MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 12155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	CATT	2	8	1415	1422	25 %	50 %	0 %	25 %	218437014
2	NC_011729	TAAT	2	8	1715	1722	50 %	50 %	0 %	0 %	218437015
3	NC_011729	GGAG	2	8	2199	2206	25 %	0 %	75 %	0 %	218437015
4	NC_011729	ATTT	2	8	2445	2452	25 %	75 %	0 %	0 %	218437015
5	NC_011729	AAAT	2	8	2637	2644	75 %	25 %	0 %	0 %	218437016
6	NC_011729	GATG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
7	NC_011729	TGGG	2	8	3066	3073	0 %	25 %	75 %	0 %	218437016
8	NC_011729	TGGA	2	8	3174	3181	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
9	NC_011729	TGAC	2	8	3799	3806	25 %	25 %	25 %	25 %	218437017
10	NC_011729	TTTC	2	8	3965	3972	0 %	75 %	0 %	25 %	218437017
11	NC_011729	AATT	2	8	4043	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	218437017
12	NC_011729	AATA	2	8	5083	5090	75 %	25 %	0 %	0 %	218437018
13	NC_011729	CCCT	2	8	6102	6109	0 %	25 %	0 %	75 %	218437019
14	NC_011729	ATTA	2	8	6390	6397	50 %	50 %	0 %	0 %	218437019
15	NC_011729	ATTT	2	8	6525	6532	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
16	NC_011729	ATTT	2	8	6661	6668	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
17	NC_011729	GAAG	2	8	6693	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	218437019
18	NC_011729	ATTT	2	8	7217	7224	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
19	NC_011729	CCTG	2	8	7883	7890	0 %	25 %	25 %	50 %	218437020
20	NC_011729	CGAT	2	8	8500	8507	25 %	25 %	25 %	25 %	218437021
21	NC_011729	AATT	2	8	8636	8643	50 %	50 %	0 %	0 %	218437021
22	NC_011729	ACCG	2	8	8947	8954	25 %	0 %	25 %	50 %	218437022
23	NC_011729	ATAA	2	8	9065	9072	75 %	25 %	0 %	0 %	218437022
24	NC_011729	TAAA	2	8	9142	9149	75 %	25 %	0 %	0 %	218437022
25	NC_011729	AAGA	2	8	10044	10051	75 %	0 %	25 %	0 %	218437022
26	NC_011729	AATT	2	8	12573	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
27	NC_011729	TTCA	2	8	12855	12862	25 %	50 %	0 %	25 %	218437024
28	NC_011729	TGGG	2	8	12978	12985	0 %	25 %	75 %	0 %	218437024
29	NC_011729	GGAA	2	8	13057	13064	50 %	0 %	50 %	0 %	218437024
30	NC_011729	TTCT	2	8	13646	13653	0 %	75 %	0 %	25 %	218437024
31	NC_011729	ATTA	2	8	13824	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
32	NC_011729	TGAG	2	8	13867	13874	25 %	25 %	50 %	0 %	218437024
33	NC_011729	CCCG	2	8	14036	14043	0 %	0 %	25 %	75 %	218437024
34	NC_011729	AATC	2	8	14819	14826	50 %	25 %	0 %	25 %	218437025
35	NC_011729	AAAC	2	8	15093	15100	75 %	0 %	0 %	25 %	218437025
36	NC_011729	AATA	2	8	15152	15159	75 %	25 %	0 %	0 %	218437025
37	NC_011729	ATTT	2	8	15553	15560	25 %	75 %	0 %	0 %	218437026
38	NC_011729	TGAT	2	8	17552	17559	25 %	50 %	25 %	0 %	218437028
39	NC_011729	TTGA	2	8	18266	18273	25 %	50 %	25 %	0 %	218437029
40	NC_011729	GTTT	2	8	19519	19526	0 %	75 %	25 %	0 %	218437030
41	NC_011729	GAAT	2	8	19638	19645	50 %	25 %	25 %	0 %	218437030
42	NC_011729	ATGA	2	8	20386	20393	50 %	25 %	25 %	0 %	218437031
43	NC_011729	CCCA	2	8	20679	20686	25 %	0 %	0 %	75 %	218437031
44	NC_011729	TTCC	2	8	20697	20704	0 %	50 %	0 %	50 %	218437031
45	NC_011729	ATTG	2	8	20757	20764	25 %	50 %	25 %	0 %	218437031
46	NC_011729	ATTA	2	8	20803	20810	50 %	50 %	0 %	0 %	218437031
47	NC_011729	TAAT	2	8	21006	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	218437031
48	NC_011729	ATTT	2	8	21080	21087	25 %	75 %	0 %	0 %	218437031
49	NC_011729	TAAT	2	8	22229	22236	50 %	50 %	0 %	0 %	218437032
50	NC_011729	AAAG	2	8	22509	22516	75 %	0 %	25 %	0 %	218437032
51	NC_011729	ATTT	2	8	23258	23265	25 %	75 %	0 %	0 %	218437033
52	NC_011729	ATGG	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	218437033
53	NC_011729	CTAT	2	8	24169	24176	25 %	50 %	0 %	25 %	218437033
54	NC_011729	TTAT	2	8	25667	25674	25 %	75 %	0 %	0 %	218437034
55	NC_011729	GTTT	2	8	27383	27390	0 %	75 %	25 %	0 %	218437036
56	NC_011729	AATG	2	8	28035	28042	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
57	NC_011729	GAAT	2	8	28470	28477	50 %	25 %	25 %	0 %	218437036
58	NC_011729	TTCC	2	8	29267	29274	0 %	50 %	0 %	50 %	218437037
59	NC_011729	CGAT	2	8	30339	30346	25 %	25 %	25 %	25 %	218437038
60	NC_011729	TTGT	2	8	32361	32368	0 %	75 %	25 %	0 %	218437039
61	NC_011729	ACTC	2	8	32752	32759	25 %	25 %	0 %	50 %	218437039
62	NC_011729	TTAA	2	8	33939	33946	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
63	NC_011729	TTAA	2	8	34011	34018	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
64	NC_011729	TTAA	2	8	34065	34072	50 %	50 %	0 %	0 %	218437041
65	NC_011729	GGAC	2	8	34230	34237	25 %	0 %	50 %	25 %	218437041
66	NC_011729	TAAT	2	8	34737	34744	50 %	50 %	0 %	0 %	218437042
67	NC_011729	TAGA	2	8	34749	34756	50 %	25 %	25 %	0 %	218437042
68	NC_011729	AATG	2	8	34844	34851	50 %	25 %	25 %	0 %	218437042
69	NC_011729	GATT	2	8	35308	35315	25 %	50 %	25 %	0 %	218437042
70	NC_011729	AAAG	2	8	35580	35587	75 %	0 %	25 %	0 %	218437042
71	NC_011729	CAGC	2	8	36038	36045	25 %	0 %	25 %	50 %	218437042
72	NC_011729	ACTT	2	8	37474	37481	25 %	50 %	0 %	25 %	218437044
73	NC_011729	TAAA	2	8	37861	37868	75 %	25 %	0 %	0 %	218437044
74	NC_011729	GATT	2	8	38710	38717	25 %	50 %	25 %	0 %	218437045
75	NC_011729	CGGA	2	8	38809	38816	25 %	0 %	50 %	25 %	218437045
76	NC_011729	GAAG	2	8	38868	38875	50 %	0 %	50 %	0 %	218437045
77	NC_011729	AAAC	2	8	38937	38944	75 %	0 %	0 %	25 %	218437045
78	NC_011729	CCAT	2	8	40089	40096	25 %	25 %	0 %	50 %	218437045
79	NC_011729	CCCG	2	8	40371	40378	0 %	0 %	25 %	75 %	218437045
80	NC_011729	TCGG	2	8	40658	40665	0 %	25 %	50 %	25 %	218437045
81	NC_011729	CGAT	2	8	40667	40674	25 %	25 %	25 %	25 %	218437045
82	NC_011729	CCAT	2	8	40929	40936	25 %	25 %	0 %	50 %	218437045
83	NC_011729	CCCA	2	8	41086	41093	25 %	0 %	0 %	75 %	218437045
84	NC_011729	AAAG	2	8	42068	42075	75 %	0 %	25 %	0 %	218437047
85	NC_011729	TTCT	2	8	42116	42123	0 %	75 %	0 %	25 %	218437047
86	NC_011729	AGAA	2	8	43386	43393	75 %	0 %	25 %	0 %	218437048
87	NC_011729	TTAA	2	8	43999	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	218437048
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89	NC_011729	TCGA	2	8	45293	45300	25 %	25 %	25 %	25 %	218437049
90	NC_011729	GTTC	2	8	46068	46075	0 %	50 %	25 %	25 %	218437050
91	NC_011729	ATGA	2	8	46125	46132	50 %	25 %	25 %	0 %	218437050
92	NC_011729	GAAC	2	8	46155	46162	50 %	0 %	25 %	25 %	218437050
93	NC_011729	GACT	2	8	46294	46301	25 %	25 %	25 %	25 %	218437050
94	NC_011729	TTGA	2	8	46626	46633	25 %	50 %	25 %	0 %	218437050
95	NC_011729	GGGA	2	8	48219	48226	25 %	0 %	75 %	0 %	218437051
96	NC_011729	CGGG	2	8	49539	49546	0 %	0 %	75 %	25 %	218437052
97	NC_011729	TATT	2	8	49633	49640	25 %	75 %	0 %	0 %	218437052
98	NC_011729	ATGG	2	8	50397	50404	25 %	25 %	50 %	0 %	218437053
99	NC_011729	CAAG	2	8	50426	50433	50 %	0 %	25 %	25 %	218437053
100	NC_011729	ACAG	2	8	50569	50576	50 %	0 %	25 %	25 %	218437053
101	NC_011729	TTTA	2	8	51001	51008	25 %	75 %	0 %	0 %	218437053
102	NC_011729	CTCC	2	8	51276	51283	0 %	25 %	0 %	75 %	218437053
103	NC_011729	CAAC	2	8	52099	52106	50 %	0 %	0 %	50 %	218437054
104	NC_011729	TTCA	2	8	52619	52626	25 %	50 %	0 %	25 %	218437054
105	NC_011729	GGCG	2	8	52727	52734	0 %	0 %	75 %	25 %	218437054
106	NC_011729	TGAT	2	8	52890	52897	25 %	50 %	25 %	0 %	218437054
107	NC_011729	AGAA	2	8	53673	53680	75 %	0 %	25 %	0 %	218437054
108	NC_011729	AGAA	2	8	53806	53813	75 %	0 %	25 %	0 %	218437054
109	NC_011729	CTGT	2	8	54426	54433	0 %	50 %	25 %	25 %	218437055
110	NC_011729	ATAG	2	8	55580	55587	50 %	25 %	25 %	0 %	218437057
111	NC_011729	TTGT	2	8	56145	56152	0 %	75 %	25 %	0 %	218437058
112	NC_011729	TCAA	2	8	56231	56238	50 %	25 %	0 %	25 %	218437058
113	NC_011729	TATT	2	8	56578	56585	25 %	75 %	0 %	0 %	218437058
114	NC_011729	TGAG	2	8	56636	56643	25 %	25 %	50 %	0 %	218437058
115	NC_011729	TGCT	2	8	56711	56718	0 %	50 %	25 %	25 %	218437058
116	NC_011729	CAGA	2	8	56948	56955	50 %	0 %	25 %	25 %	218437059
117	NC_011729	GATA	2	8	57673	57680	50 %	25 %	25 %	0 %	218437060
118	NC_011729	CCAT	2	8	58979	58986	25 %	25 %	0 %	50 %	218437061
119	NC_011729	ATCA	2	8	59847	59854	50 %	25 %	0 %	25 %	218437062
120	NC_011729	TGGT	2	8	60190	60197	0 %	50 %	50 %	0 %	218437062
121	NC_011729	AATA	2	8	60321	60328	75 %	25 %	0 %	0 %	218437062
122	NC_011729	CGGG	2	8	62102	62109	0 %	0 %	75 %	25 %	218437063
123	NC_011729	TGAG	2	8	63042	63049	25 %	25 %	50 %	0 %	218437065
124	NC_011729	GATT	2	8	63437	63444	25 %	50 %	25 %	0 %	218437066
125	NC_011729	TTGT	2	8	64627	64634	0 %	75 %	25 %	0 %	218437067
126	NC_011729	AAGG	2	8	65323	65330	50 %	0 %	50 %	0 %	218437068
127	NC_011729	TTGA	2	8	65562	65569	25 %	50 %	25 %	0 %	218437068
128	NC_011729	CCTG	2	8	66214	66221	0 %	25 %	25 %	50 %	218437068
129	NC_011729	GATA	2	8	66375	66382	50 %	25 %	25 %	0 %	218437068
130	NC_011729	ATAA	2	8	66433	66440	75 %	25 %	0 %	0 %	218437068
131	NC_011729	TGTT	2	8	67105	67112	0 %	75 %	25 %	0 %	218437069
132	NC_011729	TGGA	2	8	67336	67343	25 %	25 %	50 %	0 %	218437069
133	NC_011729	AATT	2	8	67693	67700	50 %	50 %	0 %	0 %	218437069
134	NC_011729	AATT	2	8	68667	68674	50 %	50 %	0 %	0 %	218437070
135	NC_011729	AAGG	2	8	70341	70348	50 %	0 %	50 %	0 %	218437072
136	NC_011729	GGAG	2	8	70657	70664	25 %	0 %	75 %	0 %	218437072
137	NC_011729	CCAA	2	8	70785	70792	50 %	0 %	0 %	50 %	218437072
138	NC_011729	TAAA	2	8	71170	71177	75 %	25 %	0 %	0 %	218437073
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