MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	AAAAT	2	10	19688	19697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011737	GCGCC	2	10	21662	21671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011737	ATTTT	2	10	26509	26518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011737	AAATG	2	10	27316	27325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011737	ACCCA	2	10	28960	28969	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_011737	ATTTA	2	10	31983	31992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011737	TGATA	2	10	34234	34243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011737	TAATA	2	10	39918	39927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011737	ACCTA	2	10	47769	47778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011737	ATTGT	2	10	54174	54183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011737	GAAAA	2	10	61299	61308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011737	AAGGG	2	10	62502	62511	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011737	ATCGC	2	10	62565	62574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011737	TCTTT	2	10	62716	62725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011737	AAAAT	2	10	65075	65084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011737	TCAAA	2	10	70400	70409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011737	TAATT	2	10	79727	79736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011737	TAATT	2	10	80387	80396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011737	TTAAT	2	10	80772	80781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011737	AGGTA	2	10	84853	84862	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011737	ACCTA	2	10	96827	96836	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011737	TTCTA	2	10	97987	97996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011737	TCTGT	2	10	116447	116456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011737	GAAAT	2	10	116932	116941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011737	CTTTA	2	10	118690	118699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011737	AAGAT	2	10	118789	118798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011737	ATTTT	2	10	121287	121296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011737	TTAAA	2	10	121977	121986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011737	TTTAA	2	10	122797	122806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011737	ATAAA	2	10	131623	131632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011737	TATAT	2	10	141682	141691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011737	AAATT	2	10	141850	141859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011737	ATCAA	2	10	143664	143673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011737	ATTTA	2	10	152539	152548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011737	ATTTA	2	10	169852	169861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011737	TAAAA	2	10	194374	194383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011737	TTTCT	2	10	195853	195862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011737	TAAAA	2	10	197537	197546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.