MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	218442279
2	NC_011731	ATAC	2	8	1931	1938	50 %	25 %	0 %	25 %	218442279
3	NC_011731	AAGA	2	8	2383	2390	75 %	0 %	25 %	0 %	218442299
4	NC_011731	ATTT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	218442299
5	NC_011731	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	218442299
6	NC_011731	GCAA	2	8	2679	2686	50 %	0 %	25 %	25 %	218442282
7	NC_011731	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	218442282
8	NC_011731	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	218442282
9	NC_011731	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	218442282
10	NC_011731	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	218442282
11	NC_011731	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	218442280
12	NC_011731	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	218442280
13	NC_011731	AGTA	2	8	4785	4792	50 %	25 %	25 %	0 %	218442286
14	NC_011731	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	218442286
15	NC_011731	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	218442286
16	NC_011731	TACT	2	8	5153	5160	25 %	50 %	0 %	25 %	218442298
17	NC_011731	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	218442298
18	NC_011731	AAGT	2	8	6064	6071	50 %	25 %	25 %	0 %	218442273
19	NC_011731	TAAT	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	218442283
20	NC_011731	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	218442272
21	NC_011731	GCTG	2	8	7333	7340	0 %	25 %	50 %	25 %	218442272
22	NC_011731	GATT	2	8	7653	7660	25 %	50 %	25 %	0 %	218442272
23	NC_011731	ATTT	2	8	8495	8502	25 %	75 %	0 %	0 %	218442284
24	NC_011731	TGAG	2	8	8599	8606	25 %	25 %	50 %	0 %	218442284
25	NC_011731	CTTG	2	8	8797	8804	0 %	50 %	25 %	25 %	218442291
26	NC_011731	AATT	2	8	8943	8950	50 %	50 %	0 %	0 %	218442291
27	NC_011731	CAAG	2	8	9612	9619	50 %	0 %	25 %	25 %	218442271
28	NC_011731	TAAT	2	8	10090	10097	50 %	50 %	0 %	0 %	218442271
29	NC_011731	TGGA	2	8	10157	10164	25 %	25 %	50 %	0 %	218442271
30	NC_011731	CTTT	2	8	10612	10619	0 %	75 %	0 %	25 %	218442270
31	NC_011731	GGCA	2	8	11277	11284	25 %	0 %	50 %	25 %	218442290
32	NC_011731	GAAT	2	8	11860	11867	50 %	25 %	25 %	0 %	218442292
33	NC_011731	TCAA	2	8	12083	12090	50 %	25 %	0 %	25 %	218442292
34	NC_011731	TCAG	2	8	12327	12334	25 %	25 %	25 %	25 %	218442292
35	NC_011731	AATT	2	8	12356	12363	50 %	50 %	0 %	0 %	218442292
36	NC_011731	GAAT	2	8	14543	14550	50 %	25 %	25 %	0 %	218442303
37	NC_011731	TACA	2	8	14927	14934	50 %	25 %	0 %	25 %	218442303
38	NC_011731	TCAA	2	8	15571	15578	50 %	25 %	0 %	25 %	218442297
39	NC_011731	AGGA	2	8	15643	15650	50 %	0 %	50 %	0 %	218442297
40	NC_011731	CTAT	2	8	15655	15662	25 %	50 %	0 %	25 %	218442297
41	NC_011731	AATA	2	8	15671	15678	75 %	25 %	0 %	0 %	218442297
42	NC_011731	TAAC	2	8	15725	15732	50 %	25 %	0 %	25 %	218442294
43	NC_011731	ATAG	2	8	16657	16664	50 %	25 %	25 %	0 %	218442301
44	NC_011731	ATAG	2	8	16723	16730	50 %	25 %	25 %	0 %	218442301
45	NC_011731	AGAT	2	8	16742	16749	50 %	25 %	25 %	0 %	218442301
46	NC_011731	TACA	2	8	17406	17413	50 %	25 %	0 %	25 %	218442274
47	NC_011731	ATTG	2	8	17629	17636	25 %	50 %	25 %	0 %	218442274
48	NC_011731	TCTT	2	8	17939	17946	0 %	75 %	0 %	25 %	218442288
49	NC_011731	CTTG	2	8	18343	18350	0 %	50 %	25 %	25 %	218442288
50	NC_011731	AAGA	3	12	19708	19719	75 %	0 %	25 %	0 %	218442275
51	NC_011731	AAAT	2	8	19862	19869	75 %	25 %	0 %	0 %	218442275
52	NC_011731	TAAA	2	8	19888	19895	75 %	25 %	0 %	0 %	218442275
53	NC_011731	TCTT	2	8	19896	19903	0 %	75 %	0 %	25 %	218442275
54	NC_011731	AGAA	2	8	19948	19955	75 %	0 %	25 %	0 %	218442275
55	NC_011731	CAAA	2	8	19958	19965	75 %	0 %	0 %	25 %	218442275
56	NC_011731	GAAA	2	8	20103	20110	75 %	0 %	25 %	0 %	218442275
57	NC_011731	TTGA	2	8	20445	20452	25 %	50 %	25 %	0 %	218442276
58	NC_011731	AAAT	2	8	20677	20684	75 %	25 %	0 %	0 %	218442276
59	NC_011731	TTTA	2	8	20822	20829	25 %	75 %	0 %	0 %	218442276
60	NC_011731	TCAA	2	8	20942	20949	50 %	25 %	0 %	25 %	218442285
61	NC_011731	ATTA	2	8	21694	21701	50 %	50 %	0 %	0 %	218442277
62	NC_011731	AAAG	2	8	22133	22140	75 %	0 %	25 %	0 %	218442277
63	NC_011731	AGAT	2	8	22461	22468	50 %	25 %	25 %	0 %	218442278
64	NC_011731	ATAG	2	8	22745	22752	50 %	25 %	25 %	0 %	218442278
65	NC_011731	AGAT	2	8	22818	22825	50 %	25 %	25 %	0 %	218442278
66	NC_011731	TAAG	2	8	23566	23573	50 %	25 %	25 %	0 %	218442304
67	NC_011731	AGAT	2	8	24662	24669	50 %	25 %	25 %	0 %	218442304
68	NC_011731	AAAT	2	8	25386	25393	75 %	25 %	0 %	0 %	218442295
69	NC_011731	TAAA	2	8	25401	25408	75 %	25 %	0 %	0 %	218442295
70	NC_011731	ACCA	2	8	25770	25777	50 %	0 %	0 %	50 %	218442295
71	NC_011731	AGAA	2	8	26576	26583	75 %	0 %	25 %	0 %	218442289
72	NC_011731	TTGT	2	8	27680	27687	0 %	75 %	25 %	0 %	218442287
73	NC_011731	CTAT	2	8	27695	27702	25 %	50 %	0 %	25 %	218442287
74	NC_011731	AAGG	2	8	28013	28020	50 %	0 %	50 %	0 %	218442287
75	NC_011731	TAAA	2	8	28785	28792	75 %	25 %	0 %	0 %	218442281
76	NC_011731	CAAG	2	8	28810	28817	50 %	0 %	25 %	25 %	218442281
77	NC_011731	AATT	2	8	28831	28838	50 %	50 %	0 %	0 %	218442281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.