MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 3074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218552587
2	NC_011741	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218552588
3	NC_011741	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	218552593
4	NC_011741	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	218552594
5	NC_011741	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	218552596
6	NC_011741	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011741	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	218552601
8	NC_011741	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	218552601
9	NC_011741	GTTTT	2	10	19297	19306	0 %	80 %	20 %	0 %	218552604
10	NC_011741	ATTGC	2	10	21675	21684	20 %	40 %	20 %	20 %	218552606
11	NC_011741	TTAAT	2	10	22310	22319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011741	ATTTA	2	10	31142	31151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011741	GCGAA	2	10	34380	34389	40 %	0 %	40 %	20 %	218552617
14	NC_011741	CCGTT	2	10	35274	35283	0 %	40 %	20 %	40 %	218552617
15	NC_011741	CACGG	2	10	35651	35660	20 %	0 %	40 %	40 %	218552617
16	NC_011741	CGAAT	2	10	38360	38369	40 %	20 %	20 %	20 %	218552622
17	NC_011741	CCATG	2	10	39898	39907	20 %	20 %	20 %	40 %	218552623
18	NC_011741	CCGTA	2	10	41544	41553	20 %	20 %	20 %	40 %	218552624
19	NC_011741	TTAAA	2	10	42282	42291	60 %	40 %	0 %	0 %	218552624
20	NC_011741	ACCCA	2	10	43025	43034	40 %	0 %	0 %	60 %	218552625
21	NC_011741	TTTGA	2	10	44652	44661	20 %	60 %	20 %	0 %	218552626
22	NC_011741	CGGCG	2	10	44903	44912	0 %	0 %	60 %	40 %	218552626
23	NC_011741	AATCA	2	10	45185	45194	60 %	20 %	0 %	20 %	218552627
24	NC_011741	CGGTT	2	10	46140	46149	0 %	40 %	40 %	20 %	218552628
25	NC_011741	TGGCG	2	10	47831	47840	0 %	20 %	60 %	20 %	218552630
26	NC_011741	TGCAC	2	10	49593	49602	20 %	20 %	20 %	40 %	218552631
27	NC_011741	AGGGC	2	10	50678	50687	20 %	0 %	60 %	20 %	218552632
28	NC_011741	GGCGC	2	10	50712	50721	0 %	0 %	60 %	40 %	218552632
29	NC_011741	GAAAC	2	10	51525	51534	60 %	0 %	20 %	20 %	218552632
30	NC_011741	AACGT	2	10	53437	53446	40 %	20 %	20 %	20 %	218552635
31	NC_011741	GCGTC	2	10	56421	56430	0 %	20 %	40 %	40 %	218552638
32	NC_011741	ATGTT	2	10	57235	57244	20 %	60 %	20 %	0 %	218552639
33	NC_011741	CTTCG	2	10	57668	57677	0 %	40 %	20 %	40 %	218552639
34	NC_011741	TGCGT	2	10	57954	57963	0 %	40 %	40 %	20 %	218552639
35	NC_011741	AAAGT	2	10	63688	63697	60 %	20 %	20 %	0 %	218552642
36	NC_011741	AGTCG	2	10	64657	64666	20 %	20 %	40 %	20 %	218552643
37	NC_011741	GGTGA	2	10	65936	65945	20 %	20 %	60 %	0 %	218552643
38	NC_011741	TCGCG	2	10	68543	68552	0 %	20 %	40 %	40 %	218552645
39	NC_011741	TAGTG	2	10	76021	76030	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011741	GATGG	2	10	76909	76918	20 %	20 %	60 %	0 %	218552652
41	NC_011741	ATTTT	2	10	77737	77746	20 %	80 %	0 %	0 %	218552653
42	NC_011741	CTGGA	2	10	78809	78818	20 %	20 %	40 %	20 %	218552654
43	NC_011741	CCTGG	2	10	80383	80392	0 %	20 %	40 %	40 %	218552656
44	NC_011741	CTGGT	2	10	82102	82111	0 %	40 %	40 %	20 %	218552657
45	NC_011741	GACCG	2	10	82650	82659	20 %	0 %	40 %	40 %	218552658
46	NC_011741	ATGTT	2	10	85199	85208	20 %	60 %	20 %	0 %	218552660
47	NC_011741	TGCAT	2	10	86141	86150	20 %	40 %	20 %	20 %	218552661
48	NC_011741	ATTCC	2	10	86311	86320	20 %	40 %	0 %	40 %	218552661
49	NC_011741	AGTTC	2	10	91404	91413	20 %	40 %	20 %	20 %	218552665
50	NC_011741	CGTGG	2	10	92777	92786	0 %	20 %	60 %	20 %	218552667
51	NC_011741	TATCG	2	10	93284	93293	20 %	40 %	20 %	20 %	218552667
52	NC_011741	GCCTG	2	10	97616	97625	0 %	20 %	40 %	40 %	218552671
53	NC_011741	GTTTG	2	10	98060	98069	0 %	60 %	40 %	0 %	218552671
54	NC_011741	ACCGT	2	10	99529	99538	20 %	20 %	20 %	40 %	218552672
55	NC_011741	ATCAG	2	10	101302	101311	40 %	20 %	20 %	20 %	218552674
56	NC_011741	AGCCG	2	10	103070	103079	20 %	0 %	40 %	40 %	218552675
57	NC_011741	GCGCA	2	10	105398	105407	20 %	0 %	40 %	40 %	218552677
58	NC_011741	TGGCG	2	10	106392	106401	0 %	20 %	60 %	20 %	218552678
59	NC_011741	CCGGC	2	10	109362	109371	0 %	0 %	40 %	60 %	218552681
60	NC_011741	CGCGG	2	10	112571	112580	0 %	0 %	60 %	40 %	218552683
61	NC_011741	ATCCC	2	10	114815	114824	20 %	20 %	0 %	60 %	218552686
62	NC_011741	CATCG	2	10	114828	114837	20 %	20 %	20 %	40 %	218552686
63	NC_011741	TAACG	2	10	115522	115531	40 %	20 %	20 %	20 %	218552686
64	NC_011741	ATGCC	2	10	115981	115990	20 %	20 %	20 %	40 %	218552686
65	NC_011741	AATGC	2	10	117264	117273	40 %	20 %	20 %	20 %	218552687
66	NC_011741	TCTGT	2	10	118210	118219	0 %	60 %	20 %	20 %	218552689
67	NC_011741	GCATG	2	10	119303	119312	20 %	20 %	40 %	20 %	218552690
68	NC_011741	AGCAG	2	10	120641	120650	40 %	0 %	40 %	20 %	218552692
69	NC_011741	TCAGC	2	10	121509	121518	20 %	20 %	20 %	40 %	218552692
70	NC_011741	CGAAG	2	10	122556	122565	40 %	0 %	40 %	20 %	218552693
71	NC_011741	ACACG	2	10	122689	122698	40 %	0 %	20 %	40 %	218552693
72	NC_011741	TCGCG	2	10	122950	122959	0 %	20 %	40 %	40 %	218552693
73	NC_011741	GCATC	2	10	123040	123049	20 %	20 %	20 %	40 %	218552693
74	NC_011741	GACTG	2	10	124358	124367	20 %	20 %	40 %	20 %	218552695
75	NC_011741	AGAGC	2	10	124768	124777	40 %	0 %	40 %	20 %	218552695
76	NC_011741	AGGCG	2	10	130040	130049	20 %	0 %	60 %	20 %	218552698
77	NC_011741	GGTTG	2	10	130697	130706	0 %	40 %	60 %	0 %	218552698
78	NC_011741	TCTGG	2	10	133343	133352	0 %	40 %	40 %	20 %	218552699
79	NC_011741	GGGCA	2	10	134755	134764	20 %	0 %	60 %	20 %	218552700
80	NC_011741	CAGCG	2	10	135034	135043	20 %	0 %	40 %	40 %	218552701
81	NC_011741	GGCTG	2	10	137745	137754	0 %	20 %	60 %	20 %	218552704
82	NC_011741	CCGTC	2	10	142019	142028	0 %	20 %	20 %	60 %	218552706
83	NC_011741	GTGAA	2	10	142029	142038	40 %	20 %	40 %	0 %	218552706
84	NC_011741	GGCAT	2	10	142191	142200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011741	GTTCA	2	10	142416	142425	20 %	40 %	20 %	20 %	218552707
86	NC_011741	ATCCA	2	10	142742	142751	40 %	20 %	0 %	40 %	218552707
87	NC_011741	GTAAG	2	10	142955	142964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011741	CTTTA	2	10	144005	144014	20 %	60 %	0 %	20 %	218552709
89	NC_011741	TGGCG	2	10	144232	144241	0 %	20 %	60 %	20 %	218552709
90	NC_011741	TCCTC	2	10	144675	144684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_011741	CGGGC	2	10	145420	145429	0 %	0 %	60 %	40 %	218552711
92	NC_011741	TTTCA	2	10	146545	146554	20 %	60 %	0 %	20 %	218552712
93	NC_011741	GGGAG	2	10	147870	147879	20 %	0 %	80 %	0 %	218552713
94	NC_011741	TGAAG	2	10	149768	149777	40 %	20 %	40 %	0 %	218552715
95	NC_011741	ACCGC	2	10	149873	149882	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_011741	GCGGT	2	10	149892	149901	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011741	TTTGC	2	10	156858	156867	0 %	60 %	20 %	20 %	218552722
98	NC_011741	AAATT	2	10	157299	157308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011741	GCGAG	2	10	158666	158675	20 %	0 %	60 %	20 %	218552724
100	NC_011741	GGCGT	2	10	159104	159113	0 %	20 %	60 %	20 %	218552724
101	NC_011741	ATCAG	2	10	159742	159751	40 %	20 %	20 %	20 %	218552725
102	NC_011741	ACCAC	2	10	162007	162016	40 %	0 %	0 %	60 %	218552728
103	NC_011741	GGCGT	2	10	163710	163719	0 %	20 %	60 %	20 %	218552729
104	NC_011741	CGACG	2	10	164749	164758	20 %	0 %	40 %	40 %	218552729
105	NC_011741	TTATC	2	10	167661	167670	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011741	AAAAC	2	10	168736	168745	80 %	0 %	0 %	20 %	218552731
107	NC_011741	TGGTT	2	10	168993	169002	0 %	60 %	40 %	0 %	218552731
108	NC_011741	AACCT	2	10	171074	171083	40 %	20 %	0 %	40 %	218552733
109	NC_011741	TGGTC	2	10	171116	171125	0 %	40 %	40 %	20 %	218552733
110	NC_011741	TGGCG	2	10	172361	172370	0 %	20 %	60 %	20 %	218552734
111	NC_011741	CGGCG	2	10	172991	173000	0 %	0 %	60 %	40 %	218552734
112	NC_011741	CGGCG	2	10	173072	173081	0 %	0 %	60 %	40 %	218552734
113	NC_011741	TTCCA	2	10	173602	173611	20 %	40 %	0 %	40 %	218552734
114	NC_011741	GGTCC	2	10	177925	177934	0 %	20 %	40 %	40 %	218552739
115	NC_011741	ACGGG	2	10	179842	179851	20 %	0 %	60 %	20 %	218552741
116	NC_011741	GTGAT	2	10	182001	182010	20 %	40 %	40 %	0 %	218552742
117	NC_011741	GTGAT	2	10	182292	182301	20 %	40 %	40 %	0 %	218552742
118	NC_011741	TACGT	2	10	182537	182546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011741	TGGCC	2	10	184262	184271	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011741	GCCAG	2	10	186011	186020	20 %	0 %	40 %	40 %	218552746
121	NC_011741	GTTCT	2	10	187452	187461	0 %	60 %	20 %	20 %	218552746
122	NC_011741	CTGAA	2	10	189444	189453	40 %	20 %	20 %	20 %	218552749
123	NC_011741	AAGCG	2	10	189508	189517	40 %	0 %	40 %	20 %	218552749
124	NC_011741	TGGTG	2	10	191414	191423	0 %	40 %	60 %	0 %	218552751
125	NC_011741	TGCAC	2	10	191540	191549	20 %	20 %	20 %	40 %	218552751
126	NC_011741	TGCGC	2	10	191933	191942	0 %	20 %	40 %	40 %	218552751
127	NC_011741	AAATA	2	10	192155	192164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011741	GTCTG	2	10	192240	192249	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011741	CATGG	2	10	193776	193785	20 %	20 %	40 %	20 %	218552753
130	NC_011741	CAGAT	2	10	194815	194824	40 %	20 %	20 %	20 %	218552754
131	NC_011741	ACTTT	2	10	194948	194957	20 %	60 %	0 %	20 %	218552754
132	NC_011741	GACGT	2	10	198868	198877	20 %	20 %	40 %	20 %	218552758
133	NC_011741	CGACG	2	10	200695	200704	20 %	0 %	40 %	40 %	218552760
134	NC_011741	ATGCC	2	10	203263	203272	20 %	20 %	20 %	40 %	218552763
135	NC_011741	GGATG	2	10	203525	203534	20 %	20 %	60 %	0 %	218552763
136	NC_011741	TGGCC	2	10	204589	204598	0 %	20 %	40 %	40 %	218552765
137	NC_011741	GTAAC	2	10	205332	205341	40 %	20 %	20 %	20 %	218552765
138	NC_011741	AGCCG	2	10	205960	205969	20 %	0 %	40 %	40 %	218552765
139	NC_011741	GGTGG	2	10	206069	206078	0 %	20 %	80 %	0 %	218552765
140	NC_011741	TTAAC	2	10	214212	214221	40 %	40 %	0 %	20 %	218552772
141	NC_011741	TGCGC	2	10	215424	215433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011741	ACGGT	2	10	217079	217088	20 %	20 %	40 %	20 %	218552775
143	NC_011741	TGATT	2	10	219921	219930	20 %	60 %	20 %	0 %	218552778
144	NC_011741	CGGTT	2	10	222884	222893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011741	GTGAA	2	10	231750	231759	40 %	20 %	40 %	0 %	218552785
146	NC_011741	TAATT	2	10	231934	231943	40 %	60 %	0 %	0 %	218552785
147	NC_011741	ACTTA	2	10	233904	233913	40 %	40 %	0 %	20 %	218552787
148	NC_011741	ACTGG	2	10	234872	234881	20 %	20 %	40 %	20 %	218552788
149	NC_011741	CGCGG	2	10	235917	235926	0 %	0 %	60 %	40 %	218552790
150	NC_011741	TTTAA	2	10	238293	238302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011741	TGATC	2	10	239648	239657	20 %	40 %	20 %	20 %	218552793
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153	NC_011741	CCAGA	2	10	241422	241431	40 %	0 %	20 %	40 %	218552795
154	NC_011741	ATCGC	2	10	243790	243799	20 %	20 %	20 %	40 %	218552795
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156	NC_011741	GCGCA	2	10	248184	248193	20 %	0 %	40 %	40 %	218552798
157	NC_011741	GGGCA	2	10	250930	250939	20 %	0 %	60 %	20 %	218552800
158	NC_011741	ATTTC	2	10	251440	251449	20 %	60 %	0 %	20 %	218552800
159	NC_011741	CCAGC	2	10	253672	253681	20 %	0 %	20 %	60 %	218552803
160	NC_011741	CCAGG	2	10	254329	254338	20 %	0 %	40 %	40 %	218552803
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162	NC_011741	ACCGG	2	10	256779	256788	20 %	0 %	40 %	40 %	218552805
163	NC_011741	AAAAT	2	10	259309	259318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011741	TTTGT	2	10	259550	259559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011741	ACTGT	2	10	260578	260587	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_011741	AAGGC	2	10	262591	262600	40 %	0 %	40 %	20 %	218552811
167	NC_011741	GCCCG	2	10	263055	263064	0 %	0 %	40 %	60 %	218552812
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174	NC_011741	GAAGA	2	10	269814	269823	60 %	0 %	40 %	0 %	218552816
175	NC_011741	GCCCG	2	10	270773	270782	0 %	0 %	40 %	60 %	218552818
176	NC_011741	CGGGG	2	10	271002	271011	0 %	0 %	80 %	20 %	218552818
177	NC_011741	ACGGT	2	10	271989	271998	20 %	20 %	40 %	20 %	218552818
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179	NC_011741	TGACC	2	10	272639	272648	20 %	20 %	20 %	40 %	218552818
180	NC_011741	GGTGT	2	10	273885	273894	0 %	40 %	60 %	0 %	218552818
181	NC_011741	AGCAA	2	10	274778	274787	60 %	0 %	20 %	20 %	218552818
182	NC_011741	GGGCA	2	10	275343	275352	20 %	0 %	60 %	20 %	218552820
183	NC_011741	AAAAG	2	10	275822	275831	80 %	0 %	20 %	0 %	218552821
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193	NC_011741	GATGC	2	10	295674	295683	20 %	20 %	40 %	20 %	218552843
194	NC_011741	TCGCG	2	10	295859	295868	0 %	20 %	40 %	40 %	218552843
195	NC_011741	TGCTT	2	10	298059	298068	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_011741	GTGAT	2	10	298877	298886	20 %	40 %	40 %	0 %	218552846
197	NC_011741	TCGCT	2	10	299650	299659	0 %	40 %	20 %	40 %	218552847
198	NC_011741	GTCGG	2	10	303211	303220	0 %	20 %	60 %	20 %	218552850
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201	NC_011741	TTCGC	2	10	304426	304435	0 %	40 %	20 %	40 %	218552851
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205	NC_011741	TGTTA	2	10	316241	316250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
206	NC_011741	GCGTG	2	10	317871	317880	0 %	20 %	60 %	20 %	218552862
207	NC_011741	AGCAA	2	10	318962	318971	60 %	0 %	20 %	20 %	218552862
208	NC_011741	AGATC	2	10	319312	319321	40 %	20 %	20 %	20 %	218552862
209	NC_011741	TACCG	2	10	322440	322449	20 %	20 %	20 %	40 %	218552863
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212	NC_011741	ATGTT	2	10	329833	329842	20 %	60 %	20 %	0 %	218552870
213	NC_011741	AATGC	2	10	329983	329992	40 %	20 %	20 %	20 %	218552870
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221	NC_011741	ATTTT	2	10	337557	337566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_011741	TCTGA	2	10	341956	341965	20 %	40 %	20 %	20 %	218552877
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246	NC_011741	TTGCG	2	10	380874	380883	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
247	NC_011741	TTTTC	2	10	380987	380996	0 %	80 %	0 %	20 %	218552911
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259	NC_011741	GACCG	2	10	398693	398702	20 %	0 %	40 %	40 %	218552928
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262	NC_011741	GTTGA	2	10	409192	409201	20 %	40 %	40 %	0 %	218552937
263	NC_011741	AAATC	2	10	409670	409679	60 %	20 %	0 %	20 %	218552938
264	NC_011741	CTTCT	2	10	410781	410790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_011741	GATGG	2	10	414613	414622	20 %	20 %	60 %	0 %	218552946
266	NC_011741	CGCTG	2	10	414930	414939	0 %	20 %	40 %	40 %	218552946
267	NC_011741	GCAAC	2	10	416180	416189	40 %	0 %	20 %	40 %	218552947
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379	NC_011741	GTCAG	2	10	612206	612215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
380	NC_011741	GTTTT	2	10	613481	613490	0 %	80 %	20 %	0 %	218553126
381	NC_011741	CGCCA	2	10	614952	614961	20 %	0 %	20 %	60 %	218553126
382	NC_011741	GCAGT	2	10	615431	615440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
383	NC_011741	GGGAT	2	10	616028	616037	20 %	20 %	60 %	0 %	218553127
384	NC_011741	CCGGT	2	10	618104	618113	0 %	20 %	40 %	40 %	218553129
385	NC_011741	GTACC	2	10	619494	619503	20 %	20 %	20 %	40 %	218553129
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391	NC_011741	ATTTG	2	10	626779	626788	20 %	60 %	20 %	0 %	218553135
392	NC_011741	CATTC	2	10	628908	628917	20 %	40 %	0 %	40 %	218553137
393	NC_011741	TGAAC	2	10	629232	629241	40 %	20 %	20 %	20 %	218553137
394	NC_011741	GATCT	2	10	630145	630154	20 %	40 %	20 %	20 %	218553137
395	NC_011741	AGATC	2	10	630198	630207	40 %	20 %	20 %	20 %	218553137
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