MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 2962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	GAATG	2	10	3184	3193	40 %	20 %	40 %	0 %	218437016
2	NC_011729	CATGG	2	10	3867	3876	20 %	20 %	40 %	20 %	218437017
3	NC_011729	TCTTT	2	10	7821	7830	0 %	80 %	0 %	20 %	218437020
4	NC_011729	TAACC	2	10	9691	9700	40 %	20 %	0 %	40 %	218437022
5	NC_011729	AACTG	2	10	9925	9934	40 %	20 %	20 %	20 %	218437022
6	NC_011729	CTGAC	2	10	11914	11923	20 %	20 %	20 %	40 %	218437024
7	NC_011729	CTAAA	2	10	13493	13502	60 %	20 %	0 %	20 %	218437024
8	NC_011729	GTTTC	2	10	14786	14795	0 %	60 %	20 %	20 %	218437025
9	NC_011729	AGGTA	2	10	15476	15485	40 %	20 %	40 %	0 %	218437026
10	NC_011729	AATTT	2	10	18312	18321	40 %	60 %	0 %	0 %	218437029
11	NC_011729	TTAAT	2	10	21096	21105	40 %	60 %	0 %	0 %	218437032
12	NC_011729	TTAAA	2	10	21182	21191	60 %	40 %	0 %	0 %	218437032
13	NC_011729	TAACT	2	10	23339	23348	40 %	40 %	0 %	20 %	218437033
14	NC_011729	GAATG	2	10	24442	24451	40 %	20 %	40 %	0 %	218437033
15	NC_011729	TTGCC	2	10	24792	24801	0 %	40 %	20 %	40 %	218437034
16	NC_011729	GGGTT	2	10	25949	25958	0 %	40 %	60 %	0 %	218437035
17	NC_011729	AACCA	2	10	27617	27626	60 %	0 %	0 %	40 %	218437036
18	NC_011729	AACGA	2	10	30781	30790	60 %	0 %	20 %	20 %	218437038
19	NC_011729	AATTT	2	10	36517	36526	40 %	60 %	0 %	0 %	218437043
20	NC_011729	TTTCA	2	10	41050	41059	20 %	60 %	0 %	20 %	218437045
21	NC_011729	TGTCA	2	10	45822	45831	20 %	40 %	20 %	20 %	218437050
22	NC_011729	TTATG	2	10	46077	46086	20 %	60 %	20 %	0 %	218437050
23	NC_011729	TGAGT	2	10	49100	49109	20 %	40 %	40 %	0 %	218437051
24	NC_011729	TGCCA	2	10	50303	50312	20 %	20 %	20 %	40 %	218437053
25	NC_011729	CAAAC	2	10	51068	51077	60 %	0 %	0 %	40 %	218437053
26	NC_011729	AATAA	2	10	51436	51445	80 %	20 %	0 %	0 %	218437053
27	NC_011729	TTACC	2	10	52344	52353	20 %	40 %	0 %	40 %	218437054
28	NC_011729	TAAGT	2	10	55005	55014	40 %	40 %	20 %	0 %	218437057
29	NC_011729	TCTTT	2	10	58497	58506	0 %	80 %	0 %	20 %	218437061
30	NC_011729	ATGAT	2	10	62317	62326	40 %	40 %	20 %	0 %	218437064
31	NC_011729	TAAAG	2	10	62738	62747	60 %	20 %	20 %	0 %	218437065
32	NC_011729	TATAA	2	10	62938	62947	60 %	40 %	0 %	0 %	218437065
33	NC_011729	ATTAA	2	10	63983	63992	60 %	40 %	0 %	0 %	218437067
34	NC_011729	AGTTA	2	10	65421	65430	40 %	40 %	20 %	0 %	218437068
35	NC_011729	GATGG	2	10	69207	69216	20 %	20 %	60 %	0 %	218437071
36	NC_011729	AAAGA	2	10	69337	69346	80 %	0 %	20 %	0 %	218437071
37	NC_011729	AGTTG	2	10	71826	71835	20 %	40 %	40 %	0 %	218437073
38	NC_011729	CCCAT	2	10	73542	73551	20 %	20 %	0 %	60 %	218437075
39	NC_011729	GATTA	2	10	78977	78986	40 %	40 %	20 %	0 %	218437078
40	NC_011729	AAGGA	2	10	92921	92930	60 %	0 %	40 %	0 %	218437090
41	NC_011729	TAAAA	2	10	93280	93289	80 %	20 %	0 %	0 %	218437091
42	NC_011729	TTTAA	2	10	95395	95404	40 %	60 %	0 %	0 %	218437092
43	NC_011729	CATGA	2	10	95439	95448	40 %	20 %	20 %	20 %	218437092
44	NC_011729	TTGCC	2	10	95656	95665	0 %	40 %	20 %	40 %	218437092
45	NC_011729	TTAAT	2	10	99131	99140	40 %	60 %	0 %	0 %	218437095
46	NC_011729	TTCGG	2	10	99357	99366	0 %	40 %	40 %	20 %	218437095
47	NC_011729	TTACA	2	10	100897	100906	40 %	40 %	0 %	20 %	218437097
48	NC_011729	TGTAA	2	10	101848	101857	40 %	40 %	20 %	0 %	218437098
49	NC_011729	ACTTT	2	10	102727	102736	20 %	60 %	0 %	20 %	218437099
50	NC_011729	TAATT	2	10	103637	103646	40 %	60 %	0 %	0 %	218437100
51	NC_011729	AACTT	2	10	105291	105300	40 %	40 %	0 %	20 %	218437100
52	NC_011729	AACTT	2	10	105532	105541	40 %	40 %	0 %	20 %	218437100
53	NC_011729	ATTAG	3	15	106223	106237	40 %	40 %	20 %	0 %	218437101
54	NC_011729	AATTC	2	10	107395	107404	40 %	40 %	0 %	20 %	218437102
55	NC_011729	TTTAA	2	10	112607	112616	40 %	60 %	0 %	0 %	218437106
56	NC_011729	GGGAA	2	10	113512	113521	40 %	0 %	60 %	0 %	218437107
57	NC_011729	GATTT	2	10	116887	116896	20 %	60 %	20 %	0 %	218437112
58	NC_011729	TGACT	2	10	117127	117136	20 %	40 %	20 %	20 %	218437112
59	NC_011729	GGCAA	2	10	121750	121759	40 %	0 %	40 %	20 %	218437119
60	NC_011729	TCATG	2	10	121967	121976	20 %	40 %	20 %	20 %	218437119
61	NC_011729	TTAAA	2	10	122011	122020	60 %	40 %	0 %	0 %	218437119
62	NC_011729	TCCCA	2	10	123198	123207	20 %	20 %	0 %	60 %	218437121
63	NC_011729	AAAAT	2	10	126278	126287	80 %	20 %	0 %	0 %	218437121
64	NC_011729	GTATT	2	10	126560	126569	20 %	60 %	20 %	0 %	218437121
65	NC_011729	TTAAA	2	10	128645	128654	60 %	40 %	0 %	0 %	218437124
66	NC_011729	GAAGA	2	10	130914	130923	60 %	0 %	40 %	0 %	218437127
67	NC_011729	CGCTG	2	10	132489	132498	0 %	20 %	40 %	40 %	218437127
68	NC_011729	GTCGG	2	10	133714	133723	0 %	20 %	60 %	20 %	218437127
69	NC_011729	CTGAA	2	10	135393	135402	40 %	20 %	20 %	20 %	218437127
70	NC_011729	AATTC	2	10	139203	139212	40 %	40 %	0 %	20 %	218437130
71	NC_011729	TCAAA	2	10	143122	143131	60 %	20 %	0 %	20 %	218437134
72	NC_011729	ACAAA	2	10	143709	143718	80 %	0 %	0 %	20 %	218437136
73	NC_011729	ATCTT	2	10	144665	144674	20 %	60 %	0 %	20 %	218437138
74	NC_011729	CATCC	2	10	144690	144699	20 %	20 %	0 %	60 %	218437138
75	NC_011729	CTTGT	2	10	145887	145896	0 %	60 %	20 %	20 %	218437141
76	NC_011729	AAACC	2	10	147083	147092	60 %	0 %	0 %	40 %	218437141
77	NC_011729	CTGTT	2	10	147868	147877	0 %	60 %	20 %	20 %	218437142
78	NC_011729	AGCCA	2	10	148033	148042	40 %	0 %	20 %	40 %	218437142
79	NC_011729	ATTCA	2	10	152216	152225	40 %	40 %	0 %	20 %	218437147
80	NC_011729	GAAGA	2	10	155841	155850	60 %	0 %	40 %	0 %	218437153
81	NC_011729	TGGCG	2	10	156332	156341	0 %	20 %	60 %	20 %	218437153
82	NC_011729	TAAAA	2	10	160168	160177	80 %	20 %	0 %	0 %	218437155
83	NC_011729	AAAAG	2	10	160499	160508	80 %	0 %	20 %	0 %	218437155
84	NC_011729	AACAG	2	10	160920	160929	60 %	0 %	20 %	20 %	218437156
85	NC_011729	CTATA	2	10	161784	161793	40 %	40 %	0 %	20 %	218437157
86	NC_011729	GGATT	2	10	162337	162346	20 %	40 %	40 %	0 %	218437157
87	NC_011729	ATTAT	2	10	162905	162914	40 %	60 %	0 %	0 %	218437157
88	NC_011729	CCTGC	2	10	163615	163624	0 %	20 %	20 %	60 %	218437157
89	NC_011729	ATTTA	2	10	165088	165097	40 %	60 %	0 %	0 %	218437158
90	NC_011729	TGGTT	2	10	165167	165176	0 %	60 %	40 %	0 %	218437158
91	NC_011729	AGTAA	2	10	165928	165937	60 %	20 %	20 %	0 %	218437159
92	NC_011729	ACCAA	2	10	166632	166641	60 %	0 %	0 %	40 %	218437159
93	NC_011729	AAATC	2	10	166836	166845	60 %	20 %	0 %	20 %	218437160
94	NC_011729	AAAAC	2	10	171223	171232	80 %	0 %	0 %	20 %	218437162
95	NC_011729	AAAAT	2	10	172580	172589	80 %	20 %	0 %	0 %	218437163
96	NC_011729	AGTTG	2	10	174754	174763	20 %	40 %	40 %	0 %	218437164
97	NC_011729	ATCGT	2	10	181605	181614	20 %	40 %	20 %	20 %	218437172
98	NC_011729	TTTGA	2	10	183867	183876	20 %	60 %	20 %	0 %	218437174
99	NC_011729	TCCCC	2	10	188751	188760	0 %	20 %	0 %	80 %	218437180
100	NC_011729	TTTAT	2	10	193685	193694	20 %	80 %	0 %	0 %	218437185
101	NC_011729	GGGCC	2	10	193981	193990	0 %	0 %	60 %	40 %	218437185
102	NC_011729	TGCTT	2	10	194987	194996	0 %	60 %	20 %	20 %	218437186
103	NC_011729	ACCCA	2	10	195468	195477	40 %	0 %	0 %	60 %	218437186
104	NC_011729	TTGCT	2	10	197265	197274	0 %	60 %	20 %	20 %	218437188
105	NC_011729	ATTAT	2	10	198792	198801	40 %	60 %	0 %	0 %	218437190
106	NC_011729	AAAGA	2	10	200333	200342	80 %	0 %	20 %	0 %	218437192
107	NC_011729	TTTGG	2	10	207107	207116	0 %	60 %	40 %	0 %	218437200
108	NC_011729	ATCTA	2	10	211043	211052	40 %	40 %	0 %	20 %	218437202
109	NC_011729	GTGCT	2	10	212754	212763	0 %	40 %	40 %	20 %	218437204
110	NC_011729	TTCTA	2	10	214765	214774	20 %	60 %	0 %	20 %	218437206
111	NC_011729	AGTCA	2	10	215694	215703	40 %	20 %	20 %	20 %	218437207
112	NC_011729	CATTT	2	10	216530	216539	20 %	60 %	0 %	20 %	218437207
113	NC_011729	ATAAA	2	10	217285	217294	80 %	20 %	0 %	0 %	218437208
114	NC_011729	AGAAA	2	10	217654	217663	80 %	0 %	20 %	0 %	218437208
115	NC_011729	TAAAA	2	10	220298	220307	80 %	20 %	0 %	0 %	218437211
116	NC_011729	TCAAC	2	10	221145	221154	40 %	20 %	0 %	40 %	218437212
117	NC_011729	AATTA	2	10	223675	223684	60 %	40 %	0 %	0 %	218437213
118	NC_011729	AATTA	2	10	224155	224164	60 %	40 %	0 %	0 %	218437213
119	NC_011729	ATTGG	2	10	225861	225870	20 %	40 %	40 %	0 %	218437214
120	NC_011729	TTGGT	2	10	226915	226924	0 %	60 %	40 %	0 %	218437215
121	NC_011729	ACTAG	2	10	227632	227641	40 %	20 %	20 %	20 %	218437216
122	NC_011729	TATTG	2	10	228654	228663	20 %	60 %	20 %	0 %	218437217
123	NC_011729	TTTTA	2	10	232633	232642	20 %	80 %	0 %	0 %	218437219
124	NC_011729	TTTAG	2	10	232712	232721	20 %	60 %	20 %	0 %	218437219
125	NC_011729	CAACT	2	10	233764	233773	40 %	20 %	0 %	40 %	218437220
126	NC_011729	AAACT	2	10	240863	240872	60 %	20 %	0 %	20 %	218437227
127	NC_011729	CAATT	2	10	242932	242941	40 %	40 %	0 %	20 %	218437230
128	NC_011729	AAAAT	2	10	243333	243342	80 %	20 %	0 %	0 %	218437230
129	NC_011729	TTATG	2	10	245199	245208	20 %	60 %	20 %	0 %	218437232
130	NC_011729	ATCTA	2	10	245588	245597	40 %	40 %	0 %	20 %	218437232
131	NC_011729	ACTCA	2	10	246336	246345	40 %	20 %	0 %	40 %	218437233
132	NC_011729	ACCTT	2	10	246641	246650	20 %	40 %	0 %	40 %	218437234
133	NC_011729	GTCTT	2	10	246872	246881	0 %	60 %	20 %	20 %	218437234
134	NC_011729	TCAAA	2	10	249796	249805	60 %	20 %	0 %	20 %	218437237
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