MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 3160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	CCTAC	2	10	2025	2034	20 %	20 %	0 %	60 %	218244895
2	NC_011726	GAGTT	2	10	2448	2457	20 %	40 %	40 %	0 %	218244895
3	NC_011726	AAAAT	2	10	3431	3440	80 %	20 %	0 %	0 %	218244896
4	NC_011726	CTAGA	2	10	4671	4680	40 %	20 %	20 %	20 %	218244897
5	NC_011726	TTATT	2	10	5791	5800	20 %	80 %	0 %	0 %	218244899
6	NC_011726	CTTGA	2	10	6773	6782	20 %	40 %	20 %	20 %	218244900
7	NC_011726	AATCA	2	10	7809	7818	60 %	20 %	0 %	20 %	218244901
8	NC_011726	TTTGC	2	10	10413	10422	0 %	60 %	20 %	20 %	218244902
9	NC_011726	TTAAA	2	10	10537	10546	60 %	40 %	0 %	0 %	218244902
10	NC_011726	GATCA	2	10	12001	12010	40 %	20 %	20 %	20 %	218244904
11	NC_011726	AATAT	2	10	12395	12404	60 %	40 %	0 %	0 %	218244904
12	NC_011726	GAATT	2	10	14009	14018	40 %	40 %	20 %	0 %	218244906
13	NC_011726	GATCA	2	10	16128	16137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011726	AGAAA	2	10	18312	18321	80 %	0 %	20 %	0 %	218244911
15	NC_011726	TAATA	2	10	19193	19202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011726	TATTT	2	10	19495	19504	20 %	80 %	0 %	0 %	218244913
17	NC_011726	ATCAA	2	10	19710	19719	60 %	20 %	0 %	20 %	218244913
18	NC_011726	CAGAT	2	10	21659	21668	40 %	20 %	20 %	20 %	218244914
19	NC_011726	TAAAT	2	10	22154	22163	60 %	40 %	0 %	0 %	218244914
20	NC_011726	CATTA	2	10	29296	29305	40 %	40 %	0 %	20 %	218244920
21	NC_011726	TCTTA	2	10	30366	30375	20 %	60 %	0 %	20 %	218244920
22	NC_011726	TATTT	2	10	30607	30616	20 %	80 %	0 %	0 %	218244920
23	NC_011726	TCTTT	2	10	32518	32527	0 %	80 %	0 %	20 %	218244922
24	NC_011726	GCTTA	2	10	33920	33929	20 %	40 %	20 %	20 %	218244923
25	NC_011726	ATTTT	2	10	34719	34728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011726	ATTCA	2	10	35438	35447	40 %	40 %	0 %	20 %	218244926
27	NC_011726	TCAGT	2	10	39074	39083	20 %	40 %	20 %	20 %	218244930
28	NC_011726	TTGCG	2	10	39376	39385	0 %	40 %	40 %	20 %	218244930
29	NC_011726	GGTTG	2	10	39703	39712	0 %	40 %	60 %	0 %	218244930
30	NC_011726	GGAAA	2	10	40044	40053	60 %	0 %	40 %	0 %	218244931
31	NC_011726	TAGTT	2	10	41645	41654	20 %	60 %	20 %	0 %	218244932
32	NC_011726	AGACA	2	10	42156	42165	60 %	0 %	20 %	20 %	218244932
33	NC_011726	AAATG	2	10	44246	44255	60 %	20 %	20 %	0 %	218244933
34	NC_011726	CCATC	2	10	45052	45061	20 %	20 %	0 %	60 %	218244934
35	NC_011726	CCATT	2	10	45810	45819	20 %	40 %	0 %	40 %	218244935
36	NC_011726	CCTAC	2	10	47268	47277	20 %	20 %	0 %	60 %	218244936
37	NC_011726	TTTGG	2	10	48062	48071	0 %	60 %	40 %	0 %	218244937
38	NC_011726	ATCAA	2	10	48257	48266	60 %	20 %	0 %	20 %	218244937
39	NC_011726	GATTT	2	10	49407	49416	20 %	60 %	20 %	0 %	218244938
40	NC_011726	AATTT	2	10	49649	49658	40 %	60 %	0 %	0 %	218244938
41	NC_011726	TAATT	2	10	49798	49807	40 %	60 %	0 %	0 %	218244938
42	NC_011726	ACTCA	2	10	50715	50724	40 %	20 %	0 %	40 %	218244939
43	NC_011726	TGAGG	2	10	51135	51144	20 %	20 %	60 %	0 %	218244940
44	NC_011726	AATCT	2	10	51913	51922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011726	TAAAG	2	10	52604	52613	60 %	20 %	20 %	0 %	218244941
46	NC_011726	CAACA	2	10	52826	52835	60 %	0 %	0 %	40 %	218244942
47	NC_011726	AACTA	2	10	54021	54030	60 %	20 %	0 %	20 %	218244943
48	NC_011726	TATGA	2	10	54227	54236	40 %	40 %	20 %	0 %	218244943
49	NC_011726	ATTCC	2	10	54366	54375	20 %	40 %	0 %	40 %	218244943
50	NC_011726	ATCTG	2	10	54544	54553	20 %	40 %	20 %	20 %	218244943
51	NC_011726	TAAAG	2	10	57701	57710	60 %	20 %	20 %	0 %	218244947
52	NC_011726	ACCAG	2	10	58196	58205	40 %	0 %	20 %	40 %	218244947
53	NC_011726	CAGTC	2	10	59166	59175	20 %	20 %	20 %	40 %	218244948
54	NC_011726	ATCGC	2	10	60590	60599	20 %	20 %	20 %	40 %	218244949
55	NC_011726	CTAAA	2	10	61422	61431	60 %	20 %	0 %	20 %	218244950
56	NC_011726	TAATT	2	10	62205	62214	40 %	60 %	0 %	0 %	218244951
57	NC_011726	GGGAA	2	10	66947	66956	40 %	0 %	60 %	0 %	218244956
58	NC_011726	TCTTT	2	10	67002	67011	0 %	80 %	0 %	20 %	218244956
59	NC_011726	CTGAA	2	10	69514	69523	40 %	20 %	20 %	20 %	218244958
60	NC_011726	TATAG	2	10	71272	71281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011726	ATAAC	2	10	77028	77037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011726	AGTTA	2	10	77173	77182	40 %	40 %	20 %	0 %	218244965
63	NC_011726	ATAAA	2	10	80932	80941	80 %	20 %	0 %	0 %	218244969
64	NC_011726	TTTAG	2	10	82672	82681	20 %	60 %	20 %	0 %	218244969
65	NC_011726	ATATT	2	10	83997	84006	40 %	60 %	0 %	0 %	218244971
66	NC_011726	CCTTT	2	10	84014	84023	0 %	60 %	0 %	40 %	218244971
67	NC_011726	TATTT	2	10	84923	84932	20 %	80 %	0 %	0 %	218244971
68	NC_011726	ATTCA	2	10	85480	85489	40 %	40 %	0 %	20 %	218244971
69	NC_011726	TTATT	2	10	85955	85964	20 %	80 %	0 %	0 %	218244972
70	NC_011726	GGTTT	2	10	87574	87583	0 %	60 %	40 %	0 %	218244974
71	NC_011726	TTATT	2	10	88098	88107	20 %	80 %	0 %	0 %	218244974
72	NC_011726	ATAGT	2	10	89167	89176	40 %	40 %	20 %	0 %	218244975
73	NC_011726	ATATT	2	10	89930	89939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011726	TGACT	2	10	92343	92352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011726	AGGTG	2	10	93880	93889	20 %	20 %	60 %	0 %	218244979
76	NC_011726	TCAAA	2	10	94555	94564	60 %	20 %	0 %	20 %	218244980
77	NC_011726	TTTGA	2	10	94565	94574	20 %	60 %	20 %	0 %	218244980
78	NC_011726	TAATT	2	10	97689	97698	40 %	60 %	0 %	0 %	218244984
79	NC_011726	CAACG	2	10	98230	98239	40 %	0 %	20 %	40 %	218244984
80	NC_011726	GTTTA	2	10	99894	99903	20 %	60 %	20 %	0 %	218244985
81	NC_011726	AGGGA	2	10	100946	100955	40 %	0 %	60 %	0 %	218244986
82	NC_011726	TTTCA	2	10	101657	101666	20 %	60 %	0 %	20 %	218244987
83	NC_011726	AATTT	2	10	102159	102168	40 %	60 %	0 %	0 %	218244987
84	NC_011726	GATTT	2	10	105875	105884	20 %	60 %	20 %	0 %	218244991
85	NC_011726	CATCA	2	10	105938	105947	40 %	20 %	0 %	40 %	218244991
86	NC_011726	CGGAA	2	10	106883	106892	40 %	0 %	40 %	20 %	218244992
87	NC_011726	TTTAT	2	10	106898	106907	20 %	80 %	0 %	0 %	218244992
88	NC_011726	CAACC	2	10	107286	107295	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_011726	GTTAA	2	10	108796	108805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011726	TTTTC	2	10	111494	111503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011726	ACTTA	2	10	112055	112064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011726	CAAAC	2	10	112653	112662	60 %	0 %	0 %	40 %	218244998
93	NC_011726	ACCAA	2	10	114828	114837	60 %	0 %	0 %	40 %	218245001
94	NC_011726	TAAAA	2	10	114924	114933	80 %	20 %	0 %	0 %	218245001
95	NC_011726	AAAAT	2	10	115591	115600	80 %	20 %	0 %	0 %	218245002
96	NC_011726	TTTCT	2	10	116668	116677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011726	TTAAT	2	10	117492	117501	40 %	60 %	0 %	0 %	218245003
98	NC_011726	TTTGG	2	10	118549	118558	0 %	60 %	40 %	0 %	218245004
99	NC_011726	ACCCC	2	10	120987	120996	20 %	0 %	0 %	80 %	218245008
100	NC_011726	CCCAT	2	10	122675	122684	20 %	20 %	0 %	60 %	218245008
101	NC_011726	CCCAT	2	10	123714	123723	20 %	20 %	0 %	60 %	218245008
102	NC_011726	GTTTT	2	10	123818	123827	0 %	80 %	20 %	0 %	218245008
103	NC_011726	GTTTC	2	10	124985	124994	0 %	60 %	20 %	20 %	218245011
104	NC_011726	GTTGA	2	10	125393	125402	20 %	40 %	40 %	0 %	218245012
105	NC_011726	ATAAA	2	10	125611	125620	80 %	20 %	0 %	0 %	218245012
106	NC_011726	TTAAT	2	10	142320	142329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011726	TGGGA	2	10	145741	145750	20 %	20 %	60 %	0 %	218245028
108	NC_011726	TTCAT	2	10	146308	146317	20 %	60 %	0 %	20 %	218245029
109	NC_011726	AATTT	2	10	147468	147477	40 %	60 %	0 %	0 %	218245031
110	NC_011726	GCCAT	2	10	148371	148380	20 %	20 %	20 %	40 %	218245032
111	NC_011726	TTAAT	2	10	149310	149319	40 %	60 %	0 %	0 %	218245034
112	NC_011726	AGCAT	2	10	150064	150073	40 %	20 %	20 %	20 %	218245035
113	NC_011726	TCTAA	2	10	151814	151823	40 %	40 %	0 %	20 %	218245036
114	NC_011726	CTAAC	2	10	152641	152650	40 %	20 %	0 %	40 %	218245038
115	NC_011726	TAAGC	2	10	153170	153179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011726	AAGAC	2	10	153695	153704	60 %	0 %	20 %	20 %	218245041
117	NC_011726	CCTCA	2	10	155254	155263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011726	CAAGC	2	10	159490	159499	40 %	0 %	20 %	40 %	218245045
119	NC_011726	ATCCC	2	10	162127	162136	20 %	20 %	0 %	60 %	218245048
120	NC_011726	ACTCA	2	10	164193	164202	40 %	20 %	0 %	40 %	218245049
121	NC_011726	CAAAA	2	10	167096	167105	80 %	0 %	0 %	20 %	218245052
122	NC_011726	AAGTT	2	10	168681	168690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011726	AATTT	2	10	169110	169119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011726	GATAC	2	10	170378	170387	40 %	20 %	20 %	20 %	218245054
125	NC_011726	AAATT	2	10	174062	174071	60 %	40 %	0 %	0 %	218245061
126	NC_011726	TTGAA	2	10	174538	174547	40 %	40 %	20 %	0 %	218245062
127	NC_011726	CATAC	2	10	177575	177584	40 %	20 %	0 %	40 %	218245067
128	NC_011726	GGGAT	2	10	177795	177804	20 %	20 %	60 %	0 %	218245067
129	NC_011726	AATTT	2	10	178753	178762	40 %	60 %	0 %	0 %	218245068
130	NC_011726	ATCTT	2	10	178990	178999	20 %	60 %	0 %	20 %	218245068
131	NC_011726	TTTAC	2	10	179835	179844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011726	AACCA	2	10	181867	181876	60 %	0 %	0 %	40 %	218245072
133	NC_011726	GCAAA	2	10	185415	185424	60 %	0 %	20 %	20 %	218245077
134	NC_011726	TCCCG	2	10	185474	185483	0 %	20 %	20 %	60 %	218245077
135	NC_011726	ATCGC	2	10	189031	189040	20 %	20 %	20 %	40 %	218245080
136	NC_011726	TATTT	2	10	190518	190527	20 %	80 %	0 %	0 %	218245081
137	NC_011726	GTCCA	2	10	190622	190631	20 %	20 %	20 %	40 %	218245081
138	NC_011726	TGGTG	2	10	190895	190904	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011726	AATTA	2	10	191635	191644	60 %	40 %	0 %	0 %	218245083
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245	NC_011726	AATGG	2	10	375487	375496	40 %	20 %	40 %	0 %	218245258
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248	NC_011726	TAATT	2	10	379758	379767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_011726	CAATA	2	10	380269	380278	60 %	20 %	0 %	20 %	218245262
250	NC_011726	TATTT	2	10	380660	380669	20 %	80 %	0 %	0 %	218245262
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255	NC_011726	ACCGG	2	10	385355	385364	20 %	0 %	40 %	40 %	218245267
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262	NC_011726	AATTG	2	10	394791	394800	40 %	40 %	20 %	0 %	218245275
263	NC_011726	ATCAA	2	10	397910	397919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_011726	GGGAC	2	10	399242	399251	20 %	0 %	60 %	20 %	218245280
265	NC_011726	ATCCT	2	10	401190	401199	20 %	40 %	0 %	40 %	218245282
266	NC_011726	ATGAT	2	10	403956	403965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_011726	TATTC	2	10	403971	403980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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