MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442282
2	NC_011731	GAATTT	2	12	5206	5217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218442298
3	NC_011731	TGAACT	2	12	5244	5255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218442298
4	NC_011731	AATGGA	2	12	6893	6904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218442272
5	NC_011731	TAGAAT	2	12	11825	11836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442292
6	NC_011731	CAAAAG	2	12	15921	15932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218442294
7	NC_011731	AGTTAA	2	12	16183	16194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218442293
8	NC_011731	CAAAAA	2	12	17518	17529	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218442274
9	NC_011731	AAAAGA	2	12	17586	17597	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442274
10	NC_011731	TTTTCG	2	12	18363	18374	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218442288
11	NC_011731	AATAAA	2	12	21712	21723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218442277
12	NC_011731	TAGTGT	2	12	24731	24742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218442304
13	NC_011731	AAAATA	2	12	26454	26465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218442289
14	NC_011731	TAAAGA	2	12	26894	26905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218442289
15	NC_011731	AGAATC	2	12	27005	27016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218442289
16	NC_011731	GAAAAA	2	12	27867	27878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218442287

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.