MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880103

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011727	TGA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249154
2	NC_011727	TAT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249154
3	NC_011727	AAG	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249154
4	NC_011727	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249154
5	NC_011727	GAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249155
6	NC_011727	CAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249155
7	NC_011727	TCT	2	6	798	803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
8	NC_011727	CTC	2	6	1014	1019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218249156
9	NC_011727	TCG	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249156
10	NC_011727	AAT	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249156
11	NC_011727	TCT	2	6	1348	1353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
12	NC_011727	GCA	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218249156
13	NC_011727	CGT	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249156
14	NC_011727	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249156
15	NC_011727	AAG	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249156
16	NC_011727	GGC	2	6	1823	1828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218249156
17	NC_011727	GAC	2	6	1831	1836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218249156
18	NC_011727	GTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249156
19	NC_011727	TCC	2	6	1920	1925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218249156
20	NC_011727	CTT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
21	NC_011727	TCA	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249156
22	NC_011727	TTG	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249156
23	NC_011727	TCA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249156
24	NC_011727	TCT	2	6	2187	2192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
25	NC_011727	CGG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218249156
26	NC_011727	TGA	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
27	NC_011727	GAT	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
28	NC_011727	CTT	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
29	NC_011727	TGT	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249156
30	NC_011727	ATT	2	6	2537	2542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249156
31	NC_011727	GAT	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
32	NC_011727	TAA	2	6	2588	2593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249156
33	NC_011727	GTT	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249156
34	NC_011727	AGA	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249156
35	NC_011727	TCA	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249156
36	NC_011727	GAG	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218249156
37	NC_011727	TCA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249156
38	NC_011727	ATG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
39	NC_011727	TTG	3	9	3335	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249156
40	NC_011727	TAA	2	6	3406	3411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249156
41	NC_011727	CGC	2	6	3564	3569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218249156
42	NC_011727	TGA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
43	NC_011727	CTT	2	6	3683	3688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
44	NC_011727	AGG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218249156
45	NC_011727	GTA	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
46	NC_011727	CTT	2	6	3935	3940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218249156
47	NC_011727	TCC	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218249156
48	NC_011727	GCT	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249156
49	NC_011727	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
50	NC_011727	GGA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218249156
51	NC_011727	TGA	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249156
52	NC_011727	TTA	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249157
53	NC_011727	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249157
54	NC_011727	CGA	2	6	4709	4714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218249157
55	NC_011727	ATG	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
56	NC_011727	TAT	2	6	5389	5394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
57	NC_011727	AAT	2	6	5414	5419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
58	NC_011727	ATT	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
59	NC_011727	ATG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
60	NC_011727	TAT	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
61	NC_011727	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
62	NC_011727	TAA	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
63	NC_011727	CGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249158
64	NC_011727	ATG	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
65	NC_011727	AGG	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218249158
66	NC_011727	GAA	2	6	5663	5668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
67	NC_011727	GAT	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
68	NC_011727	TAT	2	6	5873	5878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
69	NC_011727	ATT	2	6	5891	5896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
70	NC_011727	AAG	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
71	NC_011727	AGG	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218249158
72	NC_011727	GCT	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249158
73	NC_011727	ATC	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
74	NC_011727	TAA	2	6	6079	6084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
75	NC_011727	ATT	2	6	6110	6115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
76	NC_011727	AAT	3	9	6269	6277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
77	NC_011727	GAA	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
78	NC_011727	TTG	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249158
79	NC_011727	ATG	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
80	NC_011727	ATT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
81	NC_011727	ATT	2	6	6497	6502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
82	NC_011727	ATG	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
83	NC_011727	AAG	2	6	6557	6562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
84	NC_011727	ATG	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
85	NC_011727	GAA	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
86	NC_011727	TTA	2	6	6715	6720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
87	NC_011727	TTA	2	6	6743	6748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
88	NC_011727	ACC	2	6	6776	6781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218249158
89	NC_011727	CAA	2	6	6895	6900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218249158
90	NC_011727	ATT	2	6	6944	6949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
91	NC_011727	TAC	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
92	NC_011727	TTA	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
93	NC_011727	CAA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218249158
94	NC_011727	CAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218249158
95	NC_011727	TAG	2	6	7209	7214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
96	NC_011727	TAA	3	9	7240	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
97	NC_011727	GTC	2	6	7290	7295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249158
98	NC_011727	TTA	2	6	7330	7335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
99	NC_011727	TGA	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
100	NC_011727	TAG	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
101	NC_011727	TAC	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
102	NC_011727	ATG	2	6	7581	7586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
103	NC_011727	ATT	2	6	7607	7612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
104	NC_011727	ATG	2	6	7665	7670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
105	NC_011727	TAG	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
106	NC_011727	GAA	2	6	7677	7682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
107	NC_011727	AAC	2	6	7711	7716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218249158
108	NC_011727	ATG	2	6	7728	7733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
109	NC_011727	GAA	2	6	7806	7811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
110	NC_011727	ACC	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218249158
111	NC_011727	AAG	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
112	NC_011727	ATG	2	6	7941	7946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
113	NC_011727	GTC	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218249158
114	NC_011727	ATG	2	6	8067	8072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
115	NC_011727	ATG	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
116	NC_011727	ATA	2	6	8169	8174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
117	NC_011727	TAC	2	6	8362	8367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
118	NC_011727	TAT	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
119	NC_011727	ATC	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
120	NC_011727	ATG	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
121	NC_011727	ACT	2	6	8483	8488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
122	NC_011727	ATG	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
123	NC_011727	AAG	2	6	8625	8630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
124	NC_011727	TTG	2	6	8643	8648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218249158
125	NC_011727	GAA	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
126	NC_011727	ATG	2	6	8715	8720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
127	NC_011727	ATG	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
128	NC_011727	ACT	2	6	8792	8797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249158
129	NC_011727	TTA	2	6	8822	8827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
130	NC_011727	GAC	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218249158
131	NC_011727	AAT	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
132	NC_011727	TGA	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
133	NC_011727	TAT	2	6	9050	9055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
134	NC_011727	AAG	2	6	9097	9102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249158
135	NC_011727	AAT	2	6	9125	9130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249158
136	NC_011727	GGT	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218249158
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138	NC_011727	ATT	2	6	9650	9655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249158
139	NC_011727	GGT	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218249158
140	NC_011727	AGT	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249158
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144	NC_011727	ATA	2	6	10264	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249159
145	NC_011727	AAT	2	6	10335	10340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218249159
146	NC_011727	TGA	2	6	10390	10395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218249159
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151	NC_011727	GAA	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218249159
152	NC_011727	ATC	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218249159
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163	NC_011727	CAA	2	6	11874	11879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218249160
164	NC_011727	TAT	2	6	11979	11984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218249160
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222	NC_011727	AAC	3	9	16516	16524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218249164

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.