MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p2ESCUM

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011739	GTTTG	2	10	307	316	0 %	60 %	40 %	0 %	218454960
2	NC_011739	TCCTG	2	10	1070	1079	0 %	40 %	20 %	40 %	218454960
3	NC_011739	TGGCT	2	10	1374	1383	0 %	40 %	40 %	20 %	218454961
4	NC_011739	GATTA	2	10	2650	2659	40 %	40 %	20 %	0 %	218454963
5	NC_011739	CTTTT	2	10	7767	7776	0 %	80 %	0 %	20 %	218454972
6	NC_011739	TTTCT	2	10	8205	8214	0 %	80 %	0 %	20 %	218454972
7	NC_011739	TGAAC	2	10	8623	8632	40 %	20 %	20 %	20 %	218454972
8	NC_011739	GCTTT	2	10	8754	8763	0 %	60 %	20 %	20 %	218454972
9	NC_011739	TTCAG	2	10	12286	12295	20 %	40 %	20 %	20 %	218454978
10	NC_011739	TCTTT	2	10	12531	12540	0 %	80 %	0 %	20 %	218454978
11	NC_011739	ATTTT	2	10	17318	17327	20 %	80 %	0 %	0 %	218454983
12	NC_011739	AAAAC	2	10	17446	17455	80 %	0 %	0 %	20 %	218454984
13	NC_011739	CGATA	2	10	18366	18375	40 %	20 %	20 %	20 %	218454985
14	NC_011739	TTTTC	2	10	22630	22639	0 %	80 %	0 %	20 %	218454989
15	NC_011739	TTCTG	2	10	26156	26165	0 %	60 %	20 %	20 %	218454994
16	NC_011739	ACATA	2	10	27327	27336	60 %	20 %	0 %	20 %	218454995
17	NC_011739	TATTT	2	10	29140	29149	20 %	80 %	0 %	0 %	218455000
18	NC_011739	CATTT	2	10	29681	29690	20 %	60 %	0 %	20 %	218455001
19	NC_011739	CCTGC	2	10	29698	29707	0 %	20 %	20 %	60 %	218455001
20	NC_011739	ATTTT	2	10	30139	30148	20 %	80 %	0 %	0 %	218455003
21	NC_011739	ACCAG	2	10	31489	31498	40 %	0 %	20 %	40 %	218455006
22	NC_011739	GGTCT	2	10	32999	33008	0 %	40 %	40 %	20 %	218455008

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.