MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011736	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	218442407
2	NC_011736	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	218442407
3	NC_011736	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	218442398
4	NC_011736	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	218442398
5	NC_011736	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	218442417
6	NC_011736	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	218442425
7	NC_011736	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	218442404
8	NC_011736	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	218442396
9	NC_011736	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	218442396
10	NC_011736	TC	3	6	6030	6035	0 %	50 %	0 %	50 %	218442396
11	NC_011736	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	218442433
12	NC_011736	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	218442433
13	NC_011736	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	218442406
14	NC_011736	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	218442406
15	NC_011736	AG	3	6	9172	9177	50 %	0 %	50 %	0 %	218442413
16	NC_011736	AT	3	6	9932	9937	50 %	50 %	0 %	0 %	218442413
17	NC_011736	TA	3	6	10721	10726	50 %	50 %	0 %	0 %	218442421
18	NC_011736	AT	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	218442402
19	NC_011736	AT	4	8	11566	11573	50 %	50 %	0 %	0 %	218442402
20	NC_011736	AC	3	6	11774	11779	50 %	0 %	0 %	50 %	218442402
21	NC_011736	CA	3	6	12142	12147	50 %	0 %	0 %	50 %	218442422
22	NC_011736	TA	3	6	12265	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	218442422
23	NC_011736	AT	3	6	12577	12582	50 %	50 %	0 %	0 %	218442434
24	NC_011736	AT	3	6	12811	12816	50 %	50 %	0 %	0 %	218442434
25	NC_011736	AT	3	6	13205	13210	50 %	50 %	0 %	0 %	218442428
26	NC_011736	AT	3	6	13891	13896	50 %	50 %	0 %	0 %	218442423
27	NC_011736	TA	3	6	15096	15101	50 %	50 %	0 %	0 %	218442410
28	NC_011736	AT	3	6	15511	15516	50 %	50 %	0 %	0 %	218442429
29	NC_011736	AT	3	6	15921	15926	50 %	50 %	0 %	0 %	218442431
30	NC_011736	AT	3	6	16089	16094	50 %	50 %	0 %	0 %	218442431
31	NC_011736	AT	3	6	16394	16399	50 %	50 %	0 %	0 %	218442401
32	NC_011736	AT	3	6	16621	16626	50 %	50 %	0 %	0 %	218442416
33	NC_011736	AT	3	6	16832	16837	50 %	50 %	0 %	0 %	218442416
34	NC_011736	AT	3	6	17923	17928	50 %	50 %	0 %	0 %	218442432
35	NC_011736	TA	3	6	20264	20269	50 %	50 %	0 %	0 %	218442400
36	NC_011736	TA	3	6	20851	20856	50 %	50 %	0 %	0 %	218442403
37	NC_011736	AT	3	6	20983	20988	50 %	50 %	0 %	0 %	218442412
38	NC_011736	AT	3	6	21064	21069	50 %	50 %	0 %	0 %	218442412
39	NC_011736	AT	3	6	21136	21141	50 %	50 %	0 %	0 %	218442412
40	NC_011736	AT	4	8	21238	21245	50 %	50 %	0 %	0 %	218442412
41	NC_011736	TA	3	6	21863	21868	50 %	50 %	0 %	0 %	218442408
42	NC_011736	TA	3	6	22040	22045	50 %	50 %	0 %	0 %	218442408
43	NC_011736	AT	3	6	22049	22054	50 %	50 %	0 %	0 %	218442408
44	NC_011736	TA	3	6	23657	23662	50 %	50 %	0 %	0 %	218442395
45	NC_011736	AG	3	6	23698	23703	50 %	0 %	50 %	0 %	218442395
46	NC_011736	TA	3	6	23738	23743	50 %	50 %	0 %	0 %	218442395
47	NC_011736	AG	3	6	24154	24159	50 %	0 %	50 %	0 %	218442395
48	NC_011736	AG	3	6	25168	25173	50 %	0 %	50 %	0 %	218442397
49	NC_011736	GA	3	6	26724	26729	50 %	0 %	50 %	0 %	218442430
50	NC_011736	GA	3	6	27525	27530	50 %	0 %	50 %	0 %	218442411
51	NC_011736	TA	3	6	27857	27862	50 %	50 %	0 %	0 %	218442411
52	NC_011736	AT	3	6	27977	27982	50 %	50 %	0 %	0 %	218442411
53	NC_011736	TA	3	6	28176	28181	50 %	50 %	0 %	0 %	218442399
54	NC_011736	TA	3	6	28343	28348	50 %	50 %	0 %	0 %	218442409
55	NC_011736	TG	3	6	29153	29158	0 %	50 %	50 %	0 %	218442420
56	NC_011736	AT	3	6	29495	29500	50 %	50 %	0 %	0 %	218442420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.