MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 72154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011742	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011742	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556940
4	NC_011742	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556940
5	NC_011742	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011742	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
7	NC_011742	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
8	NC_011742	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
9	NC_011742	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
10	NC_011742	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
11	NC_011742	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
12	NC_011742	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
13	NC_011742	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
14	NC_011742	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
15	NC_011742	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
16	NC_011742	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
17	NC_011742	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556941
18	NC_011742	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
19	NC_011742	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
20	NC_011742	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
21	NC_011742	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
22	NC_011742	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
23	NC_011742	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556941
24	NC_011742	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556941
25	NC_011742	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
26	NC_011742	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
27	NC_011742	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
28	NC_011742	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
29	NC_011742	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556941
30	NC_011742	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
31	NC_011742	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
32	NC_011742	GTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556941
33	NC_011742	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
34	NC_011742	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556941
35	NC_011742	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556941
36	NC_011742	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
37	NC_011742	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
38	NC_011742	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
39	NC_011742	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556941
40	NC_011742	CGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556941
41	NC_011742	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556941
42	NC_011742	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
43	NC_011742	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556941
44	NC_011742	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556941
45	NC_011742	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
46	NC_011742	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
47	NC_011742	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556942
48	NC_011742	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556942
49	NC_011742	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556942
50	NC_011742	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
51	NC_011742	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556942
52	NC_011742	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556942
53	NC_011742	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
54	NC_011742	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556942
55	NC_011742	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556942
56	NC_011742	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556942
57	NC_011742	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
58	NC_011742	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
59	NC_011742	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
60	NC_011742	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
61	NC_011742	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
62	NC_011742	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556943
63	NC_011742	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556943
64	NC_011742	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
65	NC_011742	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
66	NC_011742	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556943
67	NC_011742	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556943
68	NC_011742	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556943
69	NC_011742	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556943
70	NC_011742	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
71	NC_011742	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556943
72	NC_011742	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556943
73	NC_011742	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556943
74	NC_011742	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556943
75	NC_011742	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011742	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011742	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556944
78	NC_011742	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556944
79	NC_011742	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556944
80	NC_011742	CGC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556944
81	NC_011742	ATC	2	6	5483	5488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
82	NC_011742	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
83	NC_011742	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556944
84	NC_011742	GCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
85	NC_011742	GGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218556945
86	NC_011742	TCA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556945
87	NC_011742	AAG	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556945
88	NC_011742	AAT	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556945
89	NC_011742	TCA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556945
90	NC_011742	TTC	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556945
91	NC_011742	TTC	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556945
92	NC_011742	CAC	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556945
93	NC_011742	TGC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
94	NC_011742	TTG	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556945
95	NC_011742	TGA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556945
96	NC_011742	GCT	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556945
97	NC_011742	GTG	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556945
98	NC_011742	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556946
99	NC_011742	GCC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
100	NC_011742	GTT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556946
101	NC_011742	AGA	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556946
102	NC_011742	ATC	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556946
103	NC_011742	CGC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
104	NC_011742	GCC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556946
105	NC_011742	CAG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556946
106	NC_011742	AAT	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556946
107	NC_011742	AGA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556946
108	NC_011742	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556946
109	NC_011742	CAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556946
110	NC_011742	TAA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556946
111	NC_011742	AAG	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011742	CGG	2	6	8037	8042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011742	CGT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011742	ATC	2	6	8066	8071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011742	ACC	2	6	8157	8162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556947
116	NC_011742	CAG	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
117	NC_011742	CAG	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
118	NC_011742	TGC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
119	NC_011742	AAG	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556947
120	NC_011742	CTG	2	6	8592	8597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
121	NC_011742	TTG	2	6	8656	8661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556947
122	NC_011742	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556947
123	NC_011742	TAC	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556947
124	NC_011742	CTG	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
125	NC_011742	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556947
126	NC_011742	CTG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556947
127	NC_011742	TGA	2	6	9190	9195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556948
128	NC_011742	GCG	2	6	9241	9246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556948
129	NC_011742	GAA	2	6	9276	9281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556948
130	NC_011742	ATC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556948
131	NC_011742	TGG	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556948
132	NC_011742	CAC	2	6	9404	9409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556948
133	NC_011742	CGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556948
134	NC_011742	GCA	2	6	9735	9740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556948
135	NC_011742	TGA	2	6	9809	9814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011742	TCT	2	6	9859	9864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_011742	AAT	2	6	10585	10590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011742	ATA	2	6	10626	10631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_011742	TCA	2	6	10944	10949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556950
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165	NC_011742	TGG	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_011742	TAT	2	6	15762	15767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_011742	AGG	2	6	17189	17194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218556956
257	NC_011742	ACT	2	6	17210	17215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556956
258	NC_011742	TTA	2	6	17254	17259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556956
259	NC_011742	ATG	2	6	17383	17388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556956
260	NC_011742	GGC	2	6	17410	17415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556956
261	NC_011742	CGG	2	6	17474	17479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556956
262	NC_011742	GTC	2	6	17617	17622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556956
263	NC_011742	TTC	2	6	17656	17661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556956
264	NC_011742	AGC	2	6	17753	17758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556956
265	NC_011742	GTG	2	6	17801	17806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556956
266	NC_011742	GAA	2	6	17884	17889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556956
267	NC_011742	ATT	2	6	18037	18042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556956
268	NC_011742	ATG	2	6	18124	18129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556956
269	NC_011742	GAT	2	6	18247	18252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556956
270	NC_011742	GAT	2	6	18291	18296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556956
271	NC_011742	AAT	2	6	18307	18312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556956
272	NC_011742	ATA	2	6	18503	18508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011742	TTG	2	6	18644	18649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556957
274	NC_011742	AGA	2	6	18879	18884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556957
275	NC_011742	CAT	2	6	18894	18899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556957
276	NC_011742	GAG	2	6	18946	18951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218556957
277	NC_011742	TGA	2	6	18964	18969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556957
278	NC_011742	CTT	2	6	19011	19016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556957
279	NC_011742	AGA	2	6	19178	19183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556957
280	NC_011742	GGT	2	6	19196	19201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556957
281	NC_011742	CAT	2	6	19296	19301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556957
282	NC_011742	GCG	2	6	19328	19333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556957
283	NC_011742	TTC	2	6	19408	19413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218556957
284	NC_011742	CAA	2	6	19463	19468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556957
285	NC_011742	GGC	2	6	19506	19511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556957
286	NC_011742	GCA	2	6	19529	19534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556957
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288	NC_011742	CCA	2	6	19591	19596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556957
289	NC_011742	ATT	2	6	19613	19618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556957
290	NC_011742	GTG	2	6	19624	19629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556957
291	NC_011742	AAT	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556957
292	NC_011742	ATT	2	6	19669	19674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556957
293	NC_011742	ATT	2	6	19880	19885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556957
294	NC_011742	AAT	2	6	19895	19900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011742	TTC	2	6	19901	19906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_011742	TCA	2	6	19947	19952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_011742	GCC	2	6	19953	19958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_011742	GAT	2	6	20056	20061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_011742	ATT	2	6	20160	20165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556958
300	NC_011742	ATT	2	6	20169	20174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556958
301	NC_011742	GAT	2	6	20189	20194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556958
302	NC_011742	CAA	2	6	20279	20284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556958
303	NC_011742	TGC	2	6	20290	20295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556958
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332	NC_011742	CAT	2	6	22522	22527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556960
333	NC_011742	CTT	2	6	22669	22674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_011742	GCA	2	6	22792	22797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556961
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343	NC_011742	CAG	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556962
344	NC_011742	CCG	2	6	23433	23438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556962
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373	NC_011742	CTG	2	6	25901	25906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
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377	NC_011742	TGA	2	6	26230	26235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
378	NC_011742	GGC	2	6	26414	26419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556963
379	NC_011742	GGC	2	6	26461	26466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556963
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500	NC_011742	GTG	2	6	35384	35389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556971

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