MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011728	TATAA	2	10	17	26	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011728	ACTAT	2	10	3281	3290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011728	AATTT	2	10	8281	8290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011728	TAAAT	2	10	19970	19979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011728	AATTA	2	10	22694	22703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011728	AAATT	2	10	49217	49226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011728	AATTA	2	10	56760	56769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011728	ATAAA	2	10	70299	70308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011728	AAAAT	2	10	80915	80924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011728	ATTAA	2	10	83878	83887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011728	CTTTT	2	10	87856	87865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011728	ACCAA	2	10	88021	88030	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011728	CTTTT	2	10	88299	88308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011728	AAATT	2	10	88613	88622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011728	ATAAA	2	10	94051	94060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011728	ATAAA	2	10	101380	101389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011728	TACAA	2	10	108154	108163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011728	TAAAA	2	10	131187	131196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011728	TTATA	2	10	131199	131208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011728	TATAA	2	10	143981	143990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011728	TAAAA	2	10	150595	150604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011728	TAAAA	2	10	150638	150647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011728	TAAAG	2	10	152759	152768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011728	GACTT	2	10	158221	158230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011728	ATCAG	2	10	169158	169167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011728	TTTAA	2	10	188983	188992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011728	TAAAA	2	10	193393	193402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011728	TAAAA	2	10	195148	195157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011728	AAAAG	2	10	195232	195241	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011728	GTCAA	2	10	202469	202478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011728	AATAA	2	10	207051	207060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011728	ACAAA	2	10	210300	210309	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011728	AAAAT	2	10	210609	210618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011728	CAAAA	2	10	210907	210916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011728	ACAAA	2	10	242339	242348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011728	TAAAA	2	10	244105	244114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011728	AGAAA	2	10	244882	244891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011728	TAAAA	2	10	245014	245023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011728	AAAAT	2	10	245049	245058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011728	AGAAA	2	10	247852	247861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011728	TAAAA	2	10	252444	252453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011728	AACAA	2	10	263106	263115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011728	CTTTG	2	10	273028	273037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011728	TATAA	3	15	273095	273109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011728	TTTTA	2	10	273138	273147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011728	AAACA	2	10	317508	317517	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011728	AGATT	2	10	317564	317573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011728	TAATT	2	10	327252	327261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011728	AAAGC	2	10	339365	339374	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011728	AAAAC	2	10	342946	342955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011728	ATAAA	2	10	354767	354776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011728	AAAGT	2	10	356260	356269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011728	TAAAA	2	10	360506	360515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011728	TAAAA	2	10	394599	394608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011728	TTTCA	2	10	404973	404982	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011728	AATTT	2	10	407880	407889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011728	TTAAT	2	10	410050	410059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011728	ATTTT	2	10	411503	411512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011728	GATTT	2	10	411573	411582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011728	AGAAA	2	10	415818	415827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011728	CTCCC	2	10	437035	437044	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_011728	AAAAG	2	10	440618	440627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011728	TCGCT	2	10	440958	440967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011728	TTATT	2	10	442207	442216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011728	AAAAC	2	10	445483	445492	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011728	ATTCA	2	10	460071	460080	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011728	TAAAT	2	10	472048	472057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011728	TTTTA	2	10	472317	472326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011728	TATTT	2	10	477292	477301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011728	TTTTA	2	10	485601	485610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011728	TTATT	2	10	488153	488162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011728	ATAAA	2	10	490680	490689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011728	TTCTT	2	10	529724	529733	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011728	ATTTA	2	10	530307	530316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011728	TTTTA	2	10	535374	535383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011728	ATTTT	2	10	549892	549901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011728	TAATT	2	10	561961	561970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011728	ATTTA	2	10	573243	573252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011728	TAAAT	2	10	573321	573330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011728	TAATT	2	10	582196	582205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011728	TTTTA	2	10	583972	583981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011728	ATTTA	2	10	586964	586973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011728	TAAAT	5	25	586984	587008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011728	ATTTG	2	10	587126	587135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011728	GGATA	2	10	603050	603059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011728	CAATT	2	10	603098	603107	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011728	TTTGA	2	10	613067	613076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011728	AATTG	2	10	613238	613247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011728	TTGTA	2	10	613783	613792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011728	GTTTT	2	10	614805	614814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011728	ATTGT	2	10	626745	626754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011728	TATAT	2	10	630537	630546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011728	TAAAT	2	10	630556	630565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011728	ATTTA	2	10	630582	630591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011728	ATTTT	2	10	632254	632263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011728	ATTAA	3	15	641140	641154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011728	TTTAT	2	10	641644	641653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011728	TTAAA	2	10	658976	658985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011728	TTGAT	2	10	670936	670945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011728	TTAAA	2	10	682536	682545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011728	GAAGA	2	10	686623	686632	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011728	TAATT	2	10	698976	698985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011728	TTTTA	2	10	710795	710804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011728	TAGAA	2	10	710949	710958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011728	TATAA	2	10	720180	720189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011728	GATAT	2	10	730027	730036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011728	ATTAT	2	10	738631	738640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011728	ATTTT	2	10	740894	740903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011728	GATTT	2	10	747397	747406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011728	GAAAA	2	10	747859	747868	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011728	ATTAA	2	10	779327	779336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011728	TTTTG	2	10	785282	785291	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011728	CTTAA	2	10	795115	795124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011728	ATTAT	2	10	795127	795136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011728	TTTAG	2	10	801804	801813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011728	TTGTT	2	10	802764	802773	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011728	ATTTT	2	10	805607	805616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011728	AATTT	2	10	809315	809324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011728	ATAAA	2	10	811477	811486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011728	CTTTT	2	10	814568	814577	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011728	GTTTA	2	10	838499	838508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011728	CAGCA	2	10	847349	847358	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011728	GGTTT	2	10	848480	848489	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011728	AGTTT	2	10	866110	866119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011728	TTTAA	2	10	876007	876016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011728	AGTGG	2	10	876254	876263	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011728	TGTTA	2	10	882468	882477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011728	TTTTA	2	10	884195	884204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011728	TATAT	2	10	895408	895417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011728	AAATT	2	10	897804	897813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011728	TTTCT	2	10	899279	899288	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011728	TATTG	2	10	899581	899590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011728	TTTTA	2	10	901997	902006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011728	TAAAT	2	10	902040	902049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011728	ACTTA	2	10	903202	903211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011728	GAATT	2	10	903396	903405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011728	AATTT	2	10	903574	903583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011728	GGATA	2	10	903631	903640	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011728	AAAAT	2	10	904072	904081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011728	TAAGG	2	10	904243	904252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011728	AATAA	2	10	905684	905693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.