MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 12420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	TCT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011729	TAT	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	AGG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011729	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011729	TTC	2	6	4323	4328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011729	CAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011729	CAT	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011729	TAA	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011729	AAG	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011729	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011729	GAT	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011729	ATA	2	6	5689	5694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011729	GTA	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011729	ATA	2	6	7308	7313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011729	AAC	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011729	AAG	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011729	CTA	2	6	11509	11514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011729	CTT	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011729	GTT	2	6	11704	11709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011729	TGA	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011729	AAG	2	6	11808	11813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011729	CAC	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011729	GTT	2	6	15318	15323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011729	TAA	2	6	16388	16393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011729	ACC	2	6	16463	16468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011729	ATG	2	6	16501	16506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011729	GAG	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011729	AAC	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011729	TCC	2	6	22986	22991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011729	TAA	2	6	23019	23024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011729	TTA	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011729	CTA	2	6	23035	23040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011729	ATG	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011729	TCT	2	6	28894	28899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011729	ATG	2	6	30245	30250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011729	ATA	2	6	31012	31017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011729	CTT	2	6	33409	33414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011729	AAG	2	6	33455	33460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011729	TAA	2	6	34446	34451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011729	TTA	2	6	34469	34474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011729	TTG	2	6	34615	34620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011729	ATG	2	6	34639	34644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011729	TGA	2	6	36181	36186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011729	ATT	2	6	36293	36298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011729	TAG	2	6	36989	36994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011729	CCT	2	6	37006	37011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011729	CCT	2	6	37035	37040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011729	CCT	2	6	37047	37052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011729	TCC	2	6	37054	37059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011729	ATT	2	6	37123	37128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011729	GTA	2	6	37133	37138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011729	AGA	2	6	37247	37252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011729	ATA	2	6	37423	37428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011729	ATG	2	6	38311	38316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011729	ATT	2	6	38325	38330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011729	CTC	2	6	38407	38412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011729	GGA	2	6	38441	38446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011729	ATT	2	6	41434	41439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011729	CCT	2	6	41472	41477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011729	AGG	2	6	41486	41491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011729	AGG	2	6	41500	41505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011729	CCT	2	6	42024	42029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011729	CCT	2	6	42031	42036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011729	CCT	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011729	ATT	2	6	42670	42675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011729	TCT	2	6	42758	42763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011729	TAT	2	6	42803	42808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011729	AGG	2	6	45689	45694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011729	AAC	2	6	45707	45712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011729	ATT	3	9	46965	46973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011729	ATA	2	6	47046	47051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011729	TTA	2	6	47245	47250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011729	AGT	2	6	47310	47315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011729	GAT	2	6	47508	47513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011729	GAT	2	6	47563	47568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011729	CAC	2	6	47579	47584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011729	ACA	2	6	47663	47668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011729	AGA	2	6	47707	47712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011729	TCC	2	6	50106	50111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011729	ATA	2	6	50172	50177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011729	AAC	2	6	50199	50204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011729	TAA	2	6	51529	51534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011729	GAC	2	6	51547	51552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011729	AAT	2	6	51577	51582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011729	TTC	2	6	51761	51766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011729	GAA	2	6	51788	51793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011729	AGA	2	6	51896	51901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011729	ATT	2	6	51963	51968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011729	CAA	2	6	53958	53963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011729	AGA	2	6	54897	54902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011729	TCT	2	6	55603	55608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011729	TAA	2	6	55640	55645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011729	TTG	2	6	55693	55698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011729	ATT	2	6	55761	55766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011729	ATT	2	6	55768	55773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011729	ATT	2	6	55858	55863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011729	TCA	2	6	57442	57447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011729	TCA	2	6	57456	57461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011729	TCA	2	6	57463	57468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011729	TCA	2	6	57470	57475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011729	GTC	2	6	57483	57488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011729	CTA	2	6	57540	57545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011729	TGA	2	6	57957	57962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011729	TGA	2	6	57964	57969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011729	ATT	2	6	57978	57983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011729	GTT	2	6	59317	59322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011729	TAA	2	6	59378	59383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011729	CCT	2	6	61526	61531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011729	CGG	2	6	61614	61619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011729	CTT	3	9	62179	62187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011729	TAG	2	6	62653	62658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011729	AAT	2	6	62721	62726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011729	TAA	2	6	63073	63078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011729	TGC	2	6	63093	63098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011729	TCC	2	6	63718	63723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011729	AAT	2	6	63754	63759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011729	TCA	2	6	63795	63800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011729	ATT	3	9	68126	68134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011729	CTC	2	6	69940	69945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011729	AAC	2	6	69950	69955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011729	CAA	2	6	69991	69996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011729	TTG	2	6	70006	70011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011729	CTC	2	6	71996	72001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011729	CAA	2	6	72117	72122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011729	TAT	3	9	74065	74073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011729	AAT	2	6	74098	74103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011729	AAT	2	6	74130	74135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011729	GCT	2	6	78480	78485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011729	AGG	2	6	78516	78521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011729	TTG	2	6	78586	78591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011729	TGA	3	9	78642	78650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011729	TTA	2	6	78659	78664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011729	TAA	2	6	78695	78700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011729	TTA	2	6	78720	78725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011729	TAA	2	6	80162	80167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011729	AGG	2	6	83015	83020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011729	TTG	2	6	83294	83299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011729	TAG	2	6	83375	83380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011729	CAA	2	6	83424	83429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_011729	CAA	2	6	83598	83603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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