MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011731	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011731	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011731	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011731	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011731	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011731	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011731	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011731	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011731	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011731	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011731	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011731	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011731	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011731	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011731	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011731	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011731	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011731	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011731	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011731	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011731	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011731	AAT	2	6	12437	12442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011731	TAA	2	6	12457	12462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011731	TTG	2	6	12474	12479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011731	TGA	2	6	12487	12492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011731	CTC	2	6	12548	12553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011731	TAA	2	6	12659	12664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011731	ACT	2	6	12673	12678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011731	ACA	2	6	12686	12691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011731	TGA	2	6	12851	12856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011731	ATT	2	6	12879	12884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011731	TCT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011731	GAA	3	9	12906	12914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011731	GCT	2	6	12972	12977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011731	GAA	2	6	12981	12986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011731	TTC	2	6	12992	12997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011731	CTA	2	6	13135	13140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011731	AAC	2	6	13187	13192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011731	ATT	2	6	13380	13385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011731	GAT	2	6	13566	13571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011731	TAC	2	6	13589	13594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011731	TGA	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011731	TAC	2	6	13949	13954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011731	TAA	2	6	13993	13998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011731	TAC	2	6	14009	14014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011731	TTA	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011731	ATT	2	6	14166	14171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011731	TAA	2	6	14195	14200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011731	AAC	2	6	14229	14234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011731	ATA	2	6	16439	16444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011731	CTA	2	6	17095	17100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011731	ATA	2	6	17126	17131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011731	TAA	2	6	17155	17160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011731	TAA	3	9	17177	17185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011731	ATT	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011731	AGC	2	6	17882	17887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011731	TAA	2	6	18882	18887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011731	CTT	2	6	18919	18924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011731	TAT	3	9	18999	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011731	ATA	2	6	19045	19050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011731	TAA	2	6	19151	19156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011731	TAT	2	6	22993	22998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011731	TTA	2	6	23146	23151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011731	TAA	2	6	23172	23177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011731	ATA	2	6	23192	23197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011731	AAG	2	6	23362	23367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011731	AGG	2	6	24791	24796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011731	ATT	2	6	26401	26406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011731	TAT	2	6	27541	27546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011731	TAA	2	6	28324	28329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011731	ATA	2	6	28331	28336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011731	ACA	2	6	29005	29010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011731	TTC	2	6	29073	29078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011731	GAA	2	6	29098	29103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011731	AAT	2	6	29152	29157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011731	GCG	2	6	29177	29182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011731	AAT	2	6	29269	29274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011731	TAT	2	6	29277	29282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011731	CTT	2	6	29344	29349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011731	TGG	2	6	29421	29426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011731	AGG	2	6	29519	29524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011731	TAT	2	6	29556	29561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011731	ATC	2	6	29579	29584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011731	ATA	2	6	29615	29620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011731	CAT	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011731	TGA	2	6	29793	29798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011731	GGA	2	6	29848	29853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011731	TGA	2	6	29886	29891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011731	TAT	2	6	29896	29901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011731	TAT	2	6	29943	29948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011731	ATA	2	6	30011	30016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011731	TGG	2	6	30027	30032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011731	ATA	2	6	30062	30067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011731	TAA	2	6	30108	30113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011731	AAC	2	6	30126	30131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011731	AGT	2	6	30178	30183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011731	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011731	ATG	3	9	30233	30241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011731	GCA	2	6	30259	30264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011731	TGT	2	6	30272	30277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.