MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 78715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	TCT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011729	TAT	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	ATT	2	6	273	278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
4	NC_011729	TGT	2	6	284	289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437014
5	NC_011729	TTA	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
6	NC_011729	GTC	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437014
7	NC_011729	AAT	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437014
8	NC_011729	TGC	2	6	482	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437014
9	NC_011729	TTA	2	6	723	728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
10	NC_011729	GAT	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437014
11	NC_011729	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437014
12	NC_011729	CCT	2	6	840	845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437014
13	NC_011729	AGA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
14	NC_011729	TCC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437014
15	NC_011729	CGC	2	6	1218	1223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437014
16	NC_011729	GAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
17	NC_011729	AAG	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
18	NC_011729	AGG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011729	TCT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437015
20	NC_011729	GCT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437015
21	NC_011729	ATT	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
22	NC_011729	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437015
23	NC_011729	ATC	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437015
24	NC_011729	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
25	NC_011729	TTA	2	6	1969	1974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
26	NC_011729	CCT	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437015
27	NC_011729	GCT	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437015
28	NC_011729	GAG	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437015
29	NC_011729	GGA	2	6	2101	2106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437015
30	NC_011729	ATT	2	6	2457	2462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
31	NC_011729	CCG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437015
32	NC_011729	TAT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
33	NC_011729	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011729	ATG	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437016
35	NC_011729	GGT	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437016
36	NC_011729	TCA	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437016
37	NC_011729	AAT	2	6	3003	3008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
38	NC_011729	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
39	NC_011729	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437016
40	NC_011729	CCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437016
41	NC_011729	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
42	NC_011729	AGG	3	9	3321	3329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
43	NC_011729	TAT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437016
44	NC_011729	GGT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437016
45	NC_011729	AGA	2	6	3354	3359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437016
46	NC_011729	GAG	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
47	NC_011729	AAC	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437016
48	NC_011729	CTT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437016
49	NC_011729	GGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
50	NC_011729	ATA	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437017
51	NC_011729	CAT	2	6	3890	3895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437017
52	NC_011729	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437017
53	NC_011729	CGA	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437017
54	NC_011729	GGT	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437017
55	NC_011729	TTC	2	6	4323	4328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011729	CAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011729	CAT	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011729	TAA	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011729	AAG	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011729	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011729	TTC	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437018
62	NC_011729	TAA	2	6	4956	4961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
63	NC_011729	ACT	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437018
64	NC_011729	AGC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
65	NC_011729	AGC	2	6	5111	5116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
66	NC_011729	TTA	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
67	NC_011729	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437018
68	NC_011729	CAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
69	NC_011729	TAA	2	6	5417	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
70	NC_011729	CAG	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
71	NC_011729	TAT	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
72	NC_011729	ATA	2	6	5459	5464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
73	NC_011729	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
74	NC_011729	GAT	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011729	ATA	2	6	5689	5694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011729	TTA	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
77	NC_011729	CTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437019
78	NC_011729	TTG	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437019
79	NC_011729	ACA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437019
80	NC_011729	GAA	2	6	6089	6094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
81	NC_011729	CAA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437019
82	NC_011729	GAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
83	NC_011729	ATT	2	6	6193	6198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
84	NC_011729	TTA	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
85	NC_011729	AGC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437019
86	NC_011729	AAG	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
87	NC_011729	GCA	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437019
88	NC_011729	CGG	2	6	6512	6517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
89	NC_011729	GGA	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437019
90	NC_011729	GTC	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437019
91	NC_011729	ATG	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
92	NC_011729	GCG	2	6	6808	6813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
93	NC_011729	GGC	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
94	NC_011729	GTG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437019
95	NC_011729	AGG	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437019
96	NC_011729	CCA	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437019
97	NC_011729	ATC	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437019
98	NC_011729	TGA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
99	NC_011729	GTC	2	6	7160	7165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437019
100	NC_011729	AAG	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
101	NC_011729	GTA	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011729	ATA	2	6	7308	7313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011729	AAC	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011729	AAG	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011729	AAT	2	6	7694	7699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437020
106	NC_011729	CGA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437020
107	NC_011729	AAT	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437020
108	NC_011729	GTT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437020
109	NC_011729	CAA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437020
110	NC_011729	GAC	2	6	8070	8075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437020
111	NC_011729	GTT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437020
112	NC_011729	AAC	2	6	8119	8124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437020
113	NC_011729	TAA	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437020
114	NC_011729	AAT	2	6	8192	8197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437021
115	NC_011729	TCT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437021
116	NC_011729	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437021
117	NC_011729	GAC	2	6	8392	8397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437021
118	NC_011729	GTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437021
119	NC_011729	TCC	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437021
120	NC_011729	ATA	2	6	8456	8461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437021
121	NC_011729	TCC	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437021
122	NC_011729	TAA	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437021
123	NC_011729	GTT	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437021
124	NC_011729	AAT	2	6	8839	8844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437021
125	NC_011729	CTA	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437021
126	NC_011729	TTA	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437021
127	NC_011729	TCA	2	6	8881	8886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437021
128	NC_011729	CGG	2	6	8922	8927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437022
129	NC_011729	TCA	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437022
130	NC_011729	AAT	2	6	9100	9105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437022
131	NC_011729	ATT	2	6	9113	9118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437022
132	NC_011729	CTT	2	6	9120	9125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437022
133	NC_011729	GAC	2	6	9130	9135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437022
134	NC_011729	CAA	2	6	9240	9245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437022
135	NC_011729	TAG	2	6	9285	9290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437022
136	NC_011729	AGT	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437022
137	NC_011729	AAC	2	6	9385	9390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437022
138	NC_011729	TTG	2	6	9652	9657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437022
139	NC_011729	GAC	2	6	10089	10094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437023
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142	NC_011729	CAT	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437023
143	NC_011729	ATC	3	9	10383	10391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437023
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150	NC_011729	TTG	2	6	11016	11021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437023
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155	NC_011729	CGG	2	6	11288	11293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437023
156	NC_011729	TGA	2	6	11294	11299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437023
157	NC_011729	CTA	2	6	11509	11514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011729	CTT	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011729	GTT	2	6	11704	11709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011729	TGA	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011729	AAG	2	6	11808	11813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011729	CAC	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_011729	CAT	2	6	11860	11865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437024
164	NC_011729	GGA	2	6	11885	11890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437024
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172	NC_011729	CCT	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437024
173	NC_011729	CAT	2	6	12425	12430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437024
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211	NC_011729	GTT	2	6	15318	15323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_011729	ACC	2	6	16463	16468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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239	NC_011729	ATA	2	6	17744	17749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437028
240	NC_011729	GAG	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_011729	TTG	2	6	18044	18049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437029
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250	NC_011729	ATA	2	6	18668	18673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437029
251	NC_011729	CAC	2	6	18740	18745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437029
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254	NC_011729	TAA	2	6	19181	19186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437030
255	NC_011729	TGA	2	6	19210	19215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437030
256	NC_011729	GGC	2	6	19239	19244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437030
257	NC_011729	AAT	2	6	19694	19699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437030
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259	NC_011729	TCG	2	6	19898	19903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437030
260	NC_011729	AAT	2	6	20003	20008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437030
261	NC_011729	GAT	2	6	20126	20131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437030
262	NC_011729	AGA	2	6	20422	20427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437031
263	NC_011729	AAT	2	6	20437	20442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437031
264	NC_011729	ATA	2	6	20512	20517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437031
265	NC_011729	AAT	2	6	20523	20528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437031
266	NC_011729	CTG	2	6	20598	20603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437031
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285	NC_011729	TAA	2	6	21780	21785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437032
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291	NC_011729	ATA	2	6	22467	22472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437032
292	NC_011729	CTC	2	6	22637	22642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437032
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294	NC_011729	AAC	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_011729	TCC	2	6	22986	22991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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299	NC_011729	AAT	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437033
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