MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	CTAT	2	8	226	233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011738	AGTT	2	8	280	287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011738	ATTG	2	8	340	347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011738	CAAA	2	8	1667	1674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011738	TAAT	2	8	5274	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011738	TTAC	2	8	5465	5472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011738	AATT	2	8	5740	5747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011738	AGCG	2	8	6081	6088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011738	AATT	2	8	7445	7452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011738	AGTA	2	8	8192	8199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011738	ATTA	2	8	8348	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	ATTA	2	8	12523	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011738	AATT	2	8	13925	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	ATGA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011738	GGAA	2	8	21270	21277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011738	TAAT	2	8	21310	21317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011738	CTTT	2	8	27760	27767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011738	CTCC	2	8	27847	27854	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011738	ATAA	2	8	29032	29039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011738	TTGA	2	8	29517	29524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011738	CTTC	2	8	29594	29601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011738	TCTT	2	8	29625	29632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011738	AACT	2	8	29940	29947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011738	ATCT	2	8	30267	30274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011738	GATA	2	8	30931	30938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011738	GAAT	2	8	31048	31055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011738	CAAT	2	8	31323	31330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011738	GAGG	2	8	32896	32903	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011738	GAAA	2	8	33511	33518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011738	AGCG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011738	AATT	2	8	35255	35262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011738	TCAT	2	8	35512	35519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011738	AACC	2	8	35655	35662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011738	TAAC	2	8	35689	35696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011738	AGAA	2	8	35706	35713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011738	TTGA	2	8	35931	35938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011738	TCGG	2	8	36797	36804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011738	TTCC	2	8	41455	41462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011738	ACAA	2	8	41893	41900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011738	TAAA	2	8	42309	42316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011738	AAAC	2	8	43588	43595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011738	TCAA	2	8	44015	44022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011738	AAAG	2	8	44142	44149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011738	ATTT	2	8	44176	44183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011738	AAAG	2	8	44207	44214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011738	ATTC	2	8	44382	44389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011738	TAAG	2	8	44404	44411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011738	TCTG	2	8	45158	45165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011738	GAAA	2	8	45225	45232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011738	TAAT	2	8	45739	45746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011738	TAGT	2	8	45772	45779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011738	TGGT	2	8	45833	45840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011738	AGTA	2	8	46589	46596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011738	TCTG	2	8	46645	46652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011738	ATTA	2	8	47274	47281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011738	GTTA	2	8	50998	51005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011738	CTTT	2	8	53243	53250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011738	AAAT	2	8	53369	53376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011738	ATTA	2	8	53381	53388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011738	GTTT	2	8	54590	54597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011738	ATTT	2	8	54725	54732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011738	ATTT	2	8	54854	54861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011738	GTAG	2	8	55935	55942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011738	TTAA	2	8	56809	56816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011738	AAGC	2	8	56908	56915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011738	CAAA	2	8	57309	57316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011738	TCAA	2	8	58245	58252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011738	GTTT	2	8	64287	64294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011738	ATAA	2	8	66303	66310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011738	ATTA	2	8	66961	66968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011738	TAAT	2	8	66984	66991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011738	TAAA	2	8	71472	71479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011738	CTAG	2	8	73515	73522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011738	ATTA	2	8	75897	75904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011738	GAAA	2	8	76121	76128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011738	ATTA	3	12	76148	76159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011738	ATCT	2	8	82461	82468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011738	AATC	2	8	82947	82954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011738	AAAT	2	8	83050	83057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011738	TTAA	2	8	83429	83436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011738	ATTA	2	8	83811	83818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011738	ATTT	2	8	84299	84306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011738	CCGA	2	8	84308	84315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011738	GAAA	3	12	86458	86469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011738	CATC	2	8	86580	86587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011738	AAAT	2	8	86660	86667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011738	ACAG	2	8	87762	87769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011738	GCCC	2	8	91954	91961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_011738	TAGA	2	8	92293	92300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011738	AGTG	2	8	92412	92419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011738	AATT	2	8	92429	92436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011738	ATTA	3	12	96918	96929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011738	AGAT	2	8	97986	97993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011738	AGTA	2	8	98346	98353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011738	AATA	2	8	98360	98367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011738	ATTA	2	8	100676	100683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011738	TAAT	2	8	100699	100706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011738	AAAG	2	8	103583	103590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011738	CTCA	2	8	103615	103622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011738	AGAA	2	8	103679	103686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011738	TAAA	2	8	104551	104558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011738	CAAA	2	8	107976	107983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011738	CTTT	2	8	113144	113151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011738	GTTC	2	8	113479	113486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011738	TAAA	2	8	114019	114026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011738	AGGC	2	8	114043	114050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011738	AGTT	2	8	115572	115579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011738	GATA	2	8	120815	120822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011738	TAAA	2	8	121833	121840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011738	CTTT	2	8	121854	121861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011738	AAAC	2	8	121912	121919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011738	CTAC	2	8	122012	122019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011738	AATT	2	8	122027	122034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011738	TTAA	2	8	131501	131508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011738	ACTT	2	8	133075	133082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011738	ATTT	2	8	137624	137631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011738	TCTT	2	8	137776	137783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011738	TTTA	2	8	179373	179380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011738	TAAA	2	8	185489	185496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011738	TAGA	2	8	186606	186613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011738	CATT	2	8	186658	186665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011738	AAAG	2	8	187072	187079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011738	ATCA	2	8	187180	187187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011738	TTTA	2	8	187665	187672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011738	AATT	2	8	188084	188091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011738	ATTA	2	8	188278	188285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011738	TAAT	2	8	188301	188308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011738	AGAC	2	8	188966	188973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011738	CTTA	2	8	189356	189363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011738	GATT	2	8	194490	194497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011738	GTAA	2	8	199198	199205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011738	TTAA	2	8	199235	199242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011738	ATTT	2	8	204715	204722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011738	ATTT	2	8	209176	209183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011738	ATAA	2	8	223337	223344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011738	AAAT	2	8	223502	223509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011738	GAAA	2	8	223559	223566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011738	GAAA	2	8	223573	223580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011738	TAGT	2	8	225319	225326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011738	TGGT	2	8	225380	225387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011738	ATAA	2	8	227049	227056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011738	AAAG	2	8	227222	227229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011738	ATCA	2	8	227330	227337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011738	AATT	2	8	227497	227504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011738	TTTA	2	8	229381	229388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011738	TGAG	2	8	237755	237762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011738	ACTA	2	8	238550	238557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011738	AGTC	2	8	239095	239102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011738	ACCA	2	8	239234	239241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011738	ACTA	2	8	239295	239302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011738	ATGA	2	8	240513	240520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011738	TCTA	2	8	240648	240655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011738	GTAA	2	8	240711	240718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011738	ATCA	2	8	240870	240877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.