MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 2697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	GAG	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011737	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011737	TCC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011737	CTG	2	6	118	123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011737	CCT	2	6	132	137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011737	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
7	NC_011737	GGC	2	6	345	350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442436
8	NC_011737	AAC	2	6	375	380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
9	NC_011737	AGC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
10	NC_011737	GGA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442436
11	NC_011737	GTC	2	6	599	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
12	NC_011737	AAT	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
13	NC_011737	AGT	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
14	NC_011737	ATT	2	6	725	730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
15	NC_011737	TTG	2	6	749	754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
16	NC_011737	AGT	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
17	NC_011737	TAT	2	6	1027	1032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
18	NC_011737	CAA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
19	NC_011737	ACC	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442436
20	NC_011737	GAT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
21	NC_011737	ATT	2	6	1169	1174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
22	NC_011737	TGC	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
23	NC_011737	TAT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
24	NC_011737	GAT	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
25	NC_011737	TTA	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
26	NC_011737	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
27	NC_011737	ACT	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442436
28	NC_011737	TTA	2	6	1427	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
29	NC_011737	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
30	NC_011737	AGA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
31	NC_011737	GTT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
32	NC_011737	TAA	2	6	1536	1541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
33	NC_011737	GAA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
34	NC_011737	TCA	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442436
35	NC_011737	CTT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442436
36	NC_011737	AGA	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
37	NC_011737	AGA	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
38	NC_011737	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
39	NC_011737	TGC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
40	NC_011737	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442436
41	NC_011737	GAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
42	NC_011737	TTA	2	6	1896	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
43	NC_011737	CGA	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
44	NC_011737	ACA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
45	NC_011737	AAT	2	6	2113	2118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
46	NC_011737	ATT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
47	NC_011737	CGT	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442436
48	NC_011737	TAG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
49	NC_011737	AAC	2	6	2313	2318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442436
50	NC_011737	ATT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
51	NC_011737	AGT	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
52	NC_011737	ATT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
53	NC_011737	AGA	2	6	3241	3246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442436
54	NC_011737	TAG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
55	NC_011737	ACC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442436
56	NC_011737	AGC	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442436
57	NC_011737	GTT	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442436
58	NC_011737	GTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442436
59	NC_011737	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
60	NC_011737	GTA	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
61	NC_011737	ATA	2	6	3702	3707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442436
62	NC_011737	TAG	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442436
63	NC_011737	TTA	2	6	4080	4085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442436
64	NC_011737	GGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442436
65	NC_011737	TAT	2	6	4514	4519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442437
66	NC_011737	TGT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011737	TTA	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011737	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011737	CAT	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011737	TCT	2	6	5163	5168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011737	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011737	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011737	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011737	ACT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011737	GAC	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442438
76	NC_011737	AGA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442438
77	NC_011737	AAG	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442438
78	NC_011737	AAT	2	6	5759	5764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
79	NC_011737	TCT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442439
80	NC_011737	CAA	2	6	5873	5878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442439
81	NC_011737	TAA	2	6	6069	6074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
82	NC_011737	AGA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
83	NC_011737	AAG	2	6	6441	6446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
84	NC_011737	AAT	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
85	NC_011737	ATG	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442439
86	NC_011737	CAT	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442439
87	NC_011737	TAA	2	6	6674	6679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
88	NC_011737	AAT	2	6	6684	6689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
89	NC_011737	GAC	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442439
90	NC_011737	TAA	2	6	6819	6824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
91	NC_011737	AAT	2	6	6899	6904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
92	NC_011737	ATA	2	6	6952	6957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
93	NC_011737	TAA	2	6	7034	7039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
94	NC_011737	TAA	2	6	7143	7148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
95	NC_011737	GTC	3	9	7459	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442439
96	NC_011737	AAG	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
97	NC_011737	ATA	2	6	7542	7547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
98	NC_011737	ATT	2	6	7548	7553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442439
99	NC_011737	ACC	2	6	7602	7607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442439
100	NC_011737	CTT	2	6	7691	7696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442439
101	NC_011737	TTG	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442439
102	NC_011737	TGT	2	6	7735	7740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442439
103	NC_011737	TTC	2	6	7746	7751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442439
104	NC_011737	AGA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442439
105	NC_011737	CAG	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442439
106	NC_011737	AAT	2	6	7961	7966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
107	NC_011737	TAA	2	6	8007	8012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
108	NC_011737	GAT	2	6	8183	8188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442439
109	NC_011737	ATA	2	6	8284	8289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
110	NC_011737	TAA	2	6	8319	8324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
111	NC_011737	TAT	2	6	8336	8341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442439
112	NC_011737	TAA	2	6	8626	8631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442439
113	NC_011737	ATA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011737	TAT	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011737	ATA	2	6	8850	8855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442440
116	NC_011737	TAA	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442440
117	NC_011737	ATG	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442440
118	NC_011737	TGC	2	6	9213	9218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442440
119	NC_011737	GAG	2	6	9287	9292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442440
120	NC_011737	CAT	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442440
121	NC_011737	ACG	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011737	AAG	2	6	9527	9532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011737	GGC	2	6	9576	9581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011737	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011737	TCA	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011737	TAA	2	6	9850	9855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011737	CAT	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011737	ATT	2	6	10021	10026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442441
129	NC_011737	AAT	2	6	10061	10066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442441
130	NC_011737	TAA	2	6	10145	10150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442441
131	NC_011737	CTC	2	6	10170	10175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442441
132	NC_011737	TTC	2	6	10257	10262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442441
133	NC_011737	TGC	2	6	10272	10277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442441
134	NC_011737	TAA	2	6	10558	10563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_011737	AGA	2	6	19623	19628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_011737	AAT	2	6	19886	19891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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