MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	ACCA	2	8	1172	1179	50 %	0 %	0 %	50 %	218442243
2	NC_011730	GTGA	2	8	1329	1336	25 %	25 %	50 %	0 %	218442243
3	NC_011730	GAAA	2	8	1845	1852	75 %	0 %	25 %	0 %	218442244
4	NC_011730	ACAG	2	8	2161	2168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011730	TCGC	2	8	2260	2267	0 %	25 %	25 %	50 %	218442245
6	NC_011730	TATT	2	8	2367	2374	25 %	75 %	0 %	0 %	218442246
7	NC_011730	TTAA	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	218442246
8	NC_011730	GTTC	2	8	3207	3214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011730	CCTA	2	8	3752	3759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011730	TTCG	2	8	3995	4002	0 %	50 %	25 %	25 %	218442248
11	NC_011730	AATT	2	8	4006	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	218442248
12	NC_011730	TCTT	2	8	4867	4874	0 %	75 %	0 %	25 %	218442250
13	NC_011730	TAAT	2	8	5122	5129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011730	TCAA	2	8	5799	5806	50 %	25 %	0 %	25 %	218442251
15	NC_011730	AAAC	2	8	6074	6081	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
16	NC_011730	GAAG	2	8	6391	6398	50 %	0 %	50 %	0 %	218442251
17	NC_011730	ACAA	2	8	6559	6566	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
18	NC_011730	AGAA	2	8	7122	7129	75 %	0 %	25 %	0 %	218442251
19	NC_011730	AATG	2	8	7252	7259	50 %	25 %	25 %	0 %	218442251
20	NC_011730	ACAA	2	8	7497	7504	75 %	0 %	0 %	25 %	218442251
21	NC_011730	TAAA	2	8	8133	8140	75 %	25 %	0 %	0 %	218442251
22	NC_011730	CAAC	2	8	8290	8297	50 %	0 %	0 %	50 %	218442251
23	NC_011730	TTGT	2	8	8648	8655	0 %	75 %	25 %	0 %	218442251
24	NC_011730	ATAA	2	8	9033	9040	75 %	25 %	0 %	0 %	218442252
25	NC_011730	CCTG	2	8	9285	9292	0 %	25 %	25 %	50 %	218442252
26	NC_011730	TTGA	2	8	9649	9656	25 %	50 %	25 %	0 %	218442252
27	NC_011730	TGAT	2	8	10125	10132	25 %	50 %	25 %	0 %	218442252
28	NC_011730	AATT	2	8	10147	10154	50 %	50 %	0 %	0 %	218442252
29	NC_011730	TTGG	2	8	10217	10224	0 %	50 %	50 %	0 %	218442252
30	NC_011730	GAGG	2	8	10530	10537	25 %	0 %	75 %	0 %	218442252
31	NC_011730	AGAA	2	8	11342	11349	75 %	0 %	25 %	0 %	218442252
32	NC_011730	ATTA	2	8	11946	11953	50 %	50 %	0 %	0 %	218442253
33	NC_011730	TGTC	2	8	12530	12537	0 %	50 %	25 %	25 %	218442253
34	NC_011730	GATG	2	8	13010	13017	25 %	25 %	50 %	0 %	218442253
35	NC_011730	GTGG	2	8	13469	13476	0 %	25 %	75 %	0 %	218442254
36	NC_011730	TAAC	2	8	13600	13607	50 %	25 %	0 %	25 %	218442254
37	NC_011730	AGAA	2	8	13622	13629	75 %	0 %	25 %	0 %	218442254
38	NC_011730	TATG	2	8	13657	13664	25 %	50 %	25 %	0 %	218442254
39	NC_011730	ATGG	2	8	13670	13677	25 %	25 %	50 %	0 %	218442254
40	NC_011730	AATG	2	8	14235	14242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011730	TCTT	2	8	15440	15447	0 %	75 %	0 %	25 %	218442256
42	NC_011730	ATTA	2	8	15534	15541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011730	GAAA	2	8	15555	15562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011730	CAAG	2	8	16060	16067	50 %	0 %	25 %	25 %	218442258
45	NC_011730	CCCA	2	8	17166	17173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011730	GTTT	2	8	17509	17516	0 %	75 %	25 %	0 %	218442259
47	NC_011730	TTAA	2	8	17592	17599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011730	TTAA	2	8	17742	17749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011730	TTAA	2	8	18095	18102	50 %	50 %	0 %	0 %	218442260
50	NC_011730	AGTA	2	8	18206	18213	50 %	25 %	25 %	0 %	218442260
51	NC_011730	ATTA	2	8	18889	18896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011730	TGCT	2	8	19169	19176	0 %	50 %	25 %	25 %	218442261
53	NC_011730	TTAC	2	8	19736	19743	25 %	50 %	0 %	25 %	218442261
54	NC_011730	TCAA	2	8	19777	19784	50 %	25 %	0 %	25 %	218442261
55	NC_011730	ATCA	2	8	19875	19882	50 %	25 %	0 %	25 %	218442261
56	NC_011730	TCTT	2	8	20313	20320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011730	CAAG	2	8	20417	20424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011730	AAAG	2	8	20517	20524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011730	ATGT	2	8	20751	20758	25 %	50 %	25 %	0 %	218442262
60	NC_011730	CAAG	2	8	20855	20862	50 %	0 %	25 %	25 %	218442262
61	NC_011730	TTAA	2	8	20954	20961	50 %	50 %	0 %	0 %	218442262
62	NC_011730	TCAT	2	8	21414	21421	25 %	50 %	0 %	25 %	218442263
63	NC_011730	ATCA	2	8	21641	21648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011730	TAGA	2	8	23304	23311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011730	CGCT	2	8	23895	23902	0 %	25 %	25 %	50 %	218442266
66	NC_011730	CTAT	2	8	25392	25399	25 %	50 %	0 %	25 %	218442267
67	NC_011730	CCGT	2	8	25944	25951	0 %	25 %	25 %	50 %	218442267
68	NC_011730	CAAA	2	8	26119	26126	75 %	0 %	0 %	25 %	218442267
69	NC_011730	TTGG	2	8	26201	26208	0 %	50 %	50 %	0 %	218442267
70	NC_011730	CAAA	2	8	26278	26285	75 %	0 %	0 %	25 %	218442267
71	NC_011730	AATC	2	8	26442	26449	50 %	25 %	0 %	25 %	218442267
72	NC_011730	AGAA	2	8	27067	27074	75 %	0 %	25 %	0 %	218442267
73	NC_011730	TCTT	2	8	28700	28707	0 %	75 %	0 %	25 %	218442267
74	NC_011730	TGTT	2	8	29131	29138	0 %	75 %	25 %	0 %	218442267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.