MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880103

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011727	AAGA	2	8	220	227	75 %	0 %	25 %	0 %	218249154
2	NC_011727	AATT	2	8	232	239	50 %	50 %	0 %	0 %	218249154
3	NC_011727	TTTA	2	8	440	447	25 %	75 %	0 %	0 %	218249155
4	NC_011727	AATT	2	8	514	521	50 %	50 %	0 %	0 %	218249155
5	NC_011727	TTAG	2	8	663	670	25 %	50 %	25 %	0 %	218249155
6	NC_011727	AATC	2	8	731	738	50 %	25 %	0 %	25 %	218249156
7	NC_011727	ACTT	2	8	740	747	25 %	50 %	0 %	25 %	218249156
8	NC_011727	TTTG	2	8	984	991	0 %	75 %	25 %	0 %	218249156
9	NC_011727	TAGT	2	8	1242	1249	25 %	50 %	25 %	0 %	218249156
10	NC_011727	ATCT	2	8	1676	1683	25 %	50 %	0 %	25 %	218249156
11	NC_011727	TAAA	2	8	1767	1774	75 %	25 %	0 %	0 %	218249156
12	NC_011727	GTGG	2	8	2162	2169	0 %	25 %	75 %	0 %	218249156
13	NC_011727	TTCT	2	8	2334	2341	0 %	75 %	0 %	25 %	218249156
14	NC_011727	TTTA	2	8	3995	4002	25 %	75 %	0 %	0 %	218249156
15	NC_011727	GACA	2	8	4332	4339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011727	ATGG	2	8	5814	5821	25 %	25 %	50 %	0 %	218249158
17	NC_011727	TAGA	2	8	5979	5986	50 %	25 %	25 %	0 %	218249158
18	NC_011727	TTAA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	218249158
19	NC_011727	GATT	2	8	7441	7448	25 %	50 %	25 %	0 %	218249158
20	NC_011727	AATT	2	8	7596	7603	50 %	50 %	0 %	0 %	218249158
21	NC_011727	TCAA	2	8	7893	7900	50 %	25 %	0 %	25 %	218249158
22	NC_011727	ACTA	2	8	7991	7998	50 %	25 %	0 %	25 %	218249158
23	NC_011727	AATT	2	8	8937	8944	50 %	50 %	0 %	0 %	218249158
24	NC_011727	TATT	2	8	9008	9015	25 %	75 %	0 %	0 %	218249158
25	NC_011727	TTAT	2	8	9174	9181	25 %	75 %	0 %	0 %	218249158
26	NC_011727	TAGA	2	8	9342	9349	50 %	25 %	25 %	0 %	218249158
27	NC_011727	TTAT	2	8	9597	9604	25 %	75 %	0 %	0 %	218249158
28	NC_011727	AAAG	2	8	9628	9635	75 %	0 %	25 %	0 %	218249158
29	NC_011727	ACAG	2	8	10019	10026	50 %	0 %	25 %	25 %	218249159
30	NC_011727	GAAA	2	8	10190	10197	75 %	0 %	25 %	0 %	218249159
31	NC_011727	TGGC	2	8	10321	10328	0 %	25 %	50 %	25 %	218249159
32	NC_011727	ATTT	2	8	10738	10745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011727	TCTA	2	8	10861	10868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011727	CCTA	2	8	11206	11213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011727	ACCC	2	8	11224	11231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_011727	TTTG	2	8	11657	11664	0 %	75 %	25 %	0 %	218249160
37	NC_011727	AGCC	2	8	12685	12692	25 %	0 %	25 %	50 %	218249161
38	NC_011727	TAGT	2	8	12923	12930	25 %	50 %	25 %	0 %	218249161
39	NC_011727	TCAC	2	8	13150	13157	25 %	25 %	0 %	50 %	218249162
40	NC_011727	CATT	2	8	13256	13263	25 %	50 %	0 %	25 %	218249162
41	NC_011727	TCGC	2	8	13604	13611	0 %	25 %	25 %	50 %	218249163
42	NC_011727	TCAA	2	8	13715	13722	50 %	25 %	0 %	25 %	218249163
43	NC_011727	AATC	2	8	13738	13745	50 %	25 %	0 %	25 %	218249163
44	NC_011727	ACTA	2	8	14415	14422	50 %	25 %	0 %	25 %	218249164
45	NC_011727	GGCT	2	8	14489	14496	0 %	25 %	50 %	25 %	218249164
46	NC_011727	ATGG	2	8	14772	14779	25 %	25 %	50 %	0 %	218249164
47	NC_011727	CAGA	2	8	14868	14875	50 %	0 %	25 %	25 %	218249164
48	NC_011727	CAAC	2	8	14898	14905	50 %	0 %	0 %	50 %	218249164
49	NC_011727	AAGA	2	8	15379	15386	75 %	0 %	25 %	0 %	218249164
50	NC_011727	TAAA	2	8	15664	15671	75 %	25 %	0 %	0 %	218249164
51	NC_011727	GGGA	2	8	16274	16281	25 %	0 %	75 %	0 %	218249164

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.