MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	AT	3	6	2436	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011732	AT	3	6	2622	2627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011732	GA	3	6	2721	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	218442307
4	NC_011732	TG	3	6	2856	2861	0 %	50 %	50 %	0 %	218442307
5	NC_011732	AT	3	6	3547	3552	50 %	50 %	0 %	0 %	218442308
6	NC_011732	GT	3	6	4692	4697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011732	CT	3	6	4755	4760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011732	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011732	CA	3	6	4926	4931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011732	AT	3	6	5326	5331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011732	GT	3	6	5893	5898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011732	CT	3	6	6340	6345	0 %	50 %	0 %	50 %	218442309
13	NC_011732	AG	3	6	6561	6566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011732	TG	3	6	6643	6648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011732	AT	3	6	7449	7454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011732	TA	3	6	8839	8844	50 %	50 %	0 %	0 %	218442311
17	NC_011732	AG	3	6	8917	8922	50 %	0 %	50 %	0 %	218442311
18	NC_011732	TG	3	6	9374	9379	0 %	50 %	50 %	0 %	218442311
19	NC_011732	CT	3	6	9538	9543	0 %	50 %	0 %	50 %	218442311
20	NC_011732	CA	3	6	10380	10385	50 %	0 %	0 %	50 %	218442311
21	NC_011732	GT	5	10	10552	10561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011732	TG	3	6	11126	11131	0 %	50 %	50 %	0 %	218442312
23	NC_011732	GA	3	6	11966	11971	50 %	0 %	50 %	0 %	218442313
24	NC_011732	CT	3	6	12831	12836	0 %	50 %	0 %	50 %	218442315
25	NC_011732	GT	3	6	12865	12870	0 %	50 %	50 %	0 %	218442315
26	NC_011732	AG	3	6	13720	13725	50 %	0 %	50 %	0 %	218442316
27	NC_011732	GT	3	6	13845	13850	0 %	50 %	50 %	0 %	218442316
28	NC_011732	AG	3	6	15495	15500	50 %	0 %	50 %	0 %	218442317
29	NC_011732	AT	3	6	16200	16205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011732	AG	3	6	16271	16276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011732	AG	3	6	16316	16321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011732	AG	3	6	16630	16635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011732	TA	3	6	18434	18439	50 %	50 %	0 %	0 %	218442320
34	NC_011732	AT	4	8	18589	18596	50 %	50 %	0 %	0 %	218442320
35	NC_011732	AT	3	6	19366	19371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011732	TC	3	6	20004	20009	0 %	50 %	0 %	50 %	218442322
37	NC_011732	TA	3	6	20093	20098	50 %	50 %	0 %	0 %	218442322
38	NC_011732	AG	3	6	20671	20676	50 %	0 %	50 %	0 %	218442323
39	NC_011732	CT	3	6	20718	20723	0 %	50 %	0 %	50 %	218442323
40	NC_011732	GA	3	6	21321	21326	50 %	0 %	50 %	0 %	218442323
41	NC_011732	TA	3	6	21972	21977	50 %	50 %	0 %	0 %	218442324

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.