MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	CTAT	2	8	226	233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011738	AGTT	2	8	280	287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011738	ATTG	2	8	340	347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011738	CAAA	2	8	1667	1674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011738	ATCC	2	8	2061	2068	25 %	25 %	0 %	50 %	218442614
6	NC_011738	CGAT	2	8	3774	3781	25 %	25 %	25 %	25 %	218442614
7	NC_011738	GGAG	2	8	3832	3839	25 %	0 %	75 %	0 %	218442614
8	NC_011738	TTTG	2	8	4035	4042	0 %	75 %	25 %	0 %	218442614
9	NC_011738	CCAA	2	8	4527	4534	50 %	0 %	0 %	50 %	218442614
10	NC_011738	TGAA	2	8	5169	5176	50 %	25 %	25 %	0 %	218442614
11	NC_011738	TAAT	2	8	5274	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	TTAC	2	8	5465	5472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011738	AATT	2	8	5740	5747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	AGCG	2	8	6081	6088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011738	TTAA	2	8	6305	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	218442616
16	NC_011738	TTGA	2	8	6738	6745	25 %	50 %	25 %	0 %	218442616
17	NC_011738	AATT	2	8	7445	7452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011738	TAAA	2	8	7667	7674	75 %	25 %	0 %	0 %	218442617
19	NC_011738	AAAG	2	8	7944	7951	75 %	0 %	25 %	0 %	218442617
20	NC_011738	AGTA	2	8	8192	8199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011738	ATTA	2	8	8348	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011738	AATT	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	218442618
23	NC_011738	TCGA	2	8	8888	8895	25 %	25 %	25 %	25 %	218442618
24	NC_011738	AATA	2	8	10026	10033	75 %	25 %	0 %	0 %	218442618
25	NC_011738	TAGA	2	8	10223	10230	50 %	25 %	25 %	0 %	218442618
26	NC_011738	AGCC	2	8	11619	11626	25 %	0 %	25 %	50 %	218442618
27	NC_011738	GTCT	2	8	11696	11703	0 %	50 %	25 %	25 %	218442618
28	NC_011738	AATC	2	8	11803	11810	50 %	25 %	0 %	25 %	218442618
29	NC_011738	CCAA	2	8	12446	12453	50 %	0 %	0 %	50 %	218442619
30	NC_011738	ATTA	2	8	12523	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011738	TAGC	2	8	12780	12787	25 %	25 %	25 %	25 %	218442620
32	NC_011738	AGCG	2	8	13345	13352	25 %	0 %	50 %	25 %	218442621
33	NC_011738	AATT	2	8	13925	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011738	AGCG	2	8	14457	14464	25 %	0 %	50 %	25 %	218442622
35	NC_011738	CTTG	2	8	14521	14528	0 %	50 %	25 %	25 %	218442622
36	NC_011738	AGTT	2	8	15207	15214	25 %	50 %	25 %	0 %	218442622
37	NC_011738	TGTT	2	8	15219	15226	0 %	75 %	25 %	0 %	218442622
38	NC_011738	ATGA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011738	TAAA	2	8	16533	16540	75 %	25 %	0 %	0 %	218442623
40	NC_011738	GATC	2	8	17032	17039	25 %	25 %	25 %	25 %	218442624
41	NC_011738	CGTT	2	8	17426	17433	0 %	50 %	25 %	25 %	218442625
42	NC_011738	GAAG	2	8	17889	17896	50 %	0 %	50 %	0 %	218442625
43	NC_011738	TCAA	2	8	18202	18209	50 %	25 %	0 %	25 %	218442625
44	NC_011738	TGCT	2	8	18986	18993	0 %	50 %	25 %	25 %	218442626
45	NC_011738	AGCT	2	8	19054	19061	25 %	25 %	25 %	25 %	218442626
46	NC_011738	TCAA	2	8	19557	19564	50 %	25 %	0 %	25 %	218442626
47	NC_011738	AATT	2	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	218442626
48	NC_011738	AATT	2	8	20536	20543	50 %	50 %	0 %	0 %	218442626
49	NC_011738	AAAT	2	8	21017	21024	75 %	25 %	0 %	0 %	218442626
50	NC_011738	GAAG	2	8	21080	21087	50 %	0 %	50 %	0 %	218442626
51	NC_011738	GGAA	2	8	21270	21277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011738	TAAT	2	8	21310	21317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011738	AATC	2	8	21423	21430	50 %	25 %	0 %	25 %	218442627
54	NC_011738	TTTA	2	8	21812	21819	25 %	75 %	0 %	0 %	218442627
55	NC_011738	ACTT	2	8	21859	21866	25 %	50 %	0 %	25 %	218442627
56	NC_011738	GAAA	2	8	21941	21948	75 %	0 %	25 %	0 %	218442627
57	NC_011738	AAAC	2	8	22137	22144	75 %	0 %	0 %	25 %	218442627
58	NC_011738	CTAT	2	8	22244	22251	25 %	50 %	0 %	25 %	218442627
59	NC_011738	ATTT	2	8	23165	23172	25 %	75 %	0 %	0 %	218442628
60	NC_011738	ATTA	2	8	23199	23206	50 %	50 %	0 %	0 %	218442628
61	NC_011738	ATTA	2	8	23709	23716	50 %	50 %	0 %	0 %	218442628
62	NC_011738	GATT	2	8	23819	23826	25 %	50 %	25 %	0 %	218442628
63	NC_011738	AAAT	2	8	24099	24106	75 %	25 %	0 %	0 %	218442628
64	NC_011738	GATT	2	8	24902	24909	25 %	50 %	25 %	0 %	218442628
65	NC_011738	GAAA	2	8	25201	25208	75 %	0 %	25 %	0 %	218442629
66	NC_011738	CTGA	2	8	25265	25272	25 %	25 %	25 %	25 %	218442629
67	NC_011738	CTTC	2	8	25352	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	218442629
68	NC_011738	TTAA	2	8	25493	25500	50 %	50 %	0 %	0 %	218442629
69	NC_011738	ATTT	2	8	25939	25946	25 %	75 %	0 %	0 %	218442630
70	NC_011738	CAAG	2	8	26174	26181	50 %	0 %	25 %	25 %	218442630
71	NC_011738	AATT	2	8	26635	26642	50 %	50 %	0 %	0 %	218442630
72	NC_011738	TCAG	2	8	27008	27015	25 %	25 %	25 %	25 %	218442630
73	NC_011738	CTTT	2	8	27144	27151	0 %	75 %	0 %	25 %	218442630
74	NC_011738	GATT	2	8	27169	27176	25 %	50 %	25 %	0 %	218442630
75	NC_011738	CTTT	2	8	27760	27767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011738	CTCC	2	8	27847	27854	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_011738	TTGA	2	8	27914	27921	25 %	50 %	25 %	0 %	218442631
78	NC_011738	ATAA	2	8	29032	29039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011738	TTGA	2	8	29517	29524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011738	CTTC	2	8	29594	29601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011738	TCTT	2	8	29625	29632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011738	AACT	2	8	29940	29947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011738	ATCT	2	8	30267	30274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011738	GATA	2	8	30931	30938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011738	GAAT	2	8	31048	31055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011738	CAAT	2	8	31323	31330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011738	GAGG	2	8	32896	32903	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011738	GAAA	2	8	33511	33518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011738	AGCG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011738	TTAA	2	8	34115	34122	50 %	50 %	0 %	0 %	218442633
91	NC_011738	TTGA	2	8	34548	34555	25 %	50 %	25 %	0 %	218442633
92	NC_011738	AATT	2	8	35255	35262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011738	TCAT	2	8	35512	35519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011738	AACC	2	8	35655	35662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011738	TAAC	2	8	35689	35696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011738	AGAA	2	8	35706	35713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011738	TTGA	2	8	35931	35938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011738	GGAG	2	8	36578	36585	25 %	0 %	75 %	0 %	218442634
99	NC_011738	AGCG	2	8	36587	36594	25 %	0 %	50 %	25 %	218442634
100	NC_011738	TCGG	2	8	36797	36804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011738	TGTC	2	8	37950	37957	0 %	50 %	25 %	25 %	218442636
102	NC_011738	TTTA	2	8	37959	37966	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
103	NC_011738	GAAA	2	8	38222	38229	75 %	0 %	25 %	0 %	218442636
104	NC_011738	TTTA	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
105	NC_011738	ATTT	2	8	38469	38476	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
106	NC_011738	TAAA	2	8	38631	38638	75 %	25 %	0 %	0 %	218442636
107	NC_011738	TAAA	2	8	39316	39323	75 %	25 %	0 %	0 %	218442637
108	NC_011738	AATC	2	8	39486	39493	50 %	25 %	0 %	25 %	218442637
109	NC_011738	ACCC	2	8	39542	39549	25 %	0 %	0 %	75 %	218442637
110	NC_011738	AAAG	2	8	39657	39664	75 %	0 %	25 %	0 %	218442637
111	NC_011738	ATTA	2	8	39670	39677	50 %	50 %	0 %	0 %	218442637
112	NC_011738	TTCC	2	8	41455	41462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011738	ACAA	2	8	41893	41900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011738	TAAA	2	8	42309	42316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011738	CTGA	2	8	43118	43125	25 %	25 %	25 %	25 %	218442640
116	NC_011738	GGAA	2	8	43281	43288	50 %	0 %	50 %	0 %	218442640
117	NC_011738	AAAC	2	8	43588	43595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011738	TCAA	2	8	44015	44022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011738	AAAG	2	8	44142	44149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011738	ATTT	2	8	44176	44183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011738	AAAG	2	8	44207	44214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011738	ATTC	2	8	44382	44389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011738	TAAG	2	8	44404	44411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011738	TCTG	2	8	45158	45165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011738	GAAA	2	8	45225	45232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011738	TAAT	2	8	45739	45746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011738	TAGT	2	8	45772	45779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011738	TGGT	2	8	45833	45840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011738	AGTA	2	8	46589	46596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011738	TCTG	2	8	46645	46652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011738	ATTA	2	8	47274	47281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011738	AATT	2	8	47528	47535	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
133	NC_011738	TTGA	2	8	47788	47795	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
134	NC_011738	TATT	2	8	47921	47928	25 %	75 %	0 %	0 %	218442642
135	NC_011738	TCAA	2	8	48300	48307	50 %	25 %	0 %	25 %	218442642
136	NC_011738	TGAT	2	8	48695	48702	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
137	NC_011738	AATT	2	8	48815	48822	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
138	NC_011738	CTCA	2	8	49552	49559	25 %	25 %	0 %	50 %	218442643
139	NC_011738	TCTG	2	8	49627	49634	0 %	50 %	25 %	25 %	218442643
140	NC_011738	CCTT	2	8	50350	50357	0 %	50 %	0 %	50 %	218442644
141	NC_011738	AAAC	2	8	50641	50648	75 %	0 %	0 %	25 %	218442645
142	NC_011738	GTTA	2	8	50998	51005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011738	TTAA	2	8	51389	51396	50 %	50 %	0 %	0 %	218442646
144	NC_011738	AATA	2	8	52047	52054	75 %	25 %	0 %	0 %	218442647
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146	NC_011738	AATT	2	8	53120	53127	50 %	50 %	0 %	0 %	218442647
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