MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742406

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011734	GGGT	2	8	1060	1067	0 %	25 %	75 %	0 %	218442344
2	NC_011734	TCCA	2	8	1722	1729	25 %	25 %	0 %	50 %	218442344
3	NC_011734	AGTT	2	8	2091	2098	25 %	50 %	25 %	0 %	218442344
4	NC_011734	TTGA	2	8	3380	3387	25 %	50 %	25 %	0 %	218442345
5	NC_011734	AAGT	2	8	5622	5629	50 %	25 %	25 %	0 %	218442347
6	NC_011734	TAGA	2	8	5642	5649	50 %	25 %	25 %	0 %	218442347
7	NC_011734	GATT	2	8	5652	5659	25 %	50 %	25 %	0 %	218442347
8	NC_011734	TAAT	2	8	6086	6093	50 %	50 %	0 %	0 %	218442347
9	NC_011734	CCAA	2	8	8848	8855	50 %	0 %	0 %	50 %	218442348
10	NC_011734	TCTT	2	8	8964	8971	0 %	75 %	0 %	25 %	218442348
11	NC_011734	GTTG	2	8	9046	9053	0 %	50 %	50 %	0 %	218442348
12	NC_011734	TTGG	2	8	9219	9226	0 %	50 %	50 %	0 %	218442348
13	NC_011734	CTAA	2	8	9697	9704	50 %	25 %	0 %	25 %	218442348
14	NC_011734	CTAG	2	8	9757	9764	25 %	25 %	25 %	25 %	218442348
15	NC_011734	AGGA	2	8	10442	10449	50 %	0 %	50 %	0 %	218442349
16	NC_011734	TTAG	2	8	10490	10497	25 %	50 %	25 %	0 %	218442349
17	NC_011734	CCTG	2	8	11123	11130	0 %	25 %	25 %	50 %	218442350
18	NC_011734	GAGG	2	8	11262	11269	25 %	0 %	75 %	0 %	218442350
19	NC_011734	TAAA	2	8	12698	12705	75 %	25 %	0 %	0 %	218442351
20	NC_011734	GTAG	2	8	13099	13106	25 %	25 %	50 %	0 %	218442351
21	NC_011734	GGGT	2	8	14419	14426	0 %	25 %	75 %	0 %	218442353
22	NC_011734	TAAT	2	8	14521	14528	50 %	50 %	0 %	0 %	218442353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.