MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011731	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442282
3	NC_011731	GAATTT	2	12	5206	5217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442298
4	NC_011731	TGAACT	2	12	5244	5255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442298
5	NC_011731	AATGGA	2	12	6893	6904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218442272
6	NC_011731	TAGAAT	2	12	11825	11836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442292
7	NC_011731	AGACAC	2	12	13493	13504	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011731	ATTACT	2	12	13554	13565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011731	TATTGA	2	12	13607	13618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011731	ACAGAA	2	12	13682	13693	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011731	TAAAAA	2	12	15102	15113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011731	CAAAAG	2	12	15921	15932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218442294
13	NC_011731	AGTTAA	2	12	16183	16194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442293
14	NC_011731	CAAAAA	2	12	17518	17529	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218442274
15	NC_011731	AAAAGA	2	12	17586	17597	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442274
16	NC_011731	ATAAAA	2	12	17850	17861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011731	TTTTCG	2	12	18363	18374	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442288
18	NC_011731	AATAAA	2	12	21712	21723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218442277
19	NC_011731	ATATGT	2	12	23238	23249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011731	TAGTGT	2	12	24731	24742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218442304
21	NC_011731	CAAAAA	2	12	26094	26105	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011731	AAAATA	2	12	26454	26465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218442289
23	NC_011731	TAAAGA	2	12	26894	26905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218442289
24	NC_011731	AGAATC	2	12	27005	27016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218442289
25	NC_011731	GAAAAA	2	12	27867	27878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442287

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.