MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	CAGGGA	2	12	1352	1363	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218442436
2	NC_011737	GACATA	2	12	3300	3311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218442436
3	NC_011737	TATCTT	2	12	4586	4597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442437
4	NC_011737	TTACTA	2	12	7328	7339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218442439
5	NC_011737	TTTTTG	2	12	10337	10348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218442441
6	NC_011737	TTCATT	2	12	10401	10412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442441
7	NC_011737	AGGGTT	2	12	13950	13961	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011737	TTAATT	2	12	14761	14772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011737	TGCCTA	2	12	17256	17267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218442448
10	NC_011737	TATTGA	2	12	17556	17567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442448
11	NC_011737	GAAAAA	2	12	18922	18933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011737	TAAAAT	2	12	20239	20250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011737	TTTCTC	2	12	21642	21653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011737	AATATT	2	12	23654	23665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011737	TAGTGC	2	12	24254	24265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218442455
16	NC_011737	ATTTTA	2	12	25957	25968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011737	TTTCTT	2	12	26906	26917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011737	CTTTTT	2	12	27278	27289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011737	AGTAAA	2	12	29749	29760	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011737	GAAAGT	2	12	31513	31524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011737	GCTATT	2	12	32356	32367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218442465
22	NC_011737	TTTAGA	2	12	35397	35408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442469
23	NC_011737	TCCACT	2	12	36775	36786	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218442470
24	NC_011737	GATATT	2	12	37368	37379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442470
25	NC_011737	TTCCAT	2	12	42200	42211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218442474
26	NC_011737	TTTGAA	2	12	48570	48581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442480
27	NC_011737	GTCATA	2	12	49973	49984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442481
28	NC_011737	AGAAAC	2	12	51453	51464	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218442481
29	NC_011737	CAGGAG	2	12	53719	53730	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218442482
30	NC_011737	TTTTGC	2	12	53996	54007	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442482
31	NC_011737	TAAGAT	2	12	56747	56758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011737	GAAAAA	2	12	64309	64320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011737	TAAAAT	2	12	65625	65636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011737	TTCATC	2	12	70714	70725	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218442495
35	NC_011737	TCAAAC	2	12	74132	74143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218442496
36	NC_011737	TAAAAT	2	12	74327	74338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442496
37	NC_011737	TTCTGC	2	12	74828	74839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218442496
38	NC_011737	CCACTC	2	12	77362	77373	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	218442496
39	NC_011737	ACACTT	2	12	86342	86353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442506
40	NC_011737	TCACAT	2	12	94296	94307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442517
41	NC_011737	GAAAAA	2	12	99444	99455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442520
42	NC_011737	ACTCGA	2	12	100588	100599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218442521
43	NC_011737	TGACCC	2	12	103143	103154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218442523
44	NC_011737	TAACTC	2	12	103752	103763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442523
45	NC_011737	GATTTA	2	12	111796	111807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442530
46	NC_011737	GATGAC	2	12	111924	111935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442530
47	NC_011737	CTGTTG	2	12	114095	114106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218442532
48	NC_011737	ATTGGT	2	12	117837	117848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218442534
49	NC_011737	TCGGCT	2	12	129564	129575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442544
50	NC_011737	AAAATG	2	12	129794	129805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011737	CCTAAA	2	12	130248	130259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218442545
52	NC_011737	TAATGT	2	12	133894	133905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442548
53	NC_011737	TTAATT	2	12	135855	135866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442548
54	NC_011737	GCCACT	2	12	138038	138049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218442550
55	NC_011737	ATAGAT	2	12	138616	138627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442550
56	NC_011737	GAGCTA	2	12	138644	138655	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442550
57	NC_011737	AAACTA	2	12	141337	141348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218442552
58	NC_011737	GTTTTT	2	12	145580	145591	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011737	GATCGA	2	12	149007	149018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442561
60	NC_011737	ATCTCA	2	12	149908	149919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442562
61	NC_011737	GAATTA	2	12	151958	151969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442566
62	NC_011737	AAAAGA	2	12	152317	152328	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442566
63	NC_011737	AGAAAA	2	12	157490	157501	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442570
64	NC_011737	TTAAAG	2	12	162432	162443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011737	TCCCAC	2	12	164516	164527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011737	TTAACT	2	12	165332	165343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218442578
67	NC_011737	CTTGGA	2	12	166663	166674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218442580
68	NC_011737	GCTATT	2	12	170225	170236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218442582
69	NC_011737	TGTTTC	2	12	176237	176248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442588
70	NC_011737	TGACGA	2	12	179467	179478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442590
71	NC_011737	ATGGTA	2	12	184084	184095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442593
72	NC_011737	AAACTA	2	12	189193	189204	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218442599
73	NC_011737	TGATAT	2	12	191981	191992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442603
74	NC_011737	GAGTGT	2	12	194214	194225	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218442606

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.