MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 67410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011741	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011741	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
4	NC_011741	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
5	NC_011741	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011741	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
7	NC_011741	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
8	NC_011741	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
9	NC_011741	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
10	NC_011741	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
11	NC_011741	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
12	NC_011741	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
13	NC_011741	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
14	NC_011741	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
15	NC_011741	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
16	NC_011741	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
17	NC_011741	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
18	NC_011741	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
19	NC_011741	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
20	NC_011741	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
21	NC_011741	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
22	NC_011741	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
23	NC_011741	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
24	NC_011741	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
25	NC_011741	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
26	NC_011741	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
27	NC_011741	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
28	NC_011741	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
29	NC_011741	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
30	NC_011741	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
31	NC_011741	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552587
32	NC_011741	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
33	NC_011741	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
34	NC_011741	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
35	NC_011741	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
36	NC_011741	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
37	NC_011741	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
38	NC_011741	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
39	NC_011741	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
40	NC_011741	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
41	NC_011741	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
42	NC_011741	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
43	NC_011741	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
44	NC_011741	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552587
45	NC_011741	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
46	NC_011741	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
47	NC_011741	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552587
48	NC_011741	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
49	NC_011741	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
50	NC_011741	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
51	NC_011741	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552588
52	NC_011741	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
53	NC_011741	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552588
54	NC_011741	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
55	NC_011741	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
56	NC_011741	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552588
57	NC_011741	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552588
58	NC_011741	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
59	NC_011741	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552588
60	NC_011741	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
61	NC_011741	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
62	NC_011741	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
63	NC_011741	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
64	NC_011741	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
65	NC_011741	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
66	NC_011741	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
67	NC_011741	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
68	NC_011741	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
69	NC_011741	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
70	NC_011741	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
71	NC_011741	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552589
72	NC_011741	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552589
73	NC_011741	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552589
74	NC_011741	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
75	NC_011741	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
76	NC_011741	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
77	NC_011741	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
78	NC_011741	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
79	NC_011741	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
80	NC_011741	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011741	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011741	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011741	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552590
84	NC_011741	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552590
85	NC_011741	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552590
86	NC_011741	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
87	NC_011741	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
88	NC_011741	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552590
89	NC_011741	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218552590
90	NC_011741	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552590
91	NC_011741	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552590
92	NC_011741	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011741	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
94	NC_011741	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218552591
95	NC_011741	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
96	NC_011741	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552591
97	NC_011741	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552591
98	NC_011741	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
99	NC_011741	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
100	NC_011741	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
101	NC_011741	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552591
102	NC_011741	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
103	NC_011741	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552591
104	NC_011741	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552591
105	NC_011741	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
106	NC_011741	TGG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552591
107	NC_011741	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
108	NC_011741	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
109	NC_011741	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552592
110	NC_011741	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552592
111	NC_011741	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
112	NC_011741	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552592
113	NC_011741	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
114	NC_011741	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
115	NC_011741	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552592
116	NC_011741	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
117	NC_011741	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552592
118	NC_011741	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552592
119	NC_011741	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
120	NC_011741	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011741	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011741	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011741	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011741	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552593
125	NC_011741	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
126	NC_011741	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
127	NC_011741	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
128	NC_011741	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
129	NC_011741	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
130	NC_011741	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552593
131	NC_011741	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
132	NC_011741	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552593
133	NC_011741	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
134	NC_011741	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
135	NC_011741	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
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152	NC_011741	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011741	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011741	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_011741	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_011741	CAT	2	6	16639	16644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552601
257	NC_011741	ATC	2	6	16646	16651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552601
258	NC_011741	CGC	2	6	16745	16750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552601
259	NC_011741	CTT	2	6	16840	16845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552601
260	NC_011741	ATC	2	6	17012	17017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552601
261	NC_011741	CTG	2	6	17059	17064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552601
262	NC_011741	CGG	2	6	17253	17258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552601
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264	NC_011741	ATT	2	6	17517	17522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552602
265	NC_011741	CGC	2	6	17709	17714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552602
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277	NC_011741	ATT	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552603
278	NC_011741	ATT	2	6	18363	18368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552603
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289	NC_011741	CGG	2	6	19130	19135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552603
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296	NC_011741	AAC	2	6	19665	19670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_011741	ACC	2	6	19782	19787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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299	NC_011741	CCA	2	6	19819	19824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_011741	TAT	2	6	19863	19868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011741	ATT	2	6	19914	19919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011741	TTG	3	9	19920	19928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_011741	GTT	2	6	20628	20633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_011741	ATT	2	6	20779	20784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_011741	GCA	2	6	24524	24529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552610
381	NC_011741	CCG	3	9	24692	24700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552610
382	NC_011741	CAT	2	6	24831	24836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552610
383	NC_011741	ATC	2	6	24853	24858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552610
384	NC_011741	TGC	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552610
385	NC_011741	GAC	2	6	25360	25365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552610
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387	NC_011741	GCT	2	6	25494	25499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552610
388	NC_011741	TGC	2	6	25517	25522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552610
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391	NC_011741	ATC	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552610
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412	NC_011741	TGG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552611
413	NC_011741	GCA	2	6	27229	27234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552611
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422	NC_011741	CGA	2	6	27794	27799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552612
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461	NC_011741	ATA	2	6	31402	31407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_011741	CAT	2	6	33412	33417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552617
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498	NC_011741	TTC	2	6	33646	33651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552617
499	NC_011741	GGC	2	6	33694	33699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552617
500	NC_011741	CGA	2	6	33724	33729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552617

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