MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	218442279
2	NC_011731	GT	3	6	2302	2307	0 %	50 %	50 %	0 %	218442299
3	NC_011731	CA	3	6	2501	2506	50 %	0 %	0 %	50 %	218442299
4	NC_011731	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	218442282
5	NC_011731	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	218442282
6	NC_011731	AT	3	6	4274	4279	50 %	50 %	0 %	0 %	218442286
7	NC_011731	TG	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	218442298
8	NC_011731	AG	3	6	5524	5529	50 %	0 %	50 %	0 %	218442269
9	NC_011731	AT	3	6	5917	5922	50 %	50 %	0 %	0 %	218442273
10	NC_011731	TA	3	6	5933	5938	50 %	50 %	0 %	0 %	218442273
11	NC_011731	AT	4	8	6409	6416	50 %	50 %	0 %	0 %	218442283
12	NC_011731	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	218442272
13	NC_011731	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	218442272
14	NC_011731	AG	3	6	9171	9176	50 %	0 %	50 %	0 %	218442271
15	NC_011731	AG	3	6	9539	9544	50 %	0 %	50 %	0 %	218442271
16	NC_011731	AT	3	6	9815	9820	50 %	50 %	0 %	0 %	218442271
17	NC_011731	AT	3	6	10419	10424	50 %	50 %	0 %	0 %	218442270
18	NC_011731	TA	3	6	10598	10603	50 %	50 %	0 %	0 %	218442270
19	NC_011731	TA	4	8	10719	10726	50 %	50 %	0 %	0 %	218442270
20	NC_011731	AT	3	6	11122	11127	50 %	50 %	0 %	0 %	218442290
21	NC_011731	TA	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	218442290
22	NC_011731	CA	3	6	11655	11660	50 %	0 %	0 %	50 %	218442290
23	NC_011731	CA	3	6	12021	12026	50 %	0 %	0 %	50 %	218442292
24	NC_011731	TA	3	6	12144	12149	50 %	50 %	0 %	0 %	218442292
25	NC_011731	AT	3	6	15400	15405	50 %	50 %	0 %	0 %	218442297
26	NC_011731	AT	3	6	15810	15815	50 %	50 %	0 %	0 %	218442294
27	NC_011731	AT	3	6	15978	15983	50 %	50 %	0 %	0 %	218442294
28	NC_011731	AT	3	6	16283	16288	50 %	50 %	0 %	0 %	218442293
29	NC_011731	AT	3	6	16510	16515	50 %	50 %	0 %	0 %	218442301
30	NC_011731	AT	3	6	16775	16780	50 %	50 %	0 %	0 %	218442301
31	NC_011731	AT	3	6	16829	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	218442301
32	NC_011731	AT	3	6	16883	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	218442301
33	NC_011731	AT	3	6	17726	17731	50 %	50 %	0 %	0 %	218442274
34	NC_011731	AT	3	6	17923	17928	50 %	50 %	0 %	0 %	218442288
35	NC_011731	TA	3	6	20270	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	218442275
36	NC_011731	TA	3	6	20857	20862	50 %	50 %	0 %	0 %	218442276
37	NC_011731	TA	3	6	21106	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	218442285
38	NC_011731	TA	3	6	21596	21601	50 %	50 %	0 %	0 %	218442285
39	NC_011731	AG	3	6	21850	21855	50 %	0 %	50 %	0 %	218442277
40	NC_011731	AT	3	6	22440	22445	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
41	NC_011731	AT	3	6	22494	22499	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
42	NC_011731	AT	3	6	22548	22553	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
43	NC_011731	AT	3	6	22602	22607	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
44	NC_011731	AT	3	6	22656	22661	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
45	NC_011731	AT	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	218442278
46	NC_011731	AG	3	6	24276	24281	50 %	0 %	50 %	0 %	218442304
47	NC_011731	AT	3	6	24580	24585	50 %	50 %	0 %	0 %	218442304
48	NC_011731	AT	3	6	24969	24974	50 %	50 %	0 %	0 %	218442302
49	NC_011731	AG	3	6	25291	25296	50 %	0 %	50 %	0 %	218442295
50	NC_011731	CT	3	6	27398	27403	0 %	50 %	0 %	50 %	218442289
51	NC_011731	AG	3	6	27482	27487	50 %	0 %	50 %	0 %	218442289
52	NC_011731	AT	3	6	27836	27841	50 %	50 %	0 %	0 %	218442287
53	NC_011731	AT	3	6	27958	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	218442287
54	NC_011731	AT	3	6	28158	28163	50 %	50 %	0 %	0 %	218442287
55	NC_011731	TG	3	6	28519	28524	0 %	50 %	50 %	0 %	218442281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.