MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011736	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	218442415
2	NC_011736	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	218442415
3	NC_011736	AAAG	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	218442407
4	NC_011736	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	218442407
5	NC_011736	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	218442407
6	NC_011736	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	218442398
7	NC_011736	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	218442398
8	NC_011736	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	218442398
9	NC_011736	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	218442398
10	NC_011736	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	218442398
11	NC_011736	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	218442427
12	NC_011736	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	218442427
13	NC_011736	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	218442417
14	NC_011736	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	218442417
15	NC_011736	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	218442417
16	NC_011736	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	218442425
17	NC_011736	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	218442425
18	NC_011736	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	218442396
19	NC_011736	TTTA	2	8	6998	7005	25 %	75 %	0 %	0 %	218442406
20	NC_011736	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	218442406
21	NC_011736	GCTG	2	8	7333	7340	0 %	25 %	50 %	25 %	218442406
22	NC_011736	TAGA	2	8	7644	7651	50 %	25 %	25 %	0 %	218442406
23	NC_011736	ATTT	2	8	8496	8503	25 %	75 %	0 %	0 %	218442426
24	NC_011736	TGAG	2	8	8600	8607	25 %	25 %	50 %	0 %	218442426
25	NC_011736	AAAT	2	8	8734	8741	75 %	25 %	0 %	0 %	218442405
26	NC_011736	CTTG	2	8	8798	8805	0 %	50 %	25 %	25 %	218442405
27	NC_011736	GAAA	2	8	9561	9568	75 %	0 %	25 %	0 %	218442413
28	NC_011736	AGAA	2	8	10424	10431	75 %	0 %	25 %	0 %	218442421
29	NC_011736	TCAA	2	8	12204	12211	50 %	25 %	0 %	25 %	218442422
30	NC_011736	AATT	2	8	12468	12475	50 %	50 %	0 %	0 %	218442422
31	NC_011736	GTTT	2	8	12488	12495	0 %	75 %	25 %	0 %	218442422
32	NC_011736	AGAT	2	8	13708	13715	50 %	25 %	25 %	0 %	218442428
33	NC_011736	TATC	2	8	13920	13927	25 %	50 %	0 %	25 %	218442423
34	NC_011736	AAAC	2	8	14112	14119	75 %	0 %	0 %	25 %	218442423
35	NC_011736	ATTT	2	8	14128	14135	25 %	75 %	0 %	0 %	218442423
36	NC_011736	ATTA	2	8	14647	14654	50 %	50 %	0 %	0 %	218442410
37	NC_011736	TATT	2	8	15043	15050	25 %	75 %	0 %	0 %	218442410
38	NC_011736	TCAA	2	8	15682	15689	50 %	25 %	0 %	25 %	218442429
39	NC_011736	AGGA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	50 %	0 %	218442429
40	NC_011736	CTAT	2	8	15766	15773	25 %	50 %	0 %	25 %	218442429
41	NC_011736	TAAC	2	8	15836	15843	50 %	25 %	0 %	25 %	218442431
42	NC_011736	AGAT	2	8	16799	16806	50 %	25 %	25 %	0 %	218442416
43	NC_011736	TCTT	2	8	17939	17946	0 %	75 %	0 %	25 %	218442432
44	NC_011736	CTTG	2	8	18343	18350	0 %	50 %	25 %	25 %	218442432
45	NC_011736	AAGA	3	12	19702	19713	75 %	0 %	25 %	0 %	218442400
46	NC_011736	AAAT	2	8	19856	19863	75 %	25 %	0 %	0 %	218442400
47	NC_011736	TAAA	2	8	19882	19889	75 %	25 %	0 %	0 %	218442400
48	NC_011736	CAAA	2	8	19952	19959	75 %	0 %	0 %	25 %	218442400
49	NC_011736	GAAA	2	8	20097	20104	75 %	0 %	25 %	0 %	218442400
50	NC_011736	TTGA	2	8	20439	20446	25 %	50 %	25 %	0 %	218442403
51	NC_011736	AAAT	2	8	20671	20678	75 %	25 %	0 %	0 %	218442403
52	NC_011736	TTTA	2	8	20816	20823	25 %	75 %	0 %	0 %	218442403
53	NC_011736	TCAA	2	8	20936	20943	50 %	25 %	0 %	25 %	218442412
54	NC_011736	AATA	2	8	21148	21155	75 %	25 %	0 %	0 %	218442412
55	NC_011736	AATG	2	8	21400	21407	50 %	25 %	25 %	0 %	218442412
56	NC_011736	AGAA	2	8	21431	21438	75 %	0 %	25 %	0 %	218442412
57	NC_011736	TGAT	2	8	21893	21900	25 %	50 %	25 %	0 %	218442408
58	NC_011736	AAAT	2	8	23745	23752	75 %	25 %	0 %	0 %	218442395
59	NC_011736	AATC	2	8	24316	24323	50 %	25 %	0 %	25 %	218442395
60	NC_011736	AGAT	2	8	24540	24547	50 %	25 %	25 %	0 %	218442395
61	NC_011736	AAAT	3	12	25263	25274	75 %	25 %	0 %	0 %	218442397
62	NC_011736	TAAA	2	8	25278	25285	75 %	25 %	0 %	0 %	218442397
63	NC_011736	AGGT	2	8	25400	25407	25 %	25 %	50 %	0 %	218442397
64	NC_011736	ACCA	2	8	25647	25654	50 %	0 %	0 %	50 %	218442397
65	NC_011736	GTTT	2	8	25667	25674	0 %	75 %	25 %	0 %	218442397
66	NC_011736	TAAA	2	8	25720	25727	75 %	25 %	0 %	0 %	218442397
67	NC_011736	AAGA	2	8	26664	26671	75 %	0 %	25 %	0 %	218442430
68	NC_011736	CAAA	2	8	26929	26936	75 %	0 %	0 %	25 %	218442430
69	NC_011736	AAGA	2	8	27664	27671	75 %	0 %	25 %	0 %	218442411
70	NC_011736	AAAG	2	8	27698	27705	75 %	0 %	25 %	0 %	218442411
71	NC_011736	AAAT	2	8	27745	27752	75 %	25 %	0 %	0 %	218442411
72	NC_011736	TTCA	2	8	28273	28280	25 %	50 %	0 %	25 %	218442399
73	NC_011736	TAAA	2	8	29419	29426	75 %	25 %	0 %	0 %	218442420
74	NC_011736	CAAG	2	8	29444	29451	50 %	0 %	25 %	25 %	218442420
75	NC_011736	AATT	2	8	29465	29472	50 %	50 %	0 %	0 %	218442420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.