MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742406

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011734	GGA	2	6	4	9	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011734	TTC	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011734	AGT	3	9	54	62	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011734	CTG	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442343
5	NC_011734	CTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442343
6	NC_011734	TGG	2	6	405	410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442343
7	NC_011734	TAA	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442343
8	NC_011734	CTG	2	6	549	554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442343
9	NC_011734	TGG	2	6	558	563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442343
10	NC_011734	ATC	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442343
11	NC_011734	AGG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442343
12	NC_011734	AGG	2	6	685	690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442343
13	NC_011734	AGG	2	6	694	699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442343
14	NC_011734	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442343
15	NC_011734	AGG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442343
16	NC_011734	AAT	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442343
17	NC_011734	GCT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442343
18	NC_011734	CGT	2	6	882	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442343
19	NC_011734	TCG	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442344
20	NC_011734	TAA	2	6	1097	1102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442344
21	NC_011734	AAC	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442344
22	NC_011734	GCT	2	6	1501	1506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442344
23	NC_011734	ATC	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442344
24	NC_011734	TCT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442344
25	NC_011734	GCT	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442344
26	NC_011734	TAG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442344
27	NC_011734	TAA	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442344
28	NC_011734	TAA	3	9	2229	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442344
29	NC_011734	TCC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011734	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011734	TAA	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011734	TAT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011734	TAA	2	6	2886	2891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011734	TCT	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011734	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011734	TTC	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442345
37	NC_011734	CTT	2	6	3136	3141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442345
38	NC_011734	CTG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442345
39	NC_011734	CTC	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442345
40	NC_011734	TAT	2	6	3214	3219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442345
41	NC_011734	AAG	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442345
42	NC_011734	TCT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442345
43	NC_011734	TTC	2	6	3305	3310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442345
44	NC_011734	CCT	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442345
45	NC_011734	GGC	2	6	3665	3670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442345
46	NC_011734	ATT	2	6	3707	3712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442345
47	NC_011734	TAA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442345
48	NC_011734	CTC	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442345
49	NC_011734	TTA	2	6	4009	4014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442346
50	NC_011734	TGA	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442346
51	NC_011734	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442346
52	NC_011734	TAT	2	6	4254	4259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011734	CTA	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011734	CTG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442347
55	NC_011734	GGC	2	6	4630	4635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442347
56	NC_011734	TAA	2	6	4830	4835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
57	NC_011734	TCT	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442347
58	NC_011734	TCC	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442347
59	NC_011734	TTC	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442347
60	NC_011734	CTC	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442347
61	NC_011734	TCT	2	6	4941	4946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442347
62	NC_011734	TAC	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442347
63	NC_011734	TAA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
64	NC_011734	ATT	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
65	NC_011734	AAG	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442347
66	NC_011734	GAC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442347
67	NC_011734	ATT	2	6	5383	5388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
68	NC_011734	CAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442347
69	NC_011734	TGA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
70	NC_011734	TGG	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442347
71	NC_011734	AAG	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442347
72	NC_011734	GTA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
73	NC_011734	ATA	2	6	5741	5746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
74	NC_011734	TAT	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
75	NC_011734	GTG	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442347
76	NC_011734	AGG	2	6	5873	5878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442347
77	NC_011734	AAT	2	6	5911	5916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
78	NC_011734	ATA	2	6	5939	5944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
79	NC_011734	GAT	2	6	5974	5979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
80	NC_011734	CTG	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442347
81	NC_011734	TAT	2	6	6097	6102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
82	NC_011734	CGT	2	6	6138	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442347
83	NC_011734	AAT	2	6	6151	6156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
84	NC_011734	TAA	2	6	6183	6188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
85	NC_011734	ATG	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
86	NC_011734	ATT	2	6	6211	6216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
87	NC_011734	GGC	2	6	6576	6581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442347
88	NC_011734	TAT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442347
89	NC_011734	ACG	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442347
90	NC_011734	CTT	2	6	6839	6844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442347
91	NC_011734	GAT	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
92	NC_011734	CTA	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442347
93	NC_011734	TAA	2	6	6987	6992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
94	NC_011734	GGA	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442347
95	NC_011734	TTG	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442347
96	NC_011734	AGG	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442347
97	NC_011734	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442347
98	NC_011734	TAG	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442347
99	NC_011734	TAA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442347
100	NC_011734	CGA	2	6	7249	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442347
101	NC_011734	ATC	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442347
102	NC_011734	GAG	2	6	7303	7308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442347
103	NC_011734	AAT	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011734	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011734	GGC	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011734	CCG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011734	ATT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011734	TTG	2	6	7866	7871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
109	NC_011734	GCC	2	6	7897	7902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442348
110	NC_011734	AAT	2	6	7944	7949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442348
111	NC_011734	AAT	2	6	7953	7958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442348
112	NC_011734	TCC	2	6	7959	7964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442348
113	NC_011734	TAT	2	6	7973	7978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442348
114	NC_011734	TAT	2	6	8030	8035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442348
115	NC_011734	GTT	2	6	8186	8191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
116	NC_011734	CAT	2	6	8202	8207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
117	NC_011734	GAT	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442348
118	NC_011734	TTA	2	6	8236	8241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442348
119	NC_011734	CAG	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442348
120	NC_011734	TGT	2	6	8299	8304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
121	NC_011734	TCA	2	6	8506	8511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
122	NC_011734	GGA	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442348
123	NC_011734	GTT	2	6	8636	8641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
124	NC_011734	TGT	2	6	8701	8706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
125	NC_011734	TAC	2	6	8816	8821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
126	NC_011734	AGA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442348
127	NC_011734	TTG	2	6	9035	9040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442348
128	NC_011734	CTG	2	6	9090	9095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442348
129	NC_011734	CTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442348
130	NC_011734	TCA	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
131	NC_011734	TCC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442348
132	NC_011734	CAT	2	6	9381	9386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
133	NC_011734	GGC	2	6	9387	9392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442348
134	NC_011734	CTA	2	6	9656	9661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
135	NC_011734	ATT	2	6	9666	9671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442348
136	NC_011734	CTG	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442348
137	NC_011734	TCA	2	6	9913	9918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442348
138	NC_011734	GCA	3	9	9943	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442348
139	NC_011734	GAT	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442348
140	NC_011734	ATC	2	6	10043	10048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011734	AAC	2	6	10127	10132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011734	GAA	2	6	10138	10143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011734	TTA	2	6	10239	10244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011734	GAA	3	9	10378	10386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442349
145	NC_011734	TCC	2	6	10407	10412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442349
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152	NC_011734	AAT	2	6	10903	10908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442350
153	NC_011734	TGC	2	6	10961	10966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442350
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155	NC_011734	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442350
156	NC_011734	TAT	2	6	11664	11669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011734	ATA	2	6	12173	12178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011734	TGT	2	6	12202	12207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011734	CTC	2	6	12234	12239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_011734	AGA	2	6	12355	12360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011734	AAT	2	6	12414	12419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
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163	NC_011734	AAT	2	6	12592	12597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
164	NC_011734	AGA	3	9	12606	12614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442351
165	NC_011734	ACA	2	6	12660	12665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442351
166	NC_011734	CTC	2	6	12749	12754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442351
167	NC_011734	ATA	2	6	12905	12910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
168	NC_011734	AGT	2	6	12939	12944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442351
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172	NC_011734	TAA	2	6	13152	13157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
173	NC_011734	AAT	2	6	13165	13170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
174	NC_011734	AAT	2	6	13179	13184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442351
175	NC_011734	ATG	2	6	13190	13195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442351
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179	NC_011734	CAA	2	6	13420	13425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_011734	AAG	2	6	13511	13516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011734	CTT	2	6	14211	14216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442353
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196	NC_011734	CTT	2	6	14997	15002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_011734	AGA	2	6	15101	15106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_011734	TAA	2	6	15153	15158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_011734	TCA	2	6	15174	15179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.