20 %	0 %	40 %	40 %	218557125
131	NC_011742	GGTGG	2	10	211462	211471	0 %	20 %	80 %	0 %	218557125
132	NC_011742	ACGGT	2	10	222471	222480	20 %	20 %	40 %	20 %	218557136
133	NC_011742	AGCTC	2	10	223159	223168	20 %	20 %	20 %	40 %	218557136
134	NC_011742	TGATT	2	10	225312	225321	20 %	60 %	20 %	0 %	218557139
135	NC_011742	GTGAA	2	10	237138	237147	40 %	20 %	40 %	0 %	218557146
136	NC_011742	TAATT	2	10	237322	237331	40 %	60 %	0 %	0 %	218557146
137	NC_011742	CGCGG	2	10	241304	241313	0 %	0 %	60 %	40 %	218557151
138	NC_011742	TGATC	2	10	243790	243799	20 %	40 %	20 %	20 %	218557153
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152	NC_011742	TACCT	2	10	267512	267521	20 %	40 %	0 %	40 %	218557170
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155	NC_011742	TCAGA	2	10	268214	268223	40 %	20 %	20 %	20 %	218557171
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258	NC_011742	TGACC	2	10	433838	433847	20 %	20 %	20 %	40 %	218557318
259	NC_011742	AGTTC	2	10	434811	434820	20 %	40 %	20 %	20 %	218557320
260	NC_011742	CACTT	2	10	436384	436393	20 %	40 %	0 %	40 %	218557321
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262	NC_011742	GCGAC	2	10	437592	437601	20 %	0 %	40 %	40 %	218557323
263	NC_011742	GCGCT	2	10	440003	440012	0 %	20 %	40 %	40 %	218557326
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389	NC_011742	GCTTA	2	10	661898	661907	20 %	40 %	20 %	20 %	218557545
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