MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	GATCA	2	10	16128	16137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011726	TAATA	2	10	19193	19202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011726	ATTTT	2	10	34719	34728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011726	AATCT	2	10	51913	51922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011726	TATAG	2	10	71272	71281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011726	ATAAC	2	10	77028	77037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011726	ATATT	2	10	89930	89939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011726	TGACT	2	10	92343	92352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011726	CAACC	2	10	107286	107295	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_011726	GTTAA	2	10	108796	108805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011726	TTTTC	2	10	111494	111503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011726	ACTTA	2	10	112055	112064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011726	TTTCT	2	10	116668	116677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011726	TTAAT	2	10	142320	142329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011726	TAAGC	2	10	153170	153179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011726	CCTCA	2	10	155254	155263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011726	AAGTT	2	10	168681	168690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011726	AATTT	2	10	169110	169119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011726	TTTAC	2	10	179835	179844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011726	TGGTG	2	10	190895	190904	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011726	TTTTA	2	10	199057	199066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011726	GGTAG	2	10	201426	201435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011726	TTGAC	2	10	204217	204226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011726	CTTGA	2	10	206083	206092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011726	CTTGA	2	10	206654	206663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011726	TATCC	2	10	207509	207518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011726	TAACA	2	10	222701	222710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011726	CTAGT	2	10	253602	253611	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011726	TTCCT	2	10	253726	253735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011726	TTAAG	2	10	253969	253978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011726	AATCC	2	10	257195	257204	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011726	TGAAT	2	10	262046	262055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011726	AGTTT	2	10	304807	304816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011726	CAGTT	2	10	323875	323884	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011726	TCCTA	3	15	329256	329270	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011726	TAAGA	2	10	332086	332095	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011726	ATCTA	2	10	355733	355742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011726	GAACA	2	10	372959	372968	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011726	TAATT	2	10	379758	379767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011726	TATAA	2	10	383783	383792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011726	ATCAA	2	10	397910	397919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011726	ATGAT	2	10	403956	403965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011726	TATTC	2	10	403971	403980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011726	AGAAA	2	10	407164	407173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011726	CTTAA	2	10	427584	427593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011726	TTAAA	2	10	427759	427768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011726	ATTTT	3	15	435731	435745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011726	CCTCA	2	10	438793	438802	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_011726	GATTA	2	10	443872	443881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011726	AATAA	2	10	446412	446421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011726	CTTAA	2	10	451726	451735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011726	CTAAG	2	10	454685	454694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011726	TTCCC	2	10	465236	465245	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_011726	ACTTG	2	10	468751	468760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011726	TTAAA	2	10	479893	479902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011726	TAACC	2	10	498023	498032	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011726	CAACC	2	10	498121	498130	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_011726	AAATT	2	10	501134	501143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011726	AGATA	2	10	505843	505852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011726	TGCTA	2	10	512839	512848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011726	TATCT	2	10	514152	514161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011726	CAAGT	2	10	544802	544811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011726	ATTAT	2	10	550720	550729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011726	GACTT	2	10	559284	559293	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011726	ACTTA	2	10	560718	560727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011726	ATATT	2	10	570848	570857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011726	TAAAG	2	10	589211	589220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011726	ATCTC	2	10	600304	600313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011726	TCTAA	2	10	615721	615730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011726	GCTAA	2	10	625917	625926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011726	CCTCT	2	10	633938	633947	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_011726	ATCCT	2	10	643160	643169	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011726	TAAAA	2	10	643296	643305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011726	AATCC	2	10	646044	646053	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_011726	AACTT	2	10	664597	664606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011726	TGTAT	2	10	667929	667938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011726	AAGTT	2	10	670608	670617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011726	ATCTT	2	10	680612	680621	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011726	CCTAC	2	10	682179	682188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_011726	ACACC	2	10	682645	682654	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_011726	GGTAG	2	10	683545	683554	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011726	AAAGT	2	10	688871	688880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011726	TCAAA	2	10	692625	692634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011726	TCTTT	2	10	697298	697307	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011726	CCCAC	2	10	701900	701909	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
86	NC_011726	CCTAC	2	10	702450	702459	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_011726	AATTA	2	10	702608	702617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011726	CTACT	2	10	705763	705772	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011726	CCTAC	2	10	710380	710389	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_011726	ATGAA	2	10	711828	711837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011726	TTAAT	2	10	714353	714362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011726	TAGTT	2	10	717594	717603	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011726	TAGAA	2	10	717760	717769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011726	TTAAT	2	10	735213	735222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011726	ATCAA	3	15	738055	738069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011726	TAGGA	2	10	749962	749971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011726	ATTCA	2	10	752458	752467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011726	GTCAA	2	10	757209	757218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011726	AATTT	2	10	767894	767903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011726	TATTT	2	10	767917	767926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011726	GTTAA	2	10	775501	775510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011726	AAGAG	2	10	776778	776787	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011726	TTTAT	2	10	776895	776904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011726	ATCTA	2	10	786585	786594	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011726	ACTTA	2	10	788128	788137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011726	TCCCG	2	10	789360	789369	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_011726	ATTTT	2	10	791367	791376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011726	CAGCA	2	10	803726	803735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011726	GTTAA	2	10	808668	808677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011726	CAGAA	2	10	816269	816278	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011726	GAAAA	2	10	816786	816795	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011726	CGTTC	2	10	818239	818248	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011726	TATGC	2	10	821256	821265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011726	ATTTA	2	10	823252	823261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011726	CAAGT	2	10	826804	826813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011726	ATTGT	2	10	835973	835982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011726	TAAAA	2	10	836054	836063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011726	TTAAA	2	10	838639	838648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011726	CTATC	2	10	842691	842700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011726	TAATT	2	10	845738	845747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011726	ATTAA	2	10	848778	848787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011726	AAGAT	2	10	851397	851406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011726	TTAAC	2	10	866235	866244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011726	TAGCG	2	10	875313	875322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011726	TTGTC	2	10	876053	876062	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011726	CAAAG	2	10	876302	876311	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011726	TAATC	2	10	876628	876637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011726	TCCGT	2	10	876977	876986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011726	GGTTT	2	10	877101	877110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011726	GTTTA	2	10	877314	877323	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011726	AGAGG	2	10	877640	877649	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011726	ATTTA	2	10	877713	877722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011726	CAAAT	2	10	889249	889258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011726	ACAAA	2	10	889629	889638	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011726	GATAT	2	10	889760	889769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011726	CTTTA	2	10	912595	912604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011726	GCTTA	2	10	913819	913828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011726	AAGCA	2	10	914873	914882	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011726	AGCGT	2	10	916138	916147	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011726	TAGCT	2	10	920201	920210	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011726	AAAAG	2	10	922029	922038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011726	CTTAG	2	10	930577	930586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011726	TTAAA	2	10	933671	933680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011726	TAGCA	2	10	935922	935931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011726	TATAA	2	10	937670	937679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011726	AGTTA	2	10	938690	938699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011726	GCTTG	2	10	944931	944940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011726	TAGCG	2	10	947780	947789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011726	AAACT	2	10	952054	952063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_011726	TAAAA	2	10	959128	959137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011726	AACTA	2	10	963369	963378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_011726	GGTTG	2	10	964561	964570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011726	AATTT	2	10	981097	981106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011726	AATTA	2	10	984119	984128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011726	ATTAA	2	10	984314	984323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011726	TATAA	2	10	993943	993952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011726	AAATT	2	10	994281	994290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011726	TAGAG	2	10	1020143	1020152	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011726	TTTGA	2	10	1024736	1024745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011726	TAAAA	2	10	1087267	1087276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011726	TAGAA	2	10	1090310	1090319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011726	TACCC	2	10	1101041	1101050	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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182	NC_011726	TAAAC	2	10	1125540	1125549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_011726	ACCCT	2	10	1127116	1127125	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
184	NC_011726	CAACC	2	10	1140386	1140395	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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194	NC_011726	GGTTA	2	10	1203065	1203074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011726	TAACT	2	10	1215251	1215260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_011726	GCTAA	2	10	1217721	1217730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_011726	GAATA	2	10	1842399	1842408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011726	CCTAC	2	10	1846679	1846688	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_011726	CTGTG	2	10	1856852	1856861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_011726	GACTG	2	10	3058047	3058056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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