MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TTC	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011730	CGG	2	6	143	148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011730	ATT	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011730	AGT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011730	TAG	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442242
6	NC_011730	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442242
7	NC_011730	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
8	NC_011730	TGT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
9	NC_011730	GTC	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442242
10	NC_011730	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442242
11	NC_011730	GAC	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442242
12	NC_011730	TTC	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011730	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011730	TGT	2	6	849	854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011730	TGA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
16	NC_011730	CGT	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442243
17	NC_011730	GCC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442243
18	NC_011730	TGA	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
19	NC_011730	GAT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
20	NC_011730	TTC	2	6	1294	1299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
21	NC_011730	GGA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442243
22	NC_011730	TTA	2	6	1428	1433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442243
23	NC_011730	GCG	2	6	1557	1562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442243
24	NC_011730	TTC	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
25	NC_011730	CGA	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442243
26	NC_011730	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442244
27	NC_011730	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442244
28	NC_011730	ACG	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442244
29	NC_011730	AGA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442244
30	NC_011730	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011730	AAG	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011730	TCT	2	6	2230	2235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011730	CGA	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442245
34	NC_011730	TAA	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
35	NC_011730	GTT	2	6	2325	2330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442245
36	NC_011730	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
37	NC_011730	GTT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
38	NC_011730	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
39	NC_011730	TGT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
40	NC_011730	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442246
41	NC_011730	TTC	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
42	NC_011730	CTG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
43	NC_011730	AAT	2	6	2693	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
44	NC_011730	GAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442246
45	NC_011730	CTT	2	6	2724	2729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
46	NC_011730	GTT	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
47	NC_011730	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
48	NC_011730	ACT	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442246
49	NC_011730	TTG	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
50	NC_011730	CGT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011730	AAC	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011730	ACA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011730	ACT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011730	TCT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011730	CAG	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011730	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011730	ACA	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011730	ACA	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011730	AAG	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011730	GAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
61	NC_011730	ATG	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
62	NC_011730	TCT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442247
63	NC_011730	AGA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442247
64	NC_011730	TTA	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442247
65	NC_011730	TCA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442248
66	NC_011730	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442248
67	NC_011730	CTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442248
68	NC_011730	ATT	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
69	NC_011730	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442249
70	NC_011730	TAC	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442249
71	NC_011730	ATT	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
72	NC_011730	CTG	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442249
73	NC_011730	TTC	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442250
74	NC_011730	TCA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442250
75	NC_011730	GCA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442250
76	NC_011730	ACC	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442250
77	NC_011730	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442250
78	NC_011730	GAA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442250
79	NC_011730	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011730	CTC	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011730	ATT	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
82	NC_011730	AAC	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
83	NC_011730	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
84	NC_011730	GCC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442251
85	NC_011730	CCA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
86	NC_011730	CGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
87	NC_011730	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
88	NC_011730	TTA	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
89	NC_011730	GAT	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
90	NC_011730	GTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
91	NC_011730	TAC	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
92	NC_011730	AAC	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
93	NC_011730	ATT	2	6	6461	6466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
94	NC_011730	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
95	NC_011730	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442251
96	NC_011730	GCG	2	6	6710	6715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442251
97	NC_011730	TCT	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
98	NC_011730	TAG	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
99	NC_011730	TCA	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
100	NC_011730	TAA	3	9	6874	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
101	NC_011730	AAC	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
102	NC_011730	CTC	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
103	NC_011730	CAC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
104	NC_011730	TAG	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
105	NC_011730	TAC	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
106	NC_011730	ATT	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
107	NC_011730	TAG	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
108	NC_011730	ATT	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
109	NC_011730	GCA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
110	NC_011730	AGA	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
111	NC_011730	ATC	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
112	NC_011730	CAT	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
113	NC_011730	CCT	2	6	8031	8036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
114	NC_011730	CTT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
115	NC_011730	GAA	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
116	NC_011730	CAT	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
117	NC_011730	AAC	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
118	NC_011730	AAT	2	6	8281	8286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
119	NC_011730	GAA	2	6	8411	8416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
120	NC_011730	GAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
121	NC_011730	AAG	2	6	8496	8501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
122	NC_011730	GAA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
123	NC_011730	AGA	2	6	8557	8562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
124	NC_011730	CAG	2	6	8597	8602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
125	NC_011730	ATG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
126	NC_011730	ATA	2	6	8664	8669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
127	NC_011730	GGA	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442251
128	NC_011730	ATT	2	6	8684	8689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
129	NC_011730	AGA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
130	NC_011730	GAT	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011730	TGA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011730	AAT	2	6	8901	8906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011730	TGC	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011730	TTG	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
135	NC_011730	TCC	2	6	8997	9002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442252
136	NC_011730	CCG	2	6	9058	9063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442252
137	NC_011730	GAC	2	6	9079	9084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442252
138	NC_011730	TAA	2	6	9088	9093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
139	NC_011730	CTT	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
140	NC_011730	CTT	2	6	9328	9333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
141	NC_011730	AAT	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
142	NC_011730	AAG	2	6	9440	9445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
143	NC_011730	AAT	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
144	NC_011730	CTA	2	6	9711	9716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
145	NC_011730	ATC	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
146	NC_011730	TCA	2	6	9762	9767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
147	NC_011730	GAA	2	6	9876	9881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
148	NC_011730	CAT	2	6	9907	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
149	NC_011730	TGT	2	6	9990	9995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
150	NC_011730	TTG	5	15	10022	10036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
151	NC_011730	TGA	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442252
152	NC_011730	CCA	2	6	10406	10411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442252
153	NC_011730	TAA	3	9	10427	10435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
154	NC_011730	TGT	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
155	NC_011730	TAA	2	6	10562	10567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
156	NC_011730	AGA	2	6	10653	10658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
157	NC_011730	GTT	2	6	10874	10879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
158	NC_011730	TCA	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
159	NC_011730	AAT	2	6	10961	10966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
160	NC_011730	CCG	2	6	11011	11016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442252
161	NC_011730	ATA	2	6	11095	11100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
162	NC_011730	CAT	2	6	11101	11106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
163	NC_011730	GCA	2	6	11242	11247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442252
164	NC_011730	TAA	2	6	11291	11296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
165	NC_011730	TTC	2	6	11390	11395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
166	NC_011730	GAG	2	6	11496	11501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442252
167	NC_011730	TCT	2	6	11586	11591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
168	NC_011730	ATT	2	6	11778	11783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442252
169	NC_011730	CTC	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_011730	TGT	2	6	12066	12071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442253
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172	NC_011730	TAG	2	6	12153	12158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442253
173	NC_011730	GTC	2	6	12171	12176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442253
174	NC_011730	CTT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442253
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179	NC_011730	TCA	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442253
180	NC_011730	TTC	2	6	12735	12740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442253
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182	NC_011730	CAC	2	6	12816	12821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442253
183	NC_011730	CCA	2	6	12842	12847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442253
184	NC_011730	GCC	2	6	12853	12858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442253
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186	NC_011730	TCT	2	6	13042	13047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442253
187	NC_011730	TGT	2	6	13050	13055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442253
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191	NC_011730	AGG	2	6	13262	13267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442254
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197	NC_011730	TTA	2	6	13953	13958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_011730	TAT	2	6	14029	14034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_011730	GTT	2	6	14069	14074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
200	NC_011730	GTT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
201	NC_011730	GTT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_011730	CAG	2	6	14541	14546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_011730	TGC	2	6	14861	14866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442255
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212	NC_011730	ATT	2	6	15373	15378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_011730	TAA	2	6	15381	15386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_011730	TTA	2	6	15394	15399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_011730	AAT	2	6	15787	15792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442257
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230	NC_011730	ATT	2	6	17838	17843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_011730	GGA	2	6	20483	20488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_011730	TTA	2	6	20500	20505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_011730	TTC	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_011730	TAG	2	6	20775	20780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442262
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260	NC_011730	GAG	2	6	21063	21068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442262
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.