MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011731	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011731	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011731	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011731	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011731	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011731	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011731	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011731	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011731	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011731	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011731	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011731	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011731	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011731	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011731	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011731	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011731	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011731	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011731	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011731	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442279
22	NC_011731	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442279
23	NC_011731	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442279
24	NC_011731	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442279
25	NC_011731	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442279
26	NC_011731	TTA	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442279
27	NC_011731	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442279
28	NC_011731	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442299
29	NC_011731	TGG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442299
30	NC_011731	AAC	2	6	2253	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442299
31	NC_011731	TGG	3	9	2277	2285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442299
32	NC_011731	TAA	2	6	2569	2574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442299
33	NC_011731	GCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442282
34	NC_011731	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442282
35	NC_011731	AGT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442282
36	NC_011731	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442282
37	NC_011731	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442282
38	NC_011731	TGG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442282
39	NC_011731	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011731	AAG	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442280
41	NC_011731	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442280
42	NC_011731	TGG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442280
43	NC_011731	CTA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442280
44	NC_011731	AAT	2	6	3729	3734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442280
45	NC_011731	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442280
46	NC_011731	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442280
47	NC_011731	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011731	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
49	NC_011731	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442286
50	NC_011731	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
51	NC_011731	TAT	2	6	4034	4039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
52	NC_011731	ACA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442286
53	NC_011731	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
54	NC_011731	TAA	3	9	4289	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442286
55	NC_011731	AGT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442286
56	NC_011731	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
57	NC_011731	TTA	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
58	NC_011731	GCT	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442286
59	NC_011731	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442286
60	NC_011731	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442286
61	NC_011731	CGA	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442286
62	NC_011731	GAT	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442286
63	NC_011731	GCA	3	9	4617	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442286
64	NC_011731	GCA	2	6	4632	4637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442286
65	NC_011731	AGT	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442286
66	NC_011731	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442286
67	NC_011731	AGA	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442286
68	NC_011731	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442286
69	NC_011731	CTA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442286
70	NC_011731	GAA	3	9	4984	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442298
71	NC_011731	GTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442298
72	NC_011731	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442298
73	NC_011731	TAG	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442298
74	NC_011731	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442298
75	NC_011731	GGC	2	6	5290	5295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442298
76	NC_011731	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442269
77	NC_011731	TTC	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442269
78	NC_011731	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442269
79	NC_011731	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442273
80	NC_011731	TAG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442273
81	NC_011731	AAT	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442273
82	NC_011731	CTA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442273
83	NC_011731	GTA	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442273
84	NC_011731	GCA	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442273
85	NC_011731	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442273
86	NC_011731	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442283
87	NC_011731	CAT	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442283
88	NC_011731	ATC	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442283
89	NC_011731	GCT	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442283
90	NC_011731	ATA	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442283
91	NC_011731	TAA	2	6	6549	6554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442283
92	NC_011731	AGG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442283
93	NC_011731	TAG	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442272
94	NC_011731	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442272
95	NC_011731	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442272
96	NC_011731	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442272
97	NC_011731	TAA	2	6	6853	6858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442272
98	NC_011731	GAA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442272
99	NC_011731	TGT	2	6	7060	7065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442272
100	NC_011731	TTA	2	6	7068	7073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442272
101	NC_011731	GAT	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442272
102	NC_011731	TAA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442272
103	NC_011731	CAA	2	6	7243	7248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442272
104	NC_011731	TTG	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442272
105	NC_011731	CTT	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442272
106	NC_011731	AAG	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442272
107	NC_011731	ATT	2	6	7517	7522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442272
108	NC_011731	ATA	2	6	7548	7553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442272
109	NC_011731	GTG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442272
110	NC_011731	TCT	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442272
111	NC_011731	ACT	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442272
112	NC_011731	TGG	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442296
113	NC_011731	ACA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442296
114	NC_011731	TAG	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442296
115	NC_011731	TAA	2	6	7960	7965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442296
116	NC_011731	TGA	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442296
117	NC_011731	ACA	2	6	8068	8073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442296
118	NC_011731	ATT	2	6	8136	8141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442296
119	NC_011731	AAG	2	6	8174	8179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442296
120	NC_011731	TTA	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442296
121	NC_011731	ACA	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442296
122	NC_011731	TTA	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442284
123	NC_011731	TTG	2	6	8521	8526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442284
124	NC_011731	AAT	2	6	8528	8533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442284
125	NC_011731	AAT	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442284
126	NC_011731	TTG	2	6	8629	8634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442284
127	NC_011731	TCA	2	6	8688	8693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442284
128	NC_011731	TGA	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442291
129	NC_011731	TAC	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442291
130	NC_011731	TGC	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442271
131	NC_011731	TAG	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442271
132	NC_011731	AGA	2	6	9261	9266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442271
133	NC_011731	TTG	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442271
134	NC_011731	GGA	2	6	9435	9440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442271
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261	NC_011731	TAA	2	6	18882	18887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_011731	TAT	3	9	18999	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_011731	TGT	2	6	30272	30277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.