MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742405

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011733	TTGT	2	8	117	124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011733	ATAA	2	8	1135	1142	75 %	25 %	0 %	0 %	218442326
3	NC_011733	TAAA	2	8	1318	1325	75 %	25 %	0 %	0 %	218442326
4	NC_011733	ATCT	2	8	1509	1516	25 %	50 %	0 %	25 %	218442326
5	NC_011733	AAGT	2	8	1689	1696	50 %	25 %	25 %	0 %	218442326
6	NC_011733	GGAA	2	8	2696	2703	50 %	0 %	50 %	0 %	218442327
7	NC_011733	CAAT	2	8	3114	3121	50 %	25 %	0 %	25 %	218442327
8	NC_011733	AATT	2	8	3362	3369	50 %	50 %	0 %	0 %	218442327
9	NC_011733	TTAC	2	8	3889	3896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011733	GGGT	2	8	4304	4311	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011733	AAGT	2	8	5216	5223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011733	TAGA	2	8	5236	5243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011733	GATT	2	8	5246	5253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011733	TAAT	2	8	5683	5690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011733	ATGG	2	8	7375	7382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011733	TAAA	2	8	7407	7414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011733	ATAC	2	8	7483	7490	50 %	25 %	0 %	25 %	218442329
18	NC_011733	TTTC	2	8	8571	8578	0 %	75 %	0 %	25 %	218442329
19	NC_011733	GTTG	2	8	8655	8662	0 %	50 %	50 %	0 %	218442329
20	NC_011733	GTTT	3	12	8672	8683	0 %	75 %	25 %	0 %	218442329
21	NC_011733	GATT	2	8	8822	8829	25 %	50 %	25 %	0 %	218442329
22	NC_011733	TTTC	2	8	9661	9668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011733	CCTG	2	8	10510	10517	0 %	25 %	25 %	50 %	218442331
24	NC_011733	ATGT	2	8	11412	11419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011733	AAGC	2	8	11696	11703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011733	TCGT	2	8	11726	11733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011733	AGAT	2	8	12335	12342	50 %	25 %	25 %	0 %	218442332
28	NC_011733	ATCT	2	8	12565	12572	25 %	50 %	0 %	25 %	218442332
29	NC_011733	CGTC	2	8	13107	13114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011733	TTTG	2	8	13188	13195	0 %	75 %	25 %	0 %	218442333
31	NC_011733	TTAG	2	8	13647	13654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011733	AACA	2	8	13880	13887	75 %	0 %	0 %	25 %	218442335
33	NC_011733	GCAA	2	8	14357	14364	50 %	0 %	25 %	25 %	218442336
34	NC_011733	TAAG	2	8	14710	14717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011733	AATA	2	8	15067	15074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011733	ACCT	2	8	15103	15110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011733	GATA	2	8	15466	15473	50 %	25 %	25 %	0 %	218442337
38	NC_011733	CAAG	2	8	16453	16460	50 %	0 %	25 %	25 %	218442339
39	NC_011733	GGTA	2	8	16581	16588	25 %	25 %	50 %	0 %	218442339
40	NC_011733	TAAT	2	8	17026	17033	50 %	50 %	0 %	0 %	218442340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.