MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880103

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011727	TCAAAC	2	12	34	45	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011727	CCTAAC	2	12	1386	1397	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218249156
3	NC_011727	TAACGG	2	12	6252	6263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218249158
4	NC_011727	ACTTAT	2	12	6653	6664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218249158
5	NC_011727	AACGGA	2	12	6685	6696	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218249158
6	NC_011727	TTATAC	2	12	8185	8196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218249158
7	NC_011727	ACTTAT	2	12	8243	8254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218249158
8	NC_011727	AGTATG	2	12	8649	8660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
9	NC_011727	ACTGAA	2	12	8828	8839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218249158
10	NC_011727	GAATAT	2	12	8858	8869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218249158
11	NC_011727	TTATGA	2	12	8950	8961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218249158
12	NC_011727	ATGCTA	2	12	9156	9167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218249158
13	NC_011727	TTGTCA	2	12	10050	10061	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218249159
14	NC_011727	TACTTA	2	12	10929	10940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011727	CACACT	2	12	14109	14120	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218249164
16	NC_011727	AACAAG	2	12	15274	15285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218249164
17	NC_011727	GAGCAG	2	12	16503	16514	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218249164

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.