MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011740	GATGC	2	10	21810	21819	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011740	ACATC	2	10	59778	59787	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011740	TAGTG	2	10	89944	89953	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011740	TTATA	2	10	94708	94717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011740	GTGTT	2	10	143420	143429	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011740	GTAAG	2	10	164421	164430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011740	TCCTC	2	10	166141	166150	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011740	AATTT	2	10	178927	178936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011740	AAATT	2	10	179076	179085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011740	GTCTG	2	10	214317	214326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011740	CGGTT	2	10	244941	244950	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011740	TTTAT	2	10	280500	280509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011740	AGTGA	2	10	283872	283881	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011740	CCATG	2	10	312805	312814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011740	AACAC	2	10	312829	312838	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011740	ACCTT	2	10	313492	313501	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011740	ATAAA	2	10	317887	317896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011740	TTTTC	2	10	320991	321000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011740	GCTTT	2	10	342269	342278	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011740	AATTT	2	10	375877	375886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011740	CTTAT	2	10	388297	388306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011740	AGTAA	2	10	392107	392116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011740	AGAAA	2	10	395519	395528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011740	AGGTA	2	10	414306	414315	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011740	CGCAG	2	10	415634	415643	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011740	CTAAA	2	10	417140	417149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011740	GGCCG	2	10	437054	437063	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011740	ATTTT	2	10	437255	437264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011740	TGATT	2	10	461738	461747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011740	ACAGT	2	10	475412	475421	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011740	TTTTC	2	10	478720	478729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011740	AAGCG	2	10	481675	481684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011740	CAAAT	2	10	496440	496449	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011740	AGCAT	2	10	501179	501188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011740	TTTGG	2	10	501526	501535	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011740	TTTAC	2	10	511003	511012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011740	TATTT	2	10	520201	520210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011740	TATTT	2	10	521934	521943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011740	GAAAT	2	10	529851	529860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011740	TATGA	2	10	580125	580134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011740	GATGC	2	10	583537	583546	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011740	AGGGG	2	10	607507	607516	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011740	TAATG	2	10	629168	629177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011740	AGATA	2	10	629804	629813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011740	ACCAG	2	10	649373	649382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011740	CAGGG	2	10	650465	650474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011740	TTTTA	2	10	657807	657816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011740	CTGAT	2	10	659864	659873	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011740	TATTT	2	10	667262	667271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011740	GAATA	2	10	667362	667371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011740	TGTTT	2	10	670717	670726	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011740	AAGAA	2	10	685511	685520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011740	ACGGC	2	10	713274	713283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011740	GAGGT	2	10	714364	714373	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011740	TGATA	2	10	716457	716466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011740	AAAGT	2	10	735495	735504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011740	TATCG	2	10	756755	756764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011740	TTTCA	2	10	756807	756816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011740	TATTT	2	10	765117	765126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011740	ATTTT	2	10	782095	782104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011740	GCATG	2	10	788869	788878	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011740	GCATG	2	10	788984	788993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011740	TTTCG	2	10	808675	808684	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011740	TGTTA	2	10	810690	810699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011740	CGCTT	2	10	824065	824074	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011740	TGAAA	2	10	833096	833105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011740	CAATT	2	10	842250	842259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011740	AGGGC	2	10	865002	865011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011740	GACAG	2	10	872062	872071	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011740	TAAAA	2	10	884643	884652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011740	ACGCT	2	10	910197	910206	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011740	AATAC	2	10	911665	911674	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011740	ATTTT	2	10	913648	913657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011740	GATAT	2	10	913873	913882	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011740	CCATT	2	10	925643	925652	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011740	ATTTT	2	10	933536	933545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011740	GTTCA	2	10	963196	963205	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011740	AGAGA	2	10	965439	965448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011740	TGTTC	2	10	978339	978348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011740	GAGAG	2	10	982821	982830	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011740	GTTAA	2	10	983532	983541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011740	TTAAA	2	10	983555	983564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011740	TATAT	2	10	987571	987580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011740	CAGGG	2	10	1010155	1010164	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011740	TTTTC	2	10	1021012	1021021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011740	TGTGC	2	10	1056374	1056383	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011740	TATTT	2	10	1114578	1114587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011740	TTGTT	2	10	1124839	1124848	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011740	ATGAC	2	10	1127919	1127928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011740	TTTTC	2	10	1135805	1135814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011740	TTATT	2	10	1136612	1136621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011740	CTTTT	2	10	1151979	1151988	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011740	TCCAC	2	10	1161642	1161651	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_011740	ATTTG	2	10	1163470	1163479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011740	TCACT	2	10	1194675	1194684	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011740	AAAAT	2	10	1196333	1196342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011740	TCATT	2	10	1268668	1268677	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011740	CAAAA	2	10	1286640	1286649	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011740	TTGTT	2	10	1293123	1293132	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011740	GTATG	2	10	1309324	1309333	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011740	AATCG	2	10	1318475	1318484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011740	ATTAA	2	10	1368945	1368954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011740	TCGTT	2	10	1381157	1381166	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011740	AAATT	2	10	1383686	1383695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011740	GAGAA	2	10	1384835	1384844	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011740	GAAAA	2	10	1399605	1399614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011740	AACTC	2	10	1404648	1404657	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011740	CTAAA	2	10	1427507	1427516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011740	TGGAA	2	10	1449447	1449456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011740	CAACC	2	10	1457319	1457328	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_011740	TTAAT	2	10	1474440	1474449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011740	TCTGT	2	10	1493975	1493984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011740	AATTT	2	10	1500851	1500860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011740	AAGCG	2	10	1509271	1509280	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011740	AGTTT	2	10	1511946	1511955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011740	TTTTA	2	10	1518519	1518528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011740	GTCCA	2	10	1533789	1533798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_011740	AATTT	2	10	1534370	1534379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011740	ATAAA	2	10	1547065	1547074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011740	CTGTT	2	10	1548324	1548333	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011740	ACGGC	2	10	1550019	1550028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011740	CGCTA	2	10	1566649	1566658	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011740	GGGCA	2	10	1599895	1599904	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011740	TTGAA	2	10	1601874	1601883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011740	CCCTT	2	10	1604951	1604960	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_011740	TGTGT	2	10	1618389	1618398	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011740	GCCCT	2	10	1640823	1640832	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_011740	CTAGT	2	10	1676739	1676748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011740	TTTAA	2	10	1691432	1691441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011740	TTGTT	2	10	1723100	1723109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011740	CATCT	2	10	1731828	1731837	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011740	CAAAT	2	10	1733292	1733301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011740	ACTTA	2	10	1734877	1734886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011740	CTGGC	2	10	1735903	1735912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011740	TTGCA	2	10	1747031	1747040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011740	GATAA	2	10	1788359	1788368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011740	TAAGC	2	10	1794149	1794158	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011740	CAAAA	2	10	1820110	1820119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011740	CATTT	2	10	1820280	1820289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011740	TTTAT	2	10	1821916	1821925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011740	TTATT	2	10	1840215	1840224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011740	TGATT	2	10	1841954	1841963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011740	CTGCC	2	10	1842775	1842784	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_011740	TATTT	2	10	1863918	1863927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011740	AATCC	2	10	1863989	1863998	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011740	TTCGC	2	10	1865486	1865495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_011740	GCGAC	2	10	1894360	1894369	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_011740	CTTGT	2	10	1932114	1932123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_011740	TTGCA	2	10	1937647	1937656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_011740	AAGCG	2	10	1940747	1940756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_011740	ATTAC	2	10	1969910	1969919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_011740	TTTAC	2	10	1986277	1986286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_011740	TAAAA	2	10	1994913	1994922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011740	CTGCG	2	10	2000665	2000674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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163	NC_011740	CTGCC	2	10	2029289	2029298	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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169	NC_011740	CCATT	2	10	2060019	2060028	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_011740	ATACA	2	10	2140097	2140106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_011740	CAAAT	2	10	2140371	2140380	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_011740	CTTTT	2	10	2211251	2211260	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_011740	TGCGC	2	10	3142734	3142743	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_011740	TAAGA	2	10	3152809	3152818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011740	ACTAA	2	10	3178965	3178974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_011740	CGCCC	2	10	3273531	3273540	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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274	NC_011740	CCACT	2	10	3386808	3386817	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
275	NC_011740	AAGTG	2	10	3393327	3393336	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_011740	CCTGA	2	10	3467610	3467619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
279	NC_011740	CCTTT	2	10	3469229	3469238	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_011740	ACATG	2	10	3494815	3494824	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_011740	TGCCA	2	10	3516876	3516885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_011740	TGTCG	2	10	3580174	3580183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_011740	CAACA	2	10	3594520	3594529	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_011740	CTGTG	2	10	3611327	3611336	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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290	NC_011740	ACCCT	2	10	3677178	3677187	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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292	NC_011740	GATAA	2	10	3691953	3691962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_011740	CTGAT	2	10	4567212	4567221	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.