MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	TCA	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011738	CTT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011738	TTC	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011738	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011738	AAG	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011738	TCC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011738	GAG	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011738	AAT	2	6	1634	1639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011738	TGT	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011738	GTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011738	AGG	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011738	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011738	TTA	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011738	GAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011738	ATT	2	6	5815	5820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011738	ATT	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011738	ACG	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011738	GCT	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011738	CGC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011738	AAT	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011738	ATA	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011738	TTC	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011738	TAA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011738	AAG	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011738	TTA	2	6	8173	8178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011738	ATC	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011738	TAA	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011738	GCT	2	6	11918	11923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011738	TGT	2	6	12012	12017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011738	AGG	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011738	AGG	2	6	12063	12068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011738	AGG	2	6	12070	12075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011738	TTC	2	6	12081	12086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011738	CGG	2	6	12172	12177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011738	CCT	2	6	12218	12223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011738	CCT	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011738	CCT	2	6	12246	12251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011738	TAC	2	6	12544	12549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011738	CAA	2	6	12829	12834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011738	TTG	2	6	12840	12845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011738	ATT	2	6	14017	14022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011738	CTC	2	6	14081	14086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011738	TTA	2	6	14152	14157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011738	AAT	2	6	15685	15690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011738	CTT	2	6	15732	15737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011738	TAA	2	6	15799	15804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011738	AAT	2	6	15838	15843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011738	AAG	2	6	15874	15879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011738	ATA	2	6	16719	16724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011738	GAA	2	6	16755	16760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011738	ATT	2	6	21256	21261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011738	ATC	2	6	21326	21331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011738	ATT	2	6	21393	21398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011738	AAG	2	6	28750	28755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011738	ATA	2	6	28848	28853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011738	CAA	2	6	29020	29025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011738	CTT	2	6	29220	29225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011738	TGC	2	6	29247	29252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011738	TTG	2	6	29350	29355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011738	TTC	2	6	29398	29403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011738	TCA	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011738	CCT	2	6	29480	29485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011738	CGC	2	6	29646	29651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011738	TGC	2	6	29665	29670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011738	TTC	2	6	29673	29678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011738	CTT	2	6	29739	29744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011738	GAG	2	6	30179	30184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011738	TTA	2	6	30209	30214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011738	TGG	2	6	30219	30224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011738	TTG	2	6	30258	30263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011738	AGC	2	6	30310	30315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011738	TTA	2	6	30366	30371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011738	AGG	2	6	30450	30455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011738	AGG	2	6	30669	30674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011738	ATT	2	6	30947	30952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011738	TTC	2	6	31020	31025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011738	TAG	2	6	31230	31235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011738	GCA	2	6	31255	31260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011738	TCA	2	6	31285	31290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011738	ATT	2	6	31300	31305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011738	AAG	2	6	31410	31415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011738	TAT	2	6	31465	31470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011738	ACC	2	6	31488	31493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011738	TAA	2	6	31686	31691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011738	AAC	2	6	31803	31808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011738	GCA	4	12	31844	31855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011738	CCG	2	6	31873	31878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011738	CTC	2	6	31897	31902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011738	CAA	2	6	31919	31924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011738	TCC	2	6	32056	32061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011738	ATC	2	6	32109	32114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011738	GGA	2	6	32170	32175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011738	CGC	2	6	32230	32235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011738	CAG	2	6	32433	32438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011738	CTT	2	6	32475	32480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011738	CTA	2	6	32514	32519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011738	CCA	2	6	32606	32611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011738	TAC	2	6	32613	32618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011738	AGG	2	6	32634	32639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011738	ACC	2	6	32703	32708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011738	ACC	2	6	32772	32777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011738	CAA	2	6	32866	32871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011738	ACA	2	6	32935	32940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011738	GCC	2	6	33011	33016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011738	TCC	2	6	33125	33130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011738	TGA	2	6	33252	33257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011738	ATG	2	6	33396	33401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011738	TCC	2	6	33415	33420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011738	TTC	2	6	33421	33426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011738	AGA	2	6	33439	33444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011738	ATC	2	6	33526	33531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011738	CAT	2	6	33591	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011738	GCG	2	6	33633	33638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011738	TGT	2	6	33721	33726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011738	GCG	2	6	33734	33739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011738	ACG	2	6	33816	33821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011738	GCT	2	6	33839	33844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011738	CGC	2	6	33878	33883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011738	AAT	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011738	ATA	2	6	35180	35185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011738	TTC	2	6	35268	35273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011738	TAA	2	6	35320	35325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011738	TTA	2	6	35349	35354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011738	AAG	2	6	35482	35487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011738	AAC	2	6	35500	35505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011738	GAA	2	6	35625	35630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011738	ATT	2	6	35632	35637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011738	GAA	2	6	35838	35843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011738	AAC	2	6	35864	35869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011738	ATC	2	6	35951	35956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011738	TCA	2	6	36016	36021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011738	GAA	2	6	36104	36109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011738	GAA	2	6	36241	36246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011738	ATT	2	6	36727	36732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011738	TAT	2	6	36764	36769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011738	GTC	2	6	36936	36941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011738	GAA	2	6	37134	37139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011738	GAT	2	6	37161	37166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011738	GGC	2	6	37377	37382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011738	AGG	2	6	37432	37437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011738	AAG	2	6	37841	37846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011738	TAA	2	6	40007	40012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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