MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 12251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011742	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	218556941
3	NC_011742	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	218556941
4	NC_011742	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	218556941
5	NC_011742	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	218556942
6	NC_011742	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	218556942
7	NC_011742	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	218556942
8	NC_011742	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	218556942
9	NC_011742	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	218556943
10	NC_011742	GATG	2	8	4632	4639	25 %	25 %	50 %	0 %	218556943
11	NC_011742	AGCC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	218556943
12	NC_011742	CAGT	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	218556945
13	NC_011742	AGCG	2	8	6156	6163	25 %	0 %	50 %	25 %	218556945
14	NC_011742	ACGC	2	8	6496	6503	25 %	0 %	25 %	50 %	218556946
15	NC_011742	GCCA	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	218556946
16	NC_011742	CAGG	2	8	7186	7193	25 %	0 %	50 %	25 %	218556946
17	NC_011742	GCAT	2	8	7842	7849	25 %	25 %	25 %	25 %	218556946
18	NC_011742	GGCG	2	8	7973	7980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011742	CAAC	2	8	8221	8228	50 %	0 %	0 %	50 %	218556947
20	NC_011742	TTGA	2	8	8274	8281	25 %	50 %	25 %	0 %	218556947
21	NC_011742	CGAC	2	8	8341	8348	25 %	0 %	25 %	50 %	218556947
22	NC_011742	AAGA	2	8	8697	8704	75 %	0 %	25 %	0 %	218556947
23	NC_011742	CTGT	2	8	9126	9133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011742	AGAT	2	8	10051	10058	50 %	25 %	25 %	0 %	218556949
25	NC_011742	AGAA	2	8	10325	10332	75 %	0 %	25 %	0 %	218556949
26	NC_011742	GAAT	2	8	10572	10579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011742	GCAG	2	8	10728	10735	25 %	0 %	50 %	25 %	218556950
28	NC_011742	CATT	2	8	11406	11413	25 %	50 %	0 %	25 %	218556950
29	NC_011742	CAGT	2	8	11553	11560	25 %	25 %	25 %	25 %	218556951
30	NC_011742	AAAT	2	8	11625	11632	75 %	25 %	0 %	0 %	218556951
31	NC_011742	ATTC	2	8	11963	11970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011742	AGTG	2	8	12105	12112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011742	ATGG	2	8	12268	12275	25 %	25 %	50 %	0 %	218556952
34	NC_011742	TGGT	2	8	12359	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	218556952
35	NC_011742	ACCG	2	8	12726	12733	25 %	0 %	25 %	50 %	218556952
36	NC_011742	CAAC	2	8	12872	12879	50 %	0 %	0 %	50 %	218556952
37	NC_011742	AAGA	2	8	12946	12953	75 %	0 %	25 %	0 %	218556952
38	NC_011742	CCAT	2	8	13523	13530	25 %	25 %	0 %	50 %	218556952
39	NC_011742	GACA	2	8	15736	15743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011742	AATC	2	8	15833	15840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011742	CTTT	2	8	16528	16535	0 %	75 %	0 %	25 %	218556955
42	NC_011742	AATC	2	8	16656	16663	50 %	25 %	0 %	25 %	218556955
43	NC_011742	ACAA	2	8	16691	16698	75 %	0 %	0 %	25 %	218556955
44	NC_011742	CGGG	2	8	17245	17252	0 %	0 %	75 %	25 %	218556956
45	NC_011742	GGCT	2	8	17548	17555	0 %	25 %	50 %	25 %	218556956
46	NC_011742	CTGG	2	8	17625	17632	0 %	25 %	50 %	25 %	218556956
47	NC_011742	ATTT	2	8	17765	17772	25 %	75 %	0 %	0 %	218556956
48	NC_011742	GGAT	2	8	17979	17986	25 %	25 %	50 %	0 %	218556956
49	NC_011742	ATCG	2	8	18298	18305	25 %	25 %	25 %	25 %	218556956
50	NC_011742	AAAG	2	8	19071	19078	75 %	0 %	25 %	0 %	218556957
51	NC_011742	TTAC	2	8	19317	19324	25 %	50 %	0 %	25 %	218556957
52	NC_011742	GTTG	2	8	20333	20340	0 %	50 %	50 %	0 %	218556958
53	NC_011742	CTGG	2	8	20796	20803	0 %	25 %	50 %	25 %	218556958
54	NC_011742	CGTT	2	8	21257	21264	0 %	50 %	25 %	25 %	218556958
55	NC_011742	TTTA	2	8	21429	21436	25 %	75 %	0 %	0 %	218556959
56	NC_011742	CGAT	2	8	21798	21805	25 %	25 %	25 %	25 %	218556959
57	NC_011742	CCTG	2	8	21896	21903	0 %	25 %	25 %	50 %	218556959
58	NC_011742	CATA	2	8	22951	22958	50 %	25 %	0 %	25 %	218556962
59	NC_011742	TGCG	2	8	23207	23214	0 %	25 %	50 %	25 %	218556962
60	NC_011742	GCGT	2	8	23415	23422	0 %	25 %	50 %	25 %	218556962
61	NC_011742	CCGC	2	8	23838	23845	0 %	0 %	25 %	75 %	218556962
62	NC_011742	CTGG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	218556963
63	NC_011742	CTGC	2	8	24656	24663	0 %	25 %	25 %	50 %	218556963
64	NC_011742	TGCG	2	8	25206	25213	0 %	25 %	50 %	25 %	218556963
65	NC_011742	GCTG	2	8	26765	26772	0 %	25 %	50 %	25 %	218556964
66	NC_011742	ATGG	2	8	27645	27652	25 %	25 %	50 %	0 %	218556965
67	NC_011742	TTGA	2	8	28516	28523	25 %	50 %	25 %	0 %	218556966
68	NC_011742	TGGC	2	8	29059	29066	0 %	25 %	50 %	25 %	218556967
69	NC_011742	TGCG	2	8	29137	29144	0 %	25 %	50 %	25 %	218556967
70	NC_011742	CTGG	2	8	29519	29526	0 %	25 %	50 %	25 %	218556967
71	NC_011742	TCTG	2	8	29846	29853	0 %	50 %	25 %	25 %	218556968
72	NC_011742	ATTT	2	8	29934	29941	25 %	75 %	0 %	0 %	218556968
73	NC_011742	TCCC	2	8	30155	30162	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_011742	TGGC	2	8	30196	30203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011742	CGTG	2	8	30895	30902	0 %	25 %	50 %	25 %	218556969
76	NC_011742	CATG	2	8	31365	31372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011742	AGTG	2	8	31514	31521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011742	TCCT	2	8	31676	31683	0 %	50 %	0 %	50 %	218556970
79	NC_011742	CTTA	2	8	31704	31711	25 %	50 %	0 %	25 %	218556970
80	NC_011742	AGCC	2	8	32606	32613	25 %	0 %	25 %	50 %	218556970
81	NC_011742	GACC	2	8	32872	32879	25 %	0 %	25 %	50 %	218556971
82	NC_011742	CGCA	2	8	33872	33879	25 %	0 %	25 %	50 %	218556971
83	NC_011742	CTGT	2	8	34046	34053	0 %	50 %	25 %	25 %	218556971
84	NC_011742	GCGT	2	8	34227	34234	0 %	25 %	50 %	25 %	218556971
85	NC_011742	CGTC	2	8	34850	34857	0 %	25 %	25 %	50 %	218556971
86	NC_011742	TGGC	2	8	35313	35320	0 %	25 %	50 %	25 %	218556971
87	NC_011742	GCTG	2	8	35326	35333	0 %	25 %	50 %	25 %	218556971
88	NC_011742	GTAA	2	8	36604	36611	50 %	25 %	25 %	0 %	218556973
89	NC_011742	TATT	2	8	36713	36720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011742	GGTG	2	8	36968	36975	0 %	25 %	75 %	0 %	218556974
91	NC_011742	AAGA	2	8	37203	37210	75 %	0 %	25 %	0 %	218556974
92	NC_011742	TCAC	2	8	37569	37576	25 %	25 %	0 %	50 %	218556975
93	NC_011742	CCAT	2	8	37689	37696	25 %	25 %	0 %	50 %	218556975
94	NC_011742	CAAT	2	8	37927	37934	50 %	25 %	0 %	25 %	218556975
95	NC_011742	ATTT	2	8	38903	38910	25 %	75 %	0 %	0 %	218556976
96	NC_011742	TTCT	2	8	38915	38922	0 %	75 %	0 %	25 %	218556977
97	NC_011742	TTCA	2	8	39046	39053	25 %	50 %	0 %	25 %	218556977
98	NC_011742	AGCC	2	8	39260	39267	25 %	0 %	25 %	50 %	218556977
99	NC_011742	GCCC	2	8	39421	39428	0 %	0 %	25 %	75 %	218556977
100	NC_011742	TCGG	2	8	39894	39901	0 %	25 %	50 %	25 %	218556977
101	NC_011742	GGCG	2	8	40173	40180	0 %	0 %	75 %	25 %	218556977
102	NC_011742	GGGC	2	8	40491	40498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011742	TGAC	2	8	40514	40521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011742	CCAT	2	8	40706	40713	25 %	25 %	0 %	50 %	218556978
105	NC_011742	TGAT	2	8	40728	40735	25 %	50 %	25 %	0 %	218556978
106	NC_011742	AGGC	2	8	41259	41266	25 %	0 %	50 %	25 %	218556978
107	NC_011742	CCGA	2	8	42344	42351	25 %	0 %	25 %	50 %	218556979
108	NC_011742	CCCG	2	8	42740	42747	0 %	0 %	25 %	75 %	218556979
109	NC_011742	TCCA	2	8	42792	42799	25 %	25 %	0 %	50 %	218556979
110	NC_011742	TTAA	2	8	43045	43052	50 %	50 %	0 %	0 %	218556980
111	NC_011742	TATC	2	8	43438	43445	25 %	50 %	0 %	25 %	218556980
112	NC_011742	CACG	2	8	43528	43535	25 %	0 %	25 %	50 %	218556980
113	NC_011742	CACC	2	8	43589	43596	25 %	0 %	0 %	75 %	218556980
114	NC_011742	AGCC	2	8	44156	44163	25 %	0 %	25 %	50 %	218556980
115	NC_011742	CCAG	2	8	44356	44363	25 %	0 %	25 %	50 %	218556980
116	NC_011742	ATTT	2	8	44590	44597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011742	GTTT	2	8	44607	44614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011742	GTGC	2	8	45059	45066	0 %	25 %	50 %	25 %	218556981
119	NC_011742	TGAT	2	8	45295	45302	25 %	50 %	25 %	0 %	218556981
120	NC_011742	CTGC	2	8	45555	45562	0 %	25 %	25 %	50 %	218556981
121	NC_011742	ATGG	2	8	46528	46535	25 %	25 %	50 %	0 %	218556982
122	NC_011742	GTTA	2	8	46905	46912	25 %	50 %	25 %	0 %	218556983
123	NC_011742	CGAG	2	8	46914	46921	25 %	0 %	50 %	25 %	218556983
124	NC_011742	CACC	2	8	47456	47463	25 %	0 %	0 %	75 %	218556983
125	NC_011742	ATTG	2	8	47703	47710	25 %	50 %	25 %	0 %	218556983
126	NC_011742	TGTT	2	8	49178	49185	0 %	75 %	25 %	0 %	218556985
127	NC_011742	CTGG	2	8	49443	49450	0 %	25 %	50 %	25 %	218556985
128	NC_011742	TGCG	2	8	50648	50655	0 %	25 %	50 %	25 %	218556987
129	NC_011742	ATGA	2	8	50803	50810	50 %	25 %	25 %	0 %	218556987
130	NC_011742	GGCG	2	8	50967	50974	0 %	0 %	75 %	25 %	218556987
131	NC_011742	GGCG	2	8	51144	51151	0 %	0 %	75 %	25 %	218556987
132	NC_011742	GGAT	2	8	51758	51765	25 %	25 %	50 %	0 %	218556987
133	NC_011742	AACC	2	8	51828	51835	50 %	0 %	0 %	50 %	218556987
134	NC_011742	CAGG	2	8	51925	51932	25 %	0 %	50 %	25 %	218556987
135	NC_011742	TGGC	2	8	52191	52198	0 %	25 %	50 %	25 %	218556987
136	NC_011742	TGTT	2	8	52301	52308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011742	CCTG	2	8	52526	52533	0 %	25 %	25 %	50 %	218556988
138	NC_011742	TAAA	2	8	52564	52571	75 %	25 %	0 %	0 %	218556988
139	NC_011742	CTCA	2	8	53592	53599	25 %	25 %	0 %	50 %	218556990
140	NC_011742	GCAG	2	8	53651	53658	25 %	0 %	50 %	25 %	218556990
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