MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 2704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	ATTTCG	2	12	1068	1079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218437014
2	NC_011729	ACTTTA	2	12	2134	2145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218437015
3	NC_011729	TGGTTT	2	12	3265	3276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437016
4	NC_011729	TCCTTC	2	12	4905	4916	0 %	50 %	0 %	50 %	218437018
5	NC_011729	TTAAAA	2	12	8988	8999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437022
6	NC_011729	CATGAC	2	12	9340	9351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218437022
7	NC_011729	ATTTTA	2	12	9542	9553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437022
8	NC_011729	GACATC	2	12	10167	10178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218437023
9	NC_011729	GGCTTG	2	12	10470	10481	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218437023
10	NC_011729	TGGCTT	2	12	10673	10684	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218437023
11	NC_011729	CTTTTC	2	12	14471	14482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437025
12	NC_011729	TTGCTT	2	12	16311	16322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218437027
13	NC_011729	AATTAA	2	12	19488	19499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437030
14	NC_011729	TAGGAT	2	12	19937	19948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437030
15	NC_011729	CACAAT	2	12	20959	20970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218437031
16	NC_011729	TTTTAA	2	12	22188	22199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437032
17	NC_011729	TTTATA	2	12	22350	22361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437032
18	NC_011729	TTGAAA	2	12	25279	25290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437034
19	NC_011729	TTTTAG	2	12	29187	29198	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218437037
20	NC_011729	CCTAAT	2	12	30905	30916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437038
21	NC_011729	ATTTTA	2	12	31035	31046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011729	TCCCTT	2	12	31347	31358	0 %	50 %	0 %	50 %	218437039
23	NC_011729	TATAGT	2	12	33416	33427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011729	ACAAGG	2	12	38046	38057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218437044
25	NC_011729	AATTAA	2	12	38149	38160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437044
26	NC_011729	TCTCTT	2	12	38277	38288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011729	TTTTAG	2	12	43040	43051	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218437048
28	NC_011729	TGGGAG	2	12	43745	43756	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	218437048
29	NC_011729	AGGATT	2	12	46754	46765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437050
30	NC_011729	GAAGCA	2	12	50405	50416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218437053
31	NC_011729	CGCAAC	2	12	51382	51393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218437053
32	NC_011729	CTGAAG	2	12	52491	52502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218437054
33	NC_011729	GAAGAG	2	12	53771	53782	50 %	0 %	50 %	0 %	218437054
34	NC_011729	CCACAG	2	12	62754	62765	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218437065
35	NC_011729	GGGAAG	2	12	63153	63164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011729	AATCAA	2	12	67143	67154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437069
37	NC_011729	ATTAGC	2	12	67529	67540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218437069
38	NC_011729	GCTTCT	2	12	70463	70474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218437072
39	NC_011729	ATTTAT	2	12	73061	73072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011729	AGGAAT	2	12	73289	73300	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218437075
41	NC_011729	ATTACA	2	12	74177	74188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218437076
42	NC_011729	AACTAA	2	12	77011	77022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437077
43	NC_011729	AACTAA	2	12	77843	77854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437077
44	NC_011729	ATTTAG	2	12	80804	80815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437079
45	NC_011729	TTAGCT	2	12	81589	81600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218437079
46	NC_011729	AAAAGA	2	12	81840	81851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218437079
47	NC_011729	AAAAAG	2	12	81920	81931	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218437079
48	NC_011729	ATTCTT	2	12	81939	81950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218437079
49	NC_011729	GTGCTG	2	12	83080	83091	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218437083
50	NC_011729	CGCACG	2	12	84475	84486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011729	TTCTTT	2	12	84823	84834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011729	AAAGGA	2	12	85941	85952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011729	AAACAA	2	12	94029	94040	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011729	GAACCA	2	12	94413	94424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011729	CAGAAA	2	12	94661	94672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011729	ATGGGC	2	12	94707	94718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011729	CTAATC	2	12	95687	95698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437092
58	NC_011729	TTCGGC	2	12	96851	96862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011729	GGTTGG	2	12	99276	99287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437095
60	NC_011729	TCATCG	2	12	100533	100544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218437097
61	NC_011729	ATCCTG	2	12	103144	103155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218437099
62	NC_011729	AGATAA	2	12	103217	103228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011729	TTTAAA	2	12	103722	103733	50 %	50 %	0 %	0 %	218437100
64	NC_011729	ATTATA	2	12	105073	105084	50 %	50 %	0 %	0 %	218437100
65	NC_011729	CCCACC	2	12	105353	105364	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	218437100
66	NC_011729	GAAAAA	2	12	105544	105555	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218437100
67	NC_011729	TTACCC	2	12	109854	109865	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218437104
68	NC_011729	GTAATG	2	12	110122	110133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437104
69	NC_011729	TGAGCT	2	12	116233	116244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218437110
70	NC_011729	AAATTA	2	12	116816	116827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437112
71	NC_011729	ATCAAT	2	12	120855	120866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218437117
72	NC_011729	GATTAG	2	12	121717	121728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437119
73	NC_011729	CAAACC	2	12	125062	125073	50 %	0 %	0 %	50 %	218437121
74	NC_011729	TCTTTT	2	12	126143	126154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218437121
75	NC_011729	TCAGTG	2	12	128771	128782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011729	TTGAGT	2	12	129280	129291	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218437125
77	NC_011729	AACGGT	2	12	130012	130023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218437126
78	NC_011729	CTAATC	2	12	131340	131351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437127
79	NC_011729	TAAAAA	2	12	139166	139177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218437130
80	NC_011729	TTTAAT	2	12	139499	139510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437130
81	NC_011729	AATAGG	2	12	139727	139738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218437130
82	NC_011729	CCCCTT	2	12	140664	140675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011729	GAATTT	2	12	140738	140749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437132
84	NC_011729	TGATAA	2	12	141145	141156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437132
85	NC_011729	CCATCT	2	12	144881	144892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218437138
86	NC_011729	TTTAAT	2	12	150723	150734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437144
87	NC_011729	AGAAAA	2	12	151251	151262	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218437146
88	NC_011729	AGGATA	2	12	157983	157994	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218437153
89	NC_011729	GATAAT	2	12	162625	162636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437157
90	NC_011729	CGCTTC	2	12	163348	163359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218437157
91	NC_011729	TTAAAG	2	12	166166	166177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437159
92	NC_011729	ATAAGT	2	12	168913	168924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011729	TCTATA	2	12	171836	171847	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011729	TAAATT	2	12	172005	172016	50 %	50 %	0 %	0 %	218437163
95	NC_011729	TTAAAT	2	12	172735	172746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011729	TGGTGC	2	12	174819	174830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218437164
97	NC_011729	TTATAT	2	12	175306	175317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011729	CAAATT	2	12	177557	177568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218437168
99	NC_011729	TAATTG	2	12	180292	180303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437171
100	NC_011729	TTAAAT	2	12	185765	185776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011729	TTCAAC	2	12	187451	187462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437178
102	NC_011729	GTAAAA	2	12	188196	188207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218437179
103	NC_011729	ACTAAA	2	12	188212	188223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437179
104	NC_011729	TTTGTT	2	12	191608	191619	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218437182
105	NC_011729	GGATTA	2	12	192754	192765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437184
106	NC_011729	TGTTGC	2	12	193472	193483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218437185
107	NC_011729	GATTTC	2	12	194203	194214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218437185
108	NC_011729	TTCTAT	2	12	200733	200744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218437192
109	NC_011729	TTAAGA	2	12	200967	200978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437193
110	NC_011729	CTAAGT	2	12	202125	202136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011729	AACATC	2	12	202230	202241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218437194
112	NC_011729	TCGCAT	2	12	204721	204732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218437197
113	NC_011729	AAAAAT	2	12	205458	205469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218437198
114	NC_011729	ATTTGA	2	12	209694	209705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437201
115	NC_011729	TTTGTG	2	12	213521	213532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437204
116	NC_011729	TGACAA	2	12	216038	216049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218437207
117	NC_011729	GAACCG	2	12	216974	216985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437208
118	NC_011729	ACTCCT	2	12	220376	220387	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011729	GCTCAA	2	12	221451	221462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218437212
120	NC_011729	ATTTAG	2	12	224998	225009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011729	TTAAAT	2	12	225016	225027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011729	TTAGAT	2	12	228852	228863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437217
123	NC_011729	ACAATA	2	12	231663	231674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218437219
124	NC_011729	TGCGGG	2	12	232159	232170	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218437219
125	NC_011729	AGAGGT	2	12	233371	233382	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011729	TCCCAA	2	12	235776	235787	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218437221
127	NC_011729	GTTTCT	2	12	236841	236852	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218437224
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129	NC_011729	TTTAAA	2	12	242258	242269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011729	CAGGTG	2	12	243637	243648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218437231
131	NC_011729	GGATTA	2	12	246843	246854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437234
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133	NC_011729	AGCATT	2	12	257103	257114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218437243
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136	NC_011729	CCCCTT	2	12	261844	261855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011729	TAGATG	2	12	262741	262752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437245
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143	NC_011729	GAATTG	2	12	287997	288008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437269
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145	NC_011729	TTCCCA	2	12	289726	289737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218437272
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182	NC_011729	TGTAAT	2	12	368719	368730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218437343
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184	NC_011729	CCGTTA	2	12	370258	370269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218437344
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189	NC_011729	GACGTT	2	12	374159	374170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218437346
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234	NC_011729	ACTAAT	2	12	482819	482830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
235	NC_011729	AAATAG	2	12	483625	483636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218437446
236	NC_011729	AGTTGT	2	12	484302	484313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
237	NC_011729	GTGGTC	2	12	485522	485533	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218437448
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239	NC_011729	CAAGGA	2	12	489605	489616	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218437452
240	NC_011729	TAAAAT	2	12	492904	492915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437452
241	NC_011729	AGGAGA	2	12	493042	493053	50 %	0 %	50 %	0 %	218437452
242	NC_011729	CTTTTT	2	12	495696	495707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218437453
243	NC_011729	GATGGA	2	12	496607	496618	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218437454
244	NC_011729	CCAACA	2	12	496797	496808	50 %	0 %	0 %	50 %	218437454
245	NC_011729	TTCAAT	2	12	501551	501562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218437458
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352	NC_011729	TCAGGG	2	12	738856	738867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
353	NC_011729	TGAACC	2	12	739632	739643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218437669
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