MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	AACTAG	2	12	30162	30173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011738	AAAGGG	2	12	33152	33163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011738	TAGGAT	2	12	41943	41954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011738	GGAAAA	2	12	45410	45421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011738	AAGAAA	2	12	45542	45553	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011738	TTAGAT	2	12	63291	63302	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011738	CGCTAA	2	12	82871	82882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011738	TTTAGA	2	12	83618	83629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011738	TAAAAA	2	12	97953	97964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011738	GCACCC	2	12	113218	113229	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011738	ATTGGG	2	12	131655	131666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	CTTTTC	2	12	204643	204654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011738	AGATAG	2	12	219737	219748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	TATTAA	2	12	238852	238863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011738	GTAAGA	2	12	243086	243097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011738	TCAACC	2	12	249382	249393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011738	TTCTTG	2	12	281971	281982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011738	TTTTGC	2	12	282329	282340	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011738	ATTTTT	2	12	322263	322274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011738	TAGTAA	2	12	325072	325083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011738	TTTCAC	2	12	328494	328505	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.