MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742405

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011733	TTGAC	2	10	193	202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011733	GTATT	2	10	1296	1305	20 %	60 %	20 %	0 %	218442326
3	NC_011733	TGAAG	2	10	1374	1383	40 %	20 %	40 %	0 %	218442326
4	NC_011733	GTCTG	2	10	4402	4411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011733	ATTTT	2	10	5620	5629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011733	ACAGA	2	10	6306	6315	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011733	CCAAG	2	10	7113	7122	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011733	TAGTA	2	10	7703	7712	40 %	40 %	20 %	0 %	218442329
9	NC_011733	TAGTG	2	10	7906	7915	20 %	40 %	40 %	0 %	218442329
10	NC_011733	TCTGT	2	10	8502	8511	0 %	60 %	20 %	20 %	218442329
11	NC_011733	GAGAA	2	10	9982	9991	60 %	0 %	40 %	0 %	218442330
12	NC_011733	GTTCT	2	10	10845	10854	0 %	60 %	20 %	20 %	218442331
13	NC_011733	TAAAT	2	10	11101	11110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011733	AATTA	2	10	11146	11155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011733	CAACT	2	10	11324	11333	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011733	TAATT	2	10	11715	11724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011733	AGAAC	2	10	12216	12225	60 %	0 %	20 %	20 %	218442332
18	NC_011733	TGCTG	2	10	12822	12831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011733	CAAAC	2	10	13152	13161	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011733	GACAA	2	10	13403	13412	60 %	0 %	20 %	20 %	218442333
21	NC_011733	ACCCG	2	10	13979	13988	20 %	0 %	20 %	60 %	218442335
22	NC_011733	GTCGG	2	10	16921	16930	0 %	20 %	60 %	20 %	218442340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.