MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	ATCC	2	8	2061	2068	25 %	25 %	0 %	50 %	218442614
2	NC_011738	CGAT	2	8	3774	3781	25 %	25 %	25 %	25 %	218442614
3	NC_011738	GGAG	2	8	3832	3839	25 %	0 %	75 %	0 %	218442614
4	NC_011738	TTTG	2	8	4035	4042	0 %	75 %	25 %	0 %	218442614
5	NC_011738	CCAA	2	8	4527	4534	50 %	0 %	0 %	50 %	218442614
6	NC_011738	TGAA	2	8	5169	5176	50 %	25 %	25 %	0 %	218442614
7	NC_011738	TTAA	2	8	6305	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	218442616
8	NC_011738	TTGA	2	8	6738	6745	25 %	50 %	25 %	0 %	218442616
9	NC_011738	TAAA	2	8	7667	7674	75 %	25 %	0 %	0 %	218442617
10	NC_011738	AAAG	2	8	7944	7951	75 %	0 %	25 %	0 %	218442617
11	NC_011738	AATT	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	218442618
12	NC_011738	TCGA	2	8	8888	8895	25 %	25 %	25 %	25 %	218442618
13	NC_011738	AATA	2	8	10026	10033	75 %	25 %	0 %	0 %	218442618
14	NC_011738	TAGA	2	8	10223	10230	50 %	25 %	25 %	0 %	218442618
15	NC_011738	AGCC	2	8	11619	11626	25 %	0 %	25 %	50 %	218442618
16	NC_011738	GTCT	2	8	11696	11703	0 %	50 %	25 %	25 %	218442618
17	NC_011738	AATC	2	8	11803	11810	50 %	25 %	0 %	25 %	218442618
18	NC_011738	CCAA	2	8	12446	12453	50 %	0 %	0 %	50 %	218442619
19	NC_011738	TAGC	2	8	12780	12787	25 %	25 %	25 %	25 %	218442620
20	NC_011738	AGCG	2	8	13345	13352	25 %	0 %	50 %	25 %	218442621
21	NC_011738	AGCG	2	8	14457	14464	25 %	0 %	50 %	25 %	218442622
22	NC_011738	CTTG	2	8	14521	14528	0 %	50 %	25 %	25 %	218442622
23	NC_011738	AGTT	2	8	15207	15214	25 %	50 %	25 %	0 %	218442622
24	NC_011738	TGTT	2	8	15219	15226	0 %	75 %	25 %	0 %	218442622
25	NC_011738	TAAA	2	8	16533	16540	75 %	25 %	0 %	0 %	218442623
26	NC_011738	GATC	2	8	17032	17039	25 %	25 %	25 %	25 %	218442624
27	NC_011738	CGTT	2	8	17426	17433	0 %	50 %	25 %	25 %	218442625
28	NC_011738	GAAG	2	8	17889	17896	50 %	0 %	50 %	0 %	218442625
29	NC_011738	TCAA	2	8	18202	18209	50 %	25 %	0 %	25 %	218442625
30	NC_011738	TGCT	2	8	18986	18993	0 %	50 %	25 %	25 %	218442626
31	NC_011738	AGCT	2	8	19054	19061	25 %	25 %	25 %	25 %	218442626
32	NC_011738	TCAA	2	8	19557	19564	50 %	25 %	0 %	25 %	218442626
33	NC_011738	AATT	2	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	218442626
34	NC_011738	AATT	2	8	20536	20543	50 %	50 %	0 %	0 %	218442626
35	NC_011738	AAAT	2	8	21017	21024	75 %	25 %	0 %	0 %	218442626
36	NC_011738	GAAG	2	8	21080	21087	50 %	0 %	50 %	0 %	218442626
37	NC_011738	AATC	2	8	21423	21430	50 %	25 %	0 %	25 %	218442627
38	NC_011738	TTTA	2	8	21812	21819	25 %	75 %	0 %	0 %	218442627
39	NC_011738	ACTT	2	8	21859	21866	25 %	50 %	0 %	25 %	218442627
40	NC_011738	GAAA	2	8	21941	21948	75 %	0 %	25 %	0 %	218442627
41	NC_011738	AAAC	2	8	22137	22144	75 %	0 %	0 %	25 %	218442627
42	NC_011738	CTAT	2	8	22244	22251	25 %	50 %	0 %	25 %	218442627
43	NC_011738	ATTT	2	8	23165	23172	25 %	75 %	0 %	0 %	218442628
44	NC_011738	ATTA	2	8	23199	23206	50 %	50 %	0 %	0 %	218442628
45	NC_011738	ATTA	2	8	23709	23716	50 %	50 %	0 %	0 %	218442628
46	NC_011738	GATT	2	8	23819	23826	25 %	50 %	25 %	0 %	218442628
47	NC_011738	AAAT	2	8	24099	24106	75 %	25 %	0 %	0 %	218442628
48	NC_011738	GATT	2	8	24902	24909	25 %	50 %	25 %	0 %	218442628
49	NC_011738	GAAA	2	8	25201	25208	75 %	0 %	25 %	0 %	218442629
50	NC_011738	CTGA	2	8	25265	25272	25 %	25 %	25 %	25 %	218442629
51	NC_011738	CTTC	2	8	25352	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	218442629
52	NC_011738	TTAA	2	8	25493	25500	50 %	50 %	0 %	0 %	218442629
53	NC_011738	ATTT	2	8	25939	25946	25 %	75 %	0 %	0 %	218442630
54	NC_011738	CAAG	2	8	26174	26181	50 %	0 %	25 %	25 %	218442630
55	NC_011738	AATT	2	8	26635	26642	50 %	50 %	0 %	0 %	218442630
56	NC_011738	TCAG	2	8	27008	27015	25 %	25 %	25 %	25 %	218442630
57	NC_011738	CTTT	2	8	27144	27151	0 %	75 %	0 %	25 %	218442630
58	NC_011738	GATT	2	8	27169	27176	25 %	50 %	25 %	0 %	218442630
59	NC_011738	TTGA	2	8	27914	27921	25 %	50 %	25 %	0 %	218442631
60	NC_011738	TTAA	2	8	34115	34122	50 %	50 %	0 %	0 %	218442633
61	NC_011738	TTGA	2	8	34548	34555	25 %	50 %	25 %	0 %	218442633
62	NC_011738	GGAG	2	8	36578	36585	25 %	0 %	75 %	0 %	218442634
63	NC_011738	AGCG	2	8	36587	36594	25 %	0 %	50 %	25 %	218442634
64	NC_011738	TGTC	2	8	37950	37957	0 %	50 %	25 %	25 %	218442636
65	NC_011738	TTTA	2	8	37959	37966	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
66	NC_011738	GAAA	2	8	38222	38229	75 %	0 %	25 %	0 %	218442636
67	NC_011738	TTTA	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
68	NC_011738	ATTT	2	8	38469	38476	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
69	NC_011738	TAAA	2	8	38631	38638	75 %	25 %	0 %	0 %	218442636
70	NC_011738	TAAA	2	8	39316	39323	75 %	25 %	0 %	0 %	218442637
71	NC_011738	AATC	2	8	39486	39493	50 %	25 %	0 %	25 %	218442637
72	NC_011738	ACCC	2	8	39542	39549	25 %	0 %	0 %	75 %	218442637
73	NC_011738	AAAG	2	8	39657	39664	75 %	0 %	25 %	0 %	218442637
74	NC_011738	ATTA	2	8	39670	39677	50 %	50 %	0 %	0 %	218442637
75	NC_011738	CTGA	2	8	43118	43125	25 %	25 %	25 %	25 %	218442640
76	NC_011738	GGAA	2	8	43281	43288	50 %	0 %	50 %	0 %	218442640
77	NC_011738	AATT	2	8	47528	47535	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
78	NC_011738	TTGA	2	8	47788	47795	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
79	NC_011738	TATT	2	8	47921	47928	25 %	75 %	0 %	0 %	218442642
80	NC_011738	TCAA	2	8	48300	48307	50 %	25 %	0 %	25 %	218442642
81	NC_011738	TGAT	2	8	48695	48702	25 %	50 %	25 %	0 %	218442642
82	NC_011738	AATT	2	8	48815	48822	50 %	50 %	0 %	0 %	218442642
83	NC_011738	CTCA	2	8	49552	49559	25 %	25 %	0 %	50 %	218442643
84	NC_011738	TCTG	2	8	49627	49634	0 %	50 %	25 %	25 %	218442643
85	NC_011738	CCTT	2	8	50350	50357	0 %	50 %	0 %	50 %	218442644
86	NC_011738	AAAC	2	8	50641	50648	75 %	0 %	0 %	25 %	218442645
87	NC_011738	TTAA	2	8	51389	51396	50 %	50 %	0 %	0 %	218442646
88	NC_011738	AATA	2	8	52047	52054	75 %	25 %	0 %	0 %	218442647
89	NC_011738	AAAT	2	8	52526	52533	75 %	25 %	0 %	0 %	218442647
90	NC_011738	AATT	2	8	53120	53127	50 %	50 %	0 %	0 %	218442647
91	NC_011738	GTTC	2	8	53139	53146	0 %	50 %	25 %	25 %	218442647
92	NC_011738	TCAA	2	8	55562	55569	50 %	25 %	0 %	25 %	218442651
93	NC_011738	AAGA	2	8	56093	56100	75 %	0 %	25 %	0 %	218442652
94	NC_011738	GGGA	2	8	58652	58659	25 %	0 %	75 %	0 %	218442655
95	NC_011738	CTAT	2	8	59975	59982	25 %	50 %	0 %	25 %	218442655
96	NC_011738	TCAA	2	8	61972	61979	50 %	25 %	0 %	25 %	218442656
97	NC_011738	CAAC	2	8	62018	62025	50 %	0 %	0 %	50 %	218442656
98	NC_011738	GCGA	2	8	62394	62401	25 %	0 %	50 %	25 %	218442657
99	NC_011738	ATTT	2	8	63321	63328	25 %	75 %	0 %	0 %	218442658
100	NC_011738	CAGA	2	8	64670	64677	50 %	0 %	25 %	25 %	218442659
101	NC_011738	TTCT	2	8	65607	65614	0 %	75 %	0 %	25 %	218442659
102	NC_011738	GAAG	2	8	66806	66813	50 %	0 %	50 %	0 %	218442661
103	NC_011738	AATT	2	8	67178	67185	50 %	50 %	0 %	0 %	218442662
104	NC_011738	TTTG	2	8	67204	67211	0 %	75 %	25 %	0 %	218442662
105	NC_011738	AAAG	2	8	67344	67351	75 %	0 %	25 %	0 %	218442662
106	NC_011738	ATTG	2	8	67430	67437	25 %	50 %	25 %	0 %	218442662
107	NC_011738	AACC	2	8	67438	67445	50 %	0 %	0 %	50 %	218442662
108	NC_011738	ATAA	2	8	67447	67454	75 %	25 %	0 %	0 %	218442662
109	NC_011738	AATG	2	8	67738	67745	50 %	25 %	25 %	0 %	218442662
110	NC_011738	TATC	2	8	69065	69072	25 %	50 %	0 %	25 %	218442663
111	NC_011738	ATCT	2	8	69468	69475	25 %	50 %	0 %	25 %	218442664
112	NC_011738	AATG	2	8	69933	69940	50 %	25 %	25 %	0 %	218442665
113	NC_011738	TACA	2	8	70000	70007	50 %	25 %	0 %	25 %	218442665
114	NC_011738	CCAG	2	8	70059	70066	25 %	0 %	25 %	50 %	218442665
115	NC_011738	ATTT	2	8	70420	70427	25 %	75 %	0 %	0 %	218442666
116	NC_011738	TTGG	2	8	70444	70451	0 %	50 %	50 %	0 %	218442666
117	NC_011738	AGAT	2	8	70546	70553	50 %	25 %	25 %	0 %	218442666
118	NC_011738	CAGA	2	8	70698	70705	50 %	0 %	25 %	25 %	218442666
119	NC_011738	CCGA	2	8	71149	71156	25 %	0 %	25 %	50 %	218442666
120	NC_011738	TCAA	2	8	71805	71812	50 %	25 %	0 %	25 %	218442667
121	NC_011738	TACA	2	8	72656	72663	50 %	25 %	0 %	25 %	218442667
122	NC_011738	ATCG	2	8	74487	74494	25 %	25 %	25 %	25 %	218442669
123	NC_011738	TAAT	2	8	75022	75029	50 %	50 %	0 %	0 %	218442669
124	NC_011738	ACCT	2	8	75311	75318	25 %	25 %	0 %	50 %	218442669
125	NC_011738	CCCT	2	8	76192	76199	0 %	25 %	0 %	75 %	218442670
126	NC_011738	CTTG	2	8	76230	76237	0 %	50 %	25 %	25 %	218442670
127	NC_011738	CATC	2	8	76441	76448	25 %	25 %	0 %	50 %	218442670
128	NC_011738	TCGA	2	8	76529	76536	25 %	25 %	25 %	25 %	218442670
129	NC_011738	CTTT	2	8	76899	76906	0 %	75 %	0 %	25 %	218442670
130	NC_011738	CTTT	2	8	77064	77071	0 %	75 %	0 %	25 %	218442670
131	NC_011738	CCTT	2	8	77133	77140	0 %	50 %	0 %	50 %	218442670
132	NC_011738	TTAA	2	8	77310	77317	50 %	50 %	0 %	0 %	218442670
133	NC_011738	CTAT	2	8	77457	77464	25 %	50 %	0 %	25 %	218442670
134	NC_011738	ACTG	2	8	77660	77667	25 %	25 %	25 %	25 %	218442670
135	NC_011738	CTTT	2	8	77961	77968	0 %	75 %	0 %	25 %	218442671
136	NC_011738	GTTT	2	8	78092	78099	0 %	75 %	25 %	0 %	218442672
137	NC_011738	CGAT	2	8	78978	78985	25 %	25 %	25 %	25 %	218442672
138	NC_011738	GTTT	2	8	79885	79892	0 %	75 %	25 %	0 %	218442672
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