MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	TAAT	2	8	431	438	50 %	50 %	0 %	0 %	218442306
2	NC_011732	AACA	2	8	601	608	75 %	0 %	0 %	25 %	218442306
3	NC_011732	TGCT	2	8	949	956	0 %	50 %	25 %	25 %	218442306
4	NC_011732	AATT	2	8	1141	1148	50 %	50 %	0 %	0 %	218442306
5	NC_011732	CTAA	2	8	1550	1557	50 %	25 %	0 %	25 %	218442306
6	NC_011732	TAGA	2	8	2817	2824	50 %	25 %	25 %	0 %	218442307
7	NC_011732	TTAA	2	8	3439	3446	50 %	50 %	0 %	0 %	218442308
8	NC_011732	GTTT	2	8	3452	3459	0 %	75 %	25 %	0 %	218442308
9	NC_011732	CAAA	2	8	3501	3508	75 %	0 %	0 %	25 %	218442308
10	NC_011732	TCAA	2	8	3741	3748	50 %	25 %	0 %	25 %	218442308
11	NC_011732	AACT	2	8	3839	3846	50 %	25 %	0 %	25 %	218442308
12	NC_011732	TGAT	2	8	3872	3879	25 %	50 %	25 %	0 %	218442308
13	NC_011732	TTAG	2	8	6200	6207	25 %	50 %	25 %	0 %	218442309
14	NC_011732	TAAC	2	8	6843	6850	50 %	25 %	0 %	25 %	218442310
15	NC_011732	ATTC	2	8	7564	7571	25 %	50 %	0 %	25 %	218442311
16	NC_011732	TTAA	2	8	7930	7937	50 %	50 %	0 %	0 %	218442311
17	NC_011732	GAAT	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	218442311
18	NC_011732	TGGA	2	8	8680	8687	25 %	25 %	50 %	0 %	218442311
19	NC_011732	ACTC	2	8	8969	8976	25 %	25 %	0 %	50 %	218442311
20	NC_011732	TGAA	2	8	9206	9213	50 %	25 %	25 %	0 %	218442311
21	NC_011732	TTCA	2	8	9404	9411	25 %	50 %	0 %	25 %	218442311
22	NC_011732	AGAA	2	8	9494	9501	75 %	0 %	25 %	0 %	218442311
23	NC_011732	ATTG	2	8	10089	10096	25 %	50 %	25 %	0 %	218442311
24	NC_011732	GACA	2	8	10374	10381	50 %	0 %	25 %	25 %	218442311
25	NC_011732	ATTG	2	8	10408	10415	25 %	50 %	25 %	0 %	218442311
26	NC_011732	GTTA	2	8	10444	10451	25 %	50 %	25 %	0 %	218442311
27	NC_011732	GCCA	2	8	11879	11886	25 %	0 %	25 %	50 %	218442313
28	NC_011732	ACCA	2	8	12610	12617	50 %	0 %	0 %	50 %	218442314
29	NC_011732	TTAG	2	8	12884	12891	25 %	50 %	25 %	0 %	218442315
30	NC_011732	GTTC	2	8	13311	13318	0 %	50 %	25 %	25 %	218442316
31	NC_011732	AATT	2	8	14302	14309	50 %	50 %	0 %	0 %	218442316
32	NC_011732	TTTA	2	8	14401	14408	25 %	75 %	0 %	0 %	218442316
33	NC_011732	AATT	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	218442318
34	NC_011732	TAAA	2	8	16487	16494	75 %	25 %	0 %	0 %	218442318
35	NC_011732	GATT	2	8	16961	16968	25 %	50 %	25 %	0 %	218442319
36	NC_011732	TTCT	2	8	17060	17067	0 %	75 %	0 %	25 %	218442319
37	NC_011732	CAAT	2	8	18065	18072	50 %	25 %	0 %	25 %	218442320
38	NC_011732	GCCT	2	8	18644	18651	0 %	25 %	25 %	50 %	218442321
39	NC_011732	AAGC	2	8	18916	18923	50 %	0 %	25 %	25 %	218442321
40	NC_011732	GTTA	2	8	19407	19414	25 %	50 %	25 %	0 %	218442322
41	NC_011732	AAGA	2	8	19617	19624	75 %	0 %	25 %	0 %	218442322
42	NC_011732	TGTC	2	8	20233	20240	0 %	50 %	25 %	25 %	218442322
43	NC_011732	TGCT	2	8	20273	20280	0 %	50 %	25 %	25 %	218442322
44	NC_011732	ATTG	2	8	20525	20532	25 %	50 %	25 %	0 %	218442323
45	NC_011732	AATT	2	8	20648	20655	50 %	50 %	0 %	0 %	218442323
46	NC_011732	AATA	2	8	21061	21068	75 %	25 %	0 %	0 %	218442323
47	NC_011732	TCGC	2	8	21285	21292	0 %	25 %	25 %	50 %	218442323
48	NC_011732	CTTC	2	8	21697	21704	0 %	50 %	0 %	50 %	218442324
49	NC_011732	TAAT	2	8	21715	21722	50 %	50 %	0 %	0 %	218442324

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.