MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 60510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
2	NC_011741	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
3	NC_011741	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
4	NC_011741	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
5	NC_011741	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
6	NC_011741	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
7	NC_011741	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
8	NC_011741	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
9	NC_011741	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
10	NC_011741	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
11	NC_011741	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
12	NC_011741	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
13	NC_011741	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
14	NC_011741	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
15	NC_011741	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
16	NC_011741	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
17	NC_011741	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
18	NC_011741	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
19	NC_011741	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
20	NC_011741	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
21	NC_011741	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
22	NC_011741	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
23	NC_011741	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
24	NC_011741	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
25	NC_011741	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
26	NC_011741	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
27	NC_011741	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
28	NC_011741	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552587
29	NC_011741	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
30	NC_011741	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
31	NC_011741	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
32	NC_011741	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
33	NC_011741	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
34	NC_011741	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
35	NC_011741	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
36	NC_011741	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
37	NC_011741	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
38	NC_011741	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
39	NC_011741	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
40	NC_011741	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
41	NC_011741	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552587
42	NC_011741	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
43	NC_011741	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
44	NC_011741	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552587
45	NC_011741	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
46	NC_011741	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
47	NC_011741	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
48	NC_011741	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552588
49	NC_011741	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
50	NC_011741	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552588
51	NC_011741	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
52	NC_011741	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
53	NC_011741	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552588
54	NC_011741	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552588
55	NC_011741	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
56	NC_011741	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552588
57	NC_011741	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
58	NC_011741	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
59	NC_011741	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
60	NC_011741	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
61	NC_011741	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
62	NC_011741	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
63	NC_011741	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
64	NC_011741	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
65	NC_011741	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
66	NC_011741	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
67	NC_011741	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
68	NC_011741	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552589
69	NC_011741	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552589
70	NC_011741	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552589
71	NC_011741	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
72	NC_011741	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
73	NC_011741	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
74	NC_011741	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
75	NC_011741	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
76	NC_011741	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
77	NC_011741	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552590
78	NC_011741	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552590
79	NC_011741	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552590
80	NC_011741	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
81	NC_011741	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
82	NC_011741	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552590
83	NC_011741	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218552590
84	NC_011741	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552590
85	NC_011741	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552590
86	NC_011741	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
87	NC_011741	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218552591
88	NC_011741	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
89	NC_011741	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552591
90	NC_011741	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552591
91	NC_011741	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
92	NC_011741	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
93	NC_011741	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
94	NC_011741	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552591
95	NC_011741	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
96	NC_011741	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552591
97	NC_011741	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552591
98	NC_011741	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
99	NC_011741	TGG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552591
100	NC_011741	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
101	NC_011741	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
102	NC_011741	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552592
103	NC_011741	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552592
104	NC_011741	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
105	NC_011741	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552592
106	NC_011741	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
107	NC_011741	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552592
108	NC_011741	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552592
109	NC_011741	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
110	NC_011741	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552592
111	NC_011741	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552592
112	NC_011741	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
113	NC_011741	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552593
114	NC_011741	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
115	NC_011741	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
116	NC_011741	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
117	NC_011741	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
118	NC_011741	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
119	NC_011741	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552593
120	NC_011741	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552593
121	NC_011741	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552593
122	NC_011741	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
123	NC_011741	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
124	NC_011741	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
125	NC_011741	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552594
126	NC_011741	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552594
127	NC_011741	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552594
128	NC_011741	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552594
129	NC_011741	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552594
130	NC_011741	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552594
131	NC_011741	GCA	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552594
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254	NC_011741	ATT	2	6	18669	18674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552603
255	NC_011741	TAT	2	6	18794	18799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552603
256	NC_011741	AAC	2	6	18829	18834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552603
257	NC_011741	TCT	2	6	18934	18939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552603
258	NC_011741	TAA	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552603
259	NC_011741	GAC	2	6	19013	19018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552603
260	NC_011741	GTC	2	6	19075	19080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552603
261	NC_011741	CGG	2	6	19130	19135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552603
262	NC_011741	GTT	2	6	19181	19186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552603
263	NC_011741	TAA	2	6	19251	19256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552603
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268	NC_011741	ATA	2	6	20287	20292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552605
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271	NC_011741	TGA	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552606
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275	NC_011741	ATG	2	6	21188	21193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552606
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278	NC_011741	ATA	2	6	21306	21311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552606
279	NC_011741	TAT	2	6	21434	21439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552606
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283	NC_011741	ATT	2	6	21634	21639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552606
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287	NC_011741	TCA	2	6	21964	21969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552606
288	NC_011741	TGA	2	6	22090	22095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552606
289	NC_011741	TCA	2	6	22138	22143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552606
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291	NC_011741	CTA	2	6	22226	22231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552606
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362	NC_011741	GCG	2	6	27942	27947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552612
363	NC_011741	CCG	2	6	27986	27991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552612
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