MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 16209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	CATT	2	8	1415	1422	25 %	50 %	0 %	25 %	218437014
2	NC_011729	TTGT	2	8	1541	1548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	TAAT	2	8	1715	1722	50 %	50 %	0 %	0 %	218437015
4	NC_011729	GGAG	2	8	2199	2206	25 %	0 %	75 %	0 %	218437015
5	NC_011729	ATTT	2	8	2445	2452	25 %	75 %	0 %	0 %	218437015
6	NC_011729	AAAT	2	8	2637	2644	75 %	25 %	0 %	0 %	218437016
7	NC_011729	GATG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
8	NC_011729	TGGG	2	8	3066	3073	0 %	25 %	75 %	0 %	218437016
9	NC_011729	TGGA	2	8	3174	3181	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
10	NC_011729	TGAC	2	8	3799	3806	25 %	25 %	25 %	25 %	218437017
11	NC_011729	TTTC	2	8	3965	3972	0 %	75 %	0 %	25 %	218437017
12	NC_011729	AATT	2	8	4043	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	218437017
13	NC_011729	ATCT	2	8	4303	4310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011729	AATA	2	8	5083	5090	75 %	25 %	0 %	0 %	218437018
15	NC_011729	CCCT	2	8	6102	6109	0 %	25 %	0 %	75 %	218437019
16	NC_011729	ATTA	2	8	6390	6397	50 %	50 %	0 %	0 %	218437019
17	NC_011729	ATTT	2	8	6525	6532	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
18	NC_011729	ATTT	2	8	6661	6668	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
19	NC_011729	GAAG	2	8	6693	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	218437019
20	NC_011729	ATTT	2	8	7217	7224	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
21	NC_011729	AATT	2	8	7294	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011729	CCTG	2	8	7883	7890	0 %	25 %	25 %	50 %	218437020
23	NC_011729	CGAT	2	8	8500	8507	25 %	25 %	25 %	25 %	218437021
24	NC_011729	AATT	2	8	8636	8643	50 %	50 %	0 %	0 %	218437021
25	NC_011729	ACCG	2	8	8947	8954	25 %	0 %	25 %	50 %	218437022
26	NC_011729	ATAA	2	8	9065	9072	75 %	25 %	0 %	0 %	218437022
27	NC_011729	TAAA	2	8	9142	9149	75 %	25 %	0 %	0 %	218437022
28	NC_011729	AAGA	2	8	10044	10051	75 %	0 %	25 %	0 %	218437022
29	NC_011729	TTTA	2	8	11463	11470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011729	AATT	2	8	12573	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
31	NC_011729	TTCA	2	8	12855	12862	25 %	50 %	0 %	25 %	218437024
32	NC_011729	TGGG	2	8	12978	12985	0 %	25 %	75 %	0 %	218437024
33	NC_011729	GGAA	2	8	13057	13064	50 %	0 %	50 %	0 %	218437024
34	NC_011729	TTCT	2	8	13646	13653	0 %	75 %	0 %	25 %	218437024
35	NC_011729	ATTA	2	8	13824	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
36	NC_011729	TGAG	2	8	13867	13874	25 %	25 %	50 %	0 %	218437024
37	NC_011729	CCCG	2	8	14036	14043	0 %	0 %	25 %	75 %	218437024
38	NC_011729	AATC	2	8	14819	14826	50 %	25 %	0 %	25 %	218437025
39	NC_011729	AAAC	2	8	15093	15100	75 %	0 %	0 %	25 %	218437025
40	NC_011729	AATA	2	8	15152	15159	75 %	25 %	0 %	0 %	218437025
41	NC_011729	TAGA	2	8	15428	15435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011729	ATTT	2	8	15553	15560	25 %	75 %	0 %	0 %	218437026
43	NC_011729	TGAT	2	8	17552	17559	25 %	50 %	25 %	0 %	218437028
44	NC_011729	TTGA	2	8	18266	18273	25 %	50 %	25 %	0 %	218437029
45	NC_011729	GTTT	2	8	19519	19526	0 %	75 %	25 %	0 %	218437030
46	NC_011729	GAAT	2	8	19638	19645	50 %	25 %	25 %	0 %	218437030
47	NC_011729	ATGA	2	8	20386	20393	50 %	25 %	25 %	0 %	218437031
48	NC_011729	CCCA	2	8	20679	20686	25 %	0 %	0 %	75 %	218437031
49	NC_011729	TTCC	2	8	20697	20704	0 %	50 %	0 %	50 %	218437031
50	NC_011729	ATTG	2	8	20757	20764	25 %	50 %	25 %	0 %	218437031
51	NC_011729	ATTA	2	8	20803	20810	50 %	50 %	0 %	0 %	218437031
52	NC_011729	TAAT	2	8	21006	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	218437031
53	NC_011729	ATTT	2	8	21080	21087	25 %	75 %	0 %	0 %	218437031
54	NC_011729	TAAT	2	8	22229	22236	50 %	50 %	0 %	0 %	218437032
55	NC_011729	AAAG	2	8	22509	22516	75 %	0 %	25 %	0 %	218437032
56	NC_011729	ATTT	2	8	23258	23265	25 %	75 %	0 %	0 %	218437033
57	NC_011729	ATGG	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	218437033
58	NC_011729	CTAT	2	8	24169	24176	25 %	50 %	0 %	25 %	218437033
59	NC_011729	TTAT	2	8	25667	25674	25 %	75 %	0 %	0 %	218437034
60	NC_011729	GTTT	2	8	27383	27390	0 %	75 %	25 %	0 %	218437036
61	NC_011729	AATG	2	8	28035	28042	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
62	NC_011729	GAAT	2	8	28470	28477	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
63	NC_011729	TTCC	2	8	29267	29274	0 %	50 %	0 %	50 %	218437037
64	NC_011729	CGAT	2	8	30339	30346	25 %	25 %	25 %	25 %	218437038
65	NC_011729	TTGT	2	8	32361	32368	0 %	75 %	25 %	0 %	218437039
66	NC_011729	ACTC	2	8	32752	32759	25 %	25 %	0 %	50 %	218437039
67	NC_011729	TTAA	2	8	33939	33946	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
68	NC_011729	TTAA	2	8	34011	34018	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
69	NC_011729	TTAA	2	8	34065	34072	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
70	NC_011729	GGAC	2	8	34230	34237	25 %	0 %	50 %	25 %	218437041
71	NC_011729	TAAT	2	8	34737	34744	50 %	50 %	0 %	0 %	218437042
72	NC_011729	TAGA	2	8	34749	34756	50 %	25 %	25 %	0 %	218437042
73	NC_011729	AATG	2	8	34844	34851	50 %	25 %	25 %	0 %	218437042
74	NC_011729	GATT	2	8	35308	35315	25 %	50 %	25 %	0 %	218437042
75	NC_011729	AAAG	2	8	35580	35587	75 %	0 %	25 %	0 %	218437042
76	NC_011729	CAGC	2	8	36038	36045	25 %	0 %	25 %	50 %	218437042
77	NC_011729	ATAA	2	8	36905	36912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011729	GTTT	2	8	37406	37413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011729	ACTT	2	8	37474	37481	25 %	50 %	0 %	25 %	218437044
80	NC_011729	TAAA	2	8	37861	37868	75 %	25 %	0 %	0 %	218437044
81	NC_011729	TCTT	2	8	38395	38402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011729	GATT	2	8	38710	38717	25 %	50 %	25 %	0 %	218437045
83	NC_011729	CGGA	2	8	38809	38816	25 %	0 %	50 %	25 %	218437045
84	NC_011729	GAAG	2	8	38868	38875	50 %	0 %	50 %	0 %	218437045
85	NC_011729	AAAC	2	8	38937	38944	75 %	0 %	0 %	25 %	218437045
86	NC_011729	CCAT	2	8	40089	40096	25 %	25 %	0 %	50 %	218437045
87	NC_011729	CCCG	2	8	40371	40378	0 %	0 %	25 %	75 %	218437045
88	NC_011729	TCGG	2	8	40658	40665	0 %	25 %	50 %	25 %	218437045
89	NC_011729	CGAT	2	8	40667	40674	25 %	25 %	25 %	25 %	218437045
90	NC_011729	CCAT	2	8	40929	40936	25 %	25 %	0 %	50 %	218437045
91	NC_011729	CCCA	2	8	41086	41093	25 %	0 %	0 %	75 %	218437045
92	NC_011729	AGGA	2	8	41530	41537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011729	TAAC	2	8	42012	42019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011729	AAAG	2	8	42068	42075	75 %	0 %	25 %	0 %	218437047
95	NC_011729	TTCT	2	8	42116	42123	0 %	75 %	0 %	25 %	218437047
96	NC_011729	AATC	2	8	42656	42663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011729	AGAA	2	8	43386	43393	75 %	0 %	25 %	0 %	218437048
98	NC_011729	TTAA	2	8	43999	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	218437048
99	NC_011729	GAAA	2	8	44379	44386	75 %	0 %	25 %	0 %	218437048
100	NC_011729	TCGA	2	8	45293	45300	25 %	25 %	25 %	25 %	218437049
101	NC_011729	GTTC	2	8	46068	46075	0 %	50 %	25 %	25 %	218437050
102	NC_011729	ATGA	2	8	46125	46132	50 %	25 %	25 %	0 %	218437050
103	NC_011729	GAAC	2	8	46155	46162	50 %	0 %	25 %	25 %	218437050
104	NC_011729	GACT	2	8	46294	46301	25 %	25 %	25 %	25 %	218437050
105	NC_011729	TTGA	2	8	46626	46633	25 %	50 %	25 %	0 %	218437050
106	NC_011729	AATT	2	8	46897	46904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011729	TTTG	2	8	47017	47024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011729	CCAA	2	8	47110	47117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011729	TATC	2	8	47921	47928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011729	GCGT	2	8	47975	47982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011729	GGGA	2	8	48219	48226	25 %	0 %	75 %	0 %	218437051
112	NC_011729	CGGG	2	8	49539	49546	0 %	0 %	75 %	25 %	218437052
113	NC_011729	TATT	2	8	49633	49640	25 %	75 %	0 %	0 %	218437052
114	NC_011729	AAGG	2	8	50070	50077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011729	ATGG	2	8	50397	50404	25 %	25 %	50 %	0 %	218437053
116	NC_011729	CAAG	2	8	50426	50433	50 %	0 %	25 %	25 %	218437053
117	NC_011729	ACAG	2	8	50569	50576	50 %	0 %	25 %	25 %	218437053
118	NC_011729	TTTA	2	8	51001	51008	25 %	75 %	0 %	0 %	218437053
119	NC_011729	CTCC	2	8	51276	51283	0 %	25 %	0 %	75 %	218437053
120	NC_011729	TAAT	2	8	51687	51694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011729	CAAC	2	8	52099	52106	50 %	0 %	0 %	50 %	218437054
122	NC_011729	TTCA	2	8	52619	52626	25 %	50 %	0 %	25 %	218437054
123	NC_011729	GGCG	2	8	52727	52734	0 %	0 %	75 %	25 %	218437054
124	NC_011729	TGAT	2	8	52890	52897	25 %	50 %	25 %	0 %	218437054
125	NC_011729	AGAA	2	8	53673	53680	75 %	0 %	25 %	0 %	218437054
126	NC_011729	AGAA	2	8	53806	53813	75 %	0 %	25 %	0 %	218437054
127	NC_011729	CTGT	2	8	54426	54433	0 %	50 %	25 %	25 %	218437055
128	NC_011729	ATAG	2	8	55580	55587	50 %	25 %	25 %	0 %	218437057
129	NC_011729	TTGT	2	8	56145	56152	0 %	75 %	25 %	0 %	218437058
130	NC_011729	TCAA	2	8	56231	56238	50 %	25 %	0 %	25 %	218437058
131	NC_011729	TATT	2	8	56578	56585	25 %	75 %	0 %	0 %	218437058
132	NC_011729	TGAG	2	8	56636	56643	25 %	25 %	50 %	0 %	218437058
133	NC_011729	TGCT	2	8	56711	56718	0 %	50 %	25 %	25 %	218437058
134	NC_011729	CAGA	2	8	56948	56955	50 %	0 %	25 %	25 %	218437059
135	NC_011729	GATA	2	8	57673	57680	50 %	25 %	25 %	0 %	218437060
136	NC_011729	CCAT	2	8	58979	58986	25 %	25 %	0 %	50 %	218437061
137	NC_011729	ATCA	2	8	59847	59854	50 %	25 %	0 %	25 %	218437062
138	NC_011729	TGGT	2	8	60190	60197	0 %	50 %	50 %	0 %	218437062
139	NC_011729	AATA	2	8	60321	60328	75 %	25 %	0 %	0 %	218437062
140	NC_011729	CGGG	2	8	62102	62109	0 %	0 %	75 %	25 %	218437063
141	NC_011729	TGAG	2	8	63042	63049	25 %	25 %	50 %	0 %	218437065
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