MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	CAGGGA	2	12	1352	1363	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218442436
2	NC_011737	GACATA	2	12	3300	3311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218442436
3	NC_011737	TATCTT	2	12	4586	4597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442437
4	NC_011737	TTACTA	2	12	7328	7339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218442439
5	NC_011737	TTTTTG	2	12	10337	10348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218442441
6	NC_011737	TTCATT	2	12	10401	10412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218442441
7	NC_011737	TGCCTA	2	12	17256	17267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218442448
8	NC_011737	TATTGA	2	12	17556	17567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442448
9	NC_011737	TAGTGC	2	12	24254	24265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218442455
10	NC_011737	GCTATT	2	12	32356	32367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218442465
11	NC_011737	TTTAGA	2	12	35397	35408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442469
12	NC_011737	TCCACT	2	12	36775	36786	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218442470
13	NC_011737	GATATT	2	12	37368	37379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442470
14	NC_011737	TTCCAT	2	12	42200	42211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218442474
15	NC_011737	TTTGAA	2	12	48570	48581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442480
16	NC_011737	GTCATA	2	12	49973	49984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442481
17	NC_011737	AGAAAC	2	12	51453	51464	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218442481
18	NC_011737	CAGGAG	2	12	53719	53730	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218442482
19	NC_011737	TTTTGC	2	12	53996	54007	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442482
20	NC_011737	TTCATC	2	12	70714	70725	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218442495
21	NC_011737	TCAAAC	2	12	74132	74143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218442496
22	NC_011737	TAAAAT	2	12	74327	74338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442496
23	NC_011737	TTCTGC	2	12	74828	74839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218442496
24	NC_011737	CCACTC	2	12	77362	77373	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	218442496
25	NC_011737	ACACTT	2	12	86342	86353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442506
26	NC_011737	TCACAT	2	12	94296	94307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442517
27	NC_011737	GAAAAA	2	12	99444	99455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442520
28	NC_011737	ACTCGA	2	12	100588	100599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218442521
29	NC_011737	TGACCC	2	12	103143	103154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218442523
30	NC_011737	TAACTC	2	12	103752	103763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442523
31	NC_011737	GATTTA	2	12	111796	111807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442530
32	NC_011737	GATGAC	2	12	111924	111935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442530
33	NC_011737	CTGTTG	2	12	114095	114106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218442532
34	NC_011737	ATTGGT	2	12	117837	117848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218442534
35	NC_011737	TCGGCT	2	12	129564	129575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442544
36	NC_011737	CCTAAA	2	12	130248	130259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218442545
37	NC_011737	TAATGT	2	12	133894	133905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442548
38	NC_011737	TTAATT	2	12	135855	135866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442548
39	NC_011737	GCCACT	2	12	138038	138049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218442550
40	NC_011737	ATAGAT	2	12	138616	138627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442550
41	NC_011737	GAGCTA	2	12	138644	138655	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442550
42	NC_011737	AAACTA	2	12	141337	141348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218442552
43	NC_011737	GATCGA	2	12	149007	149018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442561
44	NC_011737	ATCTCA	2	12	149908	149919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442562
45	NC_011737	GAATTA	2	12	151958	151969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442566
46	NC_011737	AAAAGA	2	12	152317	152328	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442566
47	NC_011737	AGAAAA	2	12	157490	157501	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442570
48	NC_011737	TTAACT	2	12	165332	165343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218442578
49	NC_011737	CTTGGA	2	12	166663	166674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218442580
50	NC_011737	GCTATT	2	12	170225	170236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218442582
51	NC_011737	TGTTTC	2	12	176237	176248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442588
52	NC_011737	TGACGA	2	12	179467	179478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218442590
53	NC_011737	ATGGTA	2	12	184084	184095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442593
54	NC_011737	AAACTA	2	12	189193	189204	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218442599
55	NC_011737	TGATAT	2	12	191981	191992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442603
56	NC_011737	GAGTGT	2	12	194214	194225	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218442606

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.