MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742405

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011733	ATT	2	6	15	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011733	CCT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011733	TAT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011733	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011733	CTC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011733	ATT	2	6	545	550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011733	TGA	2	6	2006	2011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011733	AGA	2	6	2020	2025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011733	CTT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011733	TTA	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011733	TAT	2	6	3480	3485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011733	TAT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011733	ATC	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011733	TTC	2	6	3930	3935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011733	TGC	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011733	GGC	2	6	4225	4230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011733	TAA	2	6	4425	4430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011733	TCT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011733	TCC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011733	TTC	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011733	CTC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011733	TCT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011733	TAC	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011733	TAA	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011733	ATT	2	6	4666	4671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011733	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011733	GAC	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011733	ATT	2	6	4978	4983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011733	CAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011733	TGA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011733	TGG	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011733	AAG	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011733	GTA	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011733	ATA	2	6	5335	5340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011733	TAT	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011733	GTG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011733	AAT	2	6	5508	5513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011733	ATA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011733	GAT	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011733	CTG	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011733	TAT	2	6	5694	5699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011733	CGT	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011733	AAT	2	6	5748	5753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011733	TAA	2	6	5780	5785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011733	ATG	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011733	ATT	2	6	5808	5813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011733	GGC	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011733	TAT	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011733	ACG	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011733	CTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011733	GAT	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011733	CTA	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011733	TAA	2	6	6584	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011733	GGA	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011733	TTG	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011733	AGG	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011733	GAA	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011733	TAG	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011733	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011733	CGA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011733	ATC	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011733	GAG	2	6	6900	6905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011733	AAT	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011733	ATT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011733	GGC	2	6	7094	7099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011733	CCG	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011733	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011733	ATC	2	6	9652	9657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011733	AAT	2	6	9880	9885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011733	CAA	2	6	11015	11020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011733	TTA	2	6	11050	11055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011733	GAT	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011733	TGC	2	6	11342	11347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011733	TTG	2	6	11436	11441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011733	ATT	2	6	11497	11502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011733	TGA	2	6	11559	11564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011733	AGC	2	6	12836	12841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011733	ATA	2	6	12870	12875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011733	ACA	2	6	12880	12885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011733	ATC	2	6	12900	12905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011733	TCG	2	6	12943	12948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011733	GGA	2	6	12963	12968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011733	TCC	2	6	12989	12994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011733	GTA	2	6	13036	13041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011733	TAG	2	6	14660	14665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011733	CAA	2	6	14698	14703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011733	TTG	2	6	14791	14796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011733	TAA	2	6	14907	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011733	AGT	2	6	14981	14986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011733	ATA	2	6	14995	15000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011733	AGC	2	6	15598	15603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011733	TGC	2	6	15625	15630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011733	TTC	2	6	15733	15738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011733	TTA	2	6	15766	15771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011733	ACT	2	6	15839	15844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011733	TCC	2	6	15884	15889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011733	CAA	2	6	15907	15912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011733	TTC	2	6	16603	16608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011733	CAA	2	6	16635	16640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011733	ATT	2	6	17527	17532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011733	TAC	2	6	17604	17609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.