MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 4178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	CCTAA	2	10	40	49	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011729	GTTAA	2	10	1498	1507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	ATTTT	2	10	1515	1524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011729	GAATG	2	10	3184	3193	40 %	20 %	40 %	0 %	218437016
5	NC_011729	CATGG	2	10	3867	3876	20 %	20 %	40 %	20 %	218437017
6	NC_011729	TCTTT	2	10	7821	7830	0 %	80 %	0 %	20 %	218437020
7	NC_011729	TAACC	2	10	9691	9700	40 %	20 %	0 %	40 %	218437022
8	NC_011729	AACTG	2	10	9925	9934	40 %	20 %	20 %	20 %	218437022
9	NC_011729	GTTTT	2	10	11747	11756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011729	CTGAC	2	10	11914	11923	20 %	20 %	20 %	40 %	218437024
11	NC_011729	CTAAA	2	10	13493	13502	60 %	20 %	0 %	20 %	218437024
12	NC_011729	CTTTA	2	10	14284	14293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011729	GTTTC	2	10	14786	14795	0 %	60 %	20 %	20 %	218437025
14	NC_011729	AGGTA	2	10	15476	15485	40 %	20 %	40 %	0 %	218437026
15	NC_011729	ATTTT	2	10	16394	16403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011729	TTTTC	2	10	17829	17838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011729	AATTT	2	10	18312	18321	40 %	60 %	0 %	0 %	218437029
18	NC_011729	ATTAA	2	10	19055	19064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011729	TTAAT	2	10	21096	21105	40 %	60 %	0 %	0 %	218437032
20	NC_011729	TTAAA	2	10	21182	21191	60 %	40 %	0 %	0 %	218437032
21	NC_011729	TAACT	2	10	23339	23348	40 %	40 %	0 %	20 %	218437033
22	NC_011729	GAATG	2	10	24442	24451	40 %	20 %	40 %	0 %	218437033
23	NC_011729	TTGCC	2	10	24792	24801	0 %	40 %	20 %	40 %	218437034
24	NC_011729	GGGTT	2	10	25949	25958	0 %	40 %	60 %	0 %	218437035
25	NC_011729	AACCA	2	10	27617	27626	60 %	0 %	0 %	40 %	218437036
26	NC_011729	AACGA	2	10	30781	30790	60 %	0 %	20 %	20 %	218437038
27	NC_011729	CTGAA	2	10	34512	34521	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011729	TTGAC	2	10	36273	36282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011729	AATTT	2	10	36517	36526	40 %	60 %	0 %	0 %	218437043
30	NC_011729	TTTCT	2	10	38289	38298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011729	TTTCA	2	10	41050	41059	20 %	60 %	0 %	20 %	218437045
32	NC_011729	TGTCA	2	10	45822	45831	20 %	40 %	20 %	20 %	218437050
33	NC_011729	TTATG	2	10	46077	46086	20 %	60 %	20 %	0 %	218437050
34	NC_011729	TTAGG	2	10	46910	46919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011729	AAACT	2	10	46940	46949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011729	TGAGT	2	10	49100	49109	20 %	40 %	40 %	0 %	218437051
37	NC_011729	TGCCA	2	10	50303	50312	20 %	20 %	20 %	40 %	218437053
38	NC_011729	CAAAC	2	10	51068	51077	60 %	0 %	0 %	40 %	218437053
39	NC_011729	AATAA	2	10	51436	51445	80 %	20 %	0 %	0 %	218437053
40	NC_011729	AGAAT	2	10	51627	51636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011729	TTACC	2	10	52344	52353	20 %	40 %	0 %	40 %	218437054
42	NC_011729	CAACC	2	10	54948	54957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_011729	TAAGT	2	10	55005	55014	40 %	40 %	20 %	0 %	218437057
44	NC_011729	CTTTG	2	10	57528	57537	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011729	TCTTT	2	10	58497	58506	0 %	80 %	0 %	20 %	218437061
46	NC_011729	AGATT	2	10	59368	59377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011729	ATGAT	2	10	62317	62326	40 %	40 %	20 %	0 %	218437064
48	NC_011729	TAAAG	2	10	62738	62747	60 %	20 %	20 %	0 %	218437065
49	NC_011729	TATAA	2	10	62938	62947	60 %	40 %	0 %	0 %	218437065
50	NC_011729	ATTAA	2	10	63983	63992	60 %	40 %	0 %	0 %	218437067
51	NC_011729	AGTTA	2	10	65421	65430	40 %	40 %	20 %	0 %	218437068
52	NC_011729	GATGG	2	10	69207	69216	20 %	20 %	60 %	0 %	218437071
53	NC_011729	AAAGA	2	10	69337	69346	80 %	0 %	20 %	0 %	218437071
54	NC_011729	CAACC	2	10	70027	70036	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_011729	AGTTG	2	10	71826	71835	20 %	40 %	40 %	0 %	218437073
56	NC_011729	CCCAT	2	10	73542	73551	20 %	20 %	0 %	60 %	218437075
57	NC_011729	GATTA	2	10	78977	78986	40 %	40 %	20 %	0 %	218437078
58	NC_011729	GGTTG	2	10	83399	83408	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011729	GGTTG	2	10	83573	83582	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011729	GGTTG	2	10	83747	83756	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011729	GGTTG	2	10	83921	83930	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011729	CAACC	2	10	83980	83989	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011729	CAAAC	2	10	84582	84591	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011729	ATAAA	2	10	85098	85107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011729	TAAAT	2	10	85220	85229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011729	TTCAG	2	10	85325	85334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011729	TAATT	2	10	86261	86270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011729	AAGGA	2	10	92921	92930	60 %	0 %	40 %	0 %	218437090
69	NC_011729	TAAAA	2	10	93280	93289	80 %	20 %	0 %	0 %	218437091
70	NC_011729	TTTAA	2	10	95395	95404	40 %	60 %	0 %	0 %	218437092
71	NC_011729	CATGA	2	10	95439	95448	40 %	20 %	20 %	20 %	218437092
72	NC_011729	TTGCC	2	10	95656	95665	0 %	40 %	20 %	40 %	218437092
73	NC_011729	TTAAT	2	10	99131	99140	40 %	60 %	0 %	0 %	218437095
74	NC_011729	TTCGG	2	10	99357	99366	0 %	40 %	40 %	20 %	218437095
75	NC_011729	AATAA	2	10	100163	100172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011729	TTACA	2	10	100897	100906	40 %	40 %	0 %	20 %	218437097
77	NC_011729	TGTAA	2	10	101848	101857	40 %	40 %	20 %	0 %	218437098
78	NC_011729	ACTTT	2	10	102727	102736	20 %	60 %	0 %	20 %	218437099
79	NC_011729	GTTTT	2	10	103254	103263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011729	TAATT	2	10	103637	103646	40 %	60 %	0 %	0 %	218437100
81	NC_011729	AACTT	2	10	105291	105300	40 %	40 %	0 %	20 %	218437100
82	NC_011729	AACTT	2	10	105532	105541	40 %	40 %	0 %	20 %	218437100
83	NC_011729	ATTAG	3	15	106223	106237	40 %	40 %	20 %	0 %	218437101
84	NC_011729	ATTTA	2	10	106762	106771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011729	AATTC	2	10	107395	107404	40 %	40 %	0 %	20 %	218437102
86	NC_011729	TTTAA	2	10	112607	112616	40 %	60 %	0 %	0 %	218437106
87	NC_011729	GGGAA	2	10	113512	113521	40 %	0 %	60 %	0 %	218437107
88	NC_011729	AATTA	2	10	113978	113987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011729	GATTT	2	10	116887	116896	20 %	60 %	20 %	0 %	218437112
90	NC_011729	TGACT	2	10	117127	117136	20 %	40 %	20 %	20 %	218437112
91	NC_011729	GGTTG	2	10	120730	120739	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011729	GGCAA	2	10	121750	121759	40 %	0 %	40 %	20 %	218437119
93	NC_011729	TCATG	2	10	121967	121976	20 %	40 %	20 %	20 %	218437119
94	NC_011729	TTAAA	2	10	122011	122020	60 %	40 %	0 %	0 %	218437119
95	NC_011729	AATCA	2	10	122893	122902	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011729	TCCCA	2	10	123198	123207	20 %	20 %	0 %	60 %	218437121
97	NC_011729	AAAAT	2	10	126278	126287	80 %	20 %	0 %	0 %	218437121
98	NC_011729	GTATT	2	10	126560	126569	20 %	60 %	20 %	0 %	218437121
99	NC_011729	TTAAA	2	10	128645	128654	60 %	40 %	0 %	0 %	218437124
100	NC_011729	GAAGA	2	10	130914	130923	60 %	0 %	40 %	0 %	218437127
101	NC_011729	CGCTG	2	10	132489	132498	0 %	20 %	40 %	40 %	218437127
102	NC_011729	GTCGG	2	10	133714	133723	0 %	20 %	60 %	20 %	218437127
103	NC_011729	CTGAA	2	10	135393	135402	40 %	20 %	20 %	20 %	218437127
104	NC_011729	AAAAT	2	10	136329	136338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011729	AATTC	2	10	139203	139212	40 %	40 %	0 %	20 %	218437130
106	NC_011729	CCCCA	2	10	140678	140687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_011729	CAAAA	2	10	142571	142580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011729	TCAAA	2	10	143122	143131	60 %	20 %	0 %	20 %	218437134
109	NC_011729	ACAAA	2	10	143709	143718	80 %	0 %	0 %	20 %	218437136
110	NC_011729	ATCTT	2	10	144665	144674	20 %	60 %	0 %	20 %	218437138
111	NC_011729	CATCC	2	10	144690	144699	20 %	20 %	0 %	60 %	218437138
112	NC_011729	CTTGT	2	10	145887	145896	0 %	60 %	20 %	20 %	218437141
113	NC_011729	AAACC	2	10	147083	147092	60 %	0 %	0 %	40 %	218437141
114	NC_011729	CTGTT	2	10	147868	147877	0 %	60 %	20 %	20 %	218437142
115	NC_011729	AGCCA	2	10	148033	148042	40 %	0 %	20 %	40 %	218437142
116	NC_011729	ATTCA	2	10	152216	152225	40 %	40 %	0 %	20 %	218437147
117	NC_011729	GAAGA	2	10	155841	155850	60 %	0 %	40 %	0 %	218437153
118	NC_011729	TGGCG	2	10	156332	156341	0 %	20 %	60 %	20 %	218437153
119	NC_011729	ATATA	2	10	159639	159648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011729	TAAAA	2	10	160168	160177	80 %	20 %	0 %	0 %	218437155
121	NC_011729	AAAAG	2	10	160499	160508	80 %	0 %	20 %	0 %	218437155
122	NC_011729	AACAG	2	10	160920	160929	60 %	0 %	20 %	20 %	218437156
123	NC_011729	CTATA	2	10	161784	161793	40 %	40 %	0 %	20 %	218437157
124	NC_011729	GGATT	2	10	162337	162346	20 %	40 %	40 %	0 %	218437157
125	NC_011729	ATTAT	2	10	162905	162914	40 %	60 %	0 %	0 %	218437157
126	NC_011729	CCTGC	2	10	163615	163624	0 %	20 %	20 %	60 %	218437157
127	NC_011729	AAAAT	2	10	163961	163970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011729	ATTTA	2	10	165088	165097	40 %	60 %	0 %	0 %	218437158
129	NC_011729	TGGTT	2	10	165167	165176	0 %	60 %	40 %	0 %	218437158
130	NC_011729	AGTAA	2	10	165928	165937	60 %	20 %	20 %	0 %	218437159
131	NC_011729	ACCAA	2	10	166632	166641	60 %	0 %	0 %	40 %	218437159
132	NC_011729	AAATC	2	10	166836	166845	60 %	20 %	0 %	20 %	218437160
133	NC_011729	TTTGA	2	10	168988	168997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011729	AAAAC	2	10	171223	171232	80 %	0 %	0 %	20 %	218437162
135	NC_011729	AAAAT	2	10	172580	172589	80 %	20 %	0 %	0 %	218437163
136	NC_011729	TAAAA	2	10	172710	172719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011729	AGTTG	2	10	174754	174763	20 %	40 %	40 %	0 %	218437164
138	NC_011729	AATGA	2	10	175187	175196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011729	ACTTT	2	10	179768	179777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_011729	AATCC	2	10	356921	356930	40 %	20 %	0 %	40 %	218437333
270	NC_011729	TGCAT	2	10	358039	358048	20 %	40 %	20 %	20 %	218437334
271	NC_011729	AATCA	2	10	359779	359788	60 %	20 %	0 %	20 %	218437335
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