MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 1216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	CCTAA	2	10	40	49	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011729	GTTAA	2	10	1498	1507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	ATTTT	2	10	1515	1524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011729	GTTTT	2	10	11747	11756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011729	CTTTA	2	10	14284	14293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011729	ATTTT	2	10	16394	16403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011729	TTTTC	2	10	17829	17838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011729	ATTAA	2	10	19055	19064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011729	CTGAA	2	10	34512	34521	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011729	TTGAC	2	10	36273	36282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011729	TTTCT	2	10	38289	38298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011729	TTAGG	2	10	46910	46919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011729	AAACT	2	10	46940	46949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011729	AGAAT	2	10	51627	51636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011729	CAACC	2	10	54948	54957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_011729	CTTTG	2	10	57528	57537	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011729	AGATT	2	10	59368	59377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011729	CAACC	2	10	70027	70036	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_011729	GGTTG	2	10	83399	83408	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011729	GGTTG	2	10	83573	83582	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011729	GGTTG	2	10	83747	83756	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011729	GGTTG	2	10	83921	83930	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011729	CAACC	2	10	83980	83989	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011729	CAAAC	2	10	84582	84591	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011729	ATAAA	2	10	85098	85107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011729	TAAAT	2	10	85220	85229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011729	TTCAG	2	10	85325	85334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011729	TAATT	2	10	86261	86270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011729	AATAA	2	10	100163	100172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011729	GTTTT	2	10	103254	103263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011729	ATTTA	2	10	106762	106771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011729	AATTA	2	10	113978	113987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011729	GGTTG	2	10	120730	120739	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011729	AATCA	2	10	122893	122902	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011729	AAAAT	2	10	136329	136338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011729	CCCCA	2	10	140678	140687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_011729	CAAAA	2	10	142571	142580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011729	ATATA	2	10	159639	159648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011729	AAAAT	2	10	163961	163970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011729	TTTGA	2	10	168988	168997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011729	TAAAA	2	10	172710	172719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011729	AATGA	2	10	175187	175196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011729	ACTTT	2	10	179768	179777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011729	ATTAT	2	10	187856	187865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011729	TGATA	2	10	192112	192121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011729	ATAAC	2	10	192136	192145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011729	CCTAA	2	10	192953	192962	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011729	GAGAA	2	10	202568	202577	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011729	AAGCA	2	10	250263	250272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011729	TTTTA	2	10	258059	258068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011729	TATAT	2	10	258312	258321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011729	TAAAA	2	10	261530	261539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011729	AGTTA	2	10	261618	261627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011729	GCTTT	2	10	261983	261992	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011729	AACCT	2	10	284722	284731	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011729	GGGGA	2	10	287765	287774	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011729	GGTTG	2	10	290032	290041	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011729	CAACC	2	10	290217	290226	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_011729	CAACC	2	10	290460	290469	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_011729	CAACC	2	10	290704	290713	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_011729	AGAGG	2	10	290719	290728	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011729	CAACC	2	10	290947	290956	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011729	AGAGG	2	10	290962	290971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011729	GGAAA	2	10	295135	295144	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011729	AACAC	2	10	295325	295334	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011729	ACCTT	2	10	300125	300134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_011729	TAGTT	2	10	301766	301775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011729	TTTAA	2	10	307175	307184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011729	CAACC	2	10	310897	310906	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011729	ACCTC	2	10	312254	312263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_011729	ATTTT	2	10	318440	318449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011729	CAAAG	2	10	321336	321345	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011729	ATTTA	2	10	328156	328165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011729	AAATT	2	10	334675	334684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011729	AGTTG	2	10	334772	334781	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011729	TAACT	2	10	340532	340541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011729	AGTTA	2	10	341916	341925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011729	CCAAG	2	10	354736	354745	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011729	TTTAT	2	10	365104	365113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011729	ATTGG	2	10	367965	367974	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011729	TAAAA	2	10	369581	369590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011729	GGTAG	2	10	376469	376478	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011729	AACTC	2	10	386036	386045	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011729	ATTCC	2	10	389937	389946	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011729	GGTTG	2	10	394673	394682	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011729	CTCAA	2	10	395062	395071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011729	AATTG	2	10	396717	396726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011729	CAAAC	2	10	397356	397365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011729	ATTAG	2	10	398344	398353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011729	CGTAG	2	10	400553	400562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011729	TTAAT	2	10	401059	401068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011729	GGTAG	2	10	401479	401488	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011729	CTTCT	2	10	405445	405454	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_011729	AGTTT	2	10	406186	406195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011729	TTTTA	2	10	427906	427915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011729	AACAA	2	10	430199	430208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011729	TTTAA	2	10	431980	431989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011729	ATTTA	2	10	432008	432017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011729	CCTAC	2	10	432376	432385	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_011729	GGGAT	2	10	435691	435700	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011729	ATCTG	2	10	441645	441654	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011729	ACAAA	2	10	449408	449417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011729	TACTT	2	10	456686	456695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011729	GATTG	2	10	458417	458426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011729	GATTG	2	10	458511	458520	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011729	TTTGT	2	10	461430	461439	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011729	TTACT	2	10	461568	461577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011729	GGAAA	2	10	463154	463163	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011729	GTATT	2	10	479797	479806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011729	TGGTT	2	10	479859	479868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011729	AAAAT	2	10	480797	480806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011729	TATCT	2	10	480825	480834	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011729	GGTTA	2	10	483362	483371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011729	GCGTA	2	10	484326	484335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011729	CCTAC	2	10	488688	488697	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011729	TAAAT	2	10	504563	504572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011729	AAGTT	2	10	515932	515941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011729	GGCCG	2	10	521625	521634	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011729	ACTTG	2	10	524315	524324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011729	AAAAC	2	10	525688	525697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011729	AAATA	2	10	529155	529164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011729	TAGCG	2	10	535160	535169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011729	CAACC	2	10	535291	535300	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_011729	CTCAT	2	10	545725	545734	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011729	TAGAA	2	10	558274	558283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011729	TAATT	2	10	558337	558346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011729	TAAAT	2	10	558658	558667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011729	TTATG	2	10	566656	566665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011729	TGAAC	2	10	572405	572414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011729	TTTTG	2	10	573096	573105	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011729	GGTTG	2	10	575413	575422	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011729	CAACC	2	10	575495	575504	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_011729	GTGAA	2	10	581278	581287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011729	CGCTA	2	10	591351	591360	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011729	GCGTA	2	10	598669	598678	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011729	GTTAT	2	10	605034	605043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011729	TTGAA	2	10	605916	605925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011729	GATCA	2	10	612015	612024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011729	CAAGT	2	10	617496	617505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011729	TCAAC	2	10	619173	619182	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011729	AGATA	2	10	628490	628499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011729	GGTTG	2	10	633020	633029	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011729	AATTT	2	10	634314	634323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011729	AATTT	2	10	644363	644372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011729	ACTTA	2	10	644517	644526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011729	ATTAA	2	10	649585	649594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011729	ACTTA	3	15	654262	654276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011729	TTTTA	2	10	664557	664566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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