MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 8271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	AGC	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011726	CAT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011726	TAA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011726	GAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011726	GAT	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011726	AAG	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011726	CGG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011726	TCA	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011726	TAA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011726	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011726	AAC	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011726	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011726	TAA	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011726	TGA	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011726	AAC	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011726	TAA	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011726	ATT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011726	GTT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011726	TAT	2	6	5384	5389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011726	ATC	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011726	TGA	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011726	CTA	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011726	TAA	2	6	11578	11583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011726	GAT	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011726	TCA	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011726	TGT	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011726	AAT	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011726	TTA	2	6	11704	11709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011726	TTA	2	6	15576	15581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011726	ATA	2	6	16225	16230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011726	AGA	2	6	16282	16287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011726	AAT	2	6	16293	16298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011726	AAT	2	6	16674	16679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011726	TAA	2	6	16691	16696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011726	AGT	2	6	17230	17235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011726	TTA	2	6	19014	19019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011726	TAT	2	6	19084	19089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011726	CCT	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011726	TCA	2	6	19285	19290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011726	TTC	2	6	23847	23852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011726	TGT	2	6	23868	23873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011726	CTA	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011726	TTC	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011726	TCT	2	6	26431	26436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011726	ATT	2	6	28636	28641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011726	TAA	2	6	28664	28669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011726	AAT	2	6	28877	28882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011726	ATG	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011726	CTT	2	6	31204	31209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011726	ACT	2	6	31241	31246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011726	TAG	2	6	31274	31279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011726	TAT	2	6	31297	31302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011726	TTC	2	6	31345	31350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011726	TGA	2	6	34106	34111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011726	TAC	2	6	34175	34180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011726	TTG	2	6	34304	34309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011726	TAT	2	6	34347	34352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011726	AAT	2	6	34738	34743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011726	ACT	2	6	34894	34899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011726	ATT	3	9	37607	37615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011726	TAC	2	6	37642	37647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011726	ACC	2	6	37670	37675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011726	TAA	2	6	38779	38784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011726	CTC	2	6	40636	40641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011726	TAC	2	6	40658	40663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011726	TCC	2	6	40676	40681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011726	TGA	2	6	40719	40724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011726	CAA	2	6	40731	40736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011726	ATA	2	6	40766	40771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011726	ATG	2	6	40792	40797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011726	TCA	2	6	40861	40866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011726	TTA	2	6	40944	40949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011726	AAT	2	6	50997	51002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011726	ATT	2	6	56754	56759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011726	TAG	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011726	GGA	2	6	60195	60200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011726	ATT	3	9	60287	60295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011726	AAC	2	6	60404	60409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011726	TAT	2	6	61913	61918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011726	ATC	3	9	62783	62791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011726	CTC	2	6	64389	64394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011726	ATC	2	6	64888	64893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011726	TAA	2	6	65994	65999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011726	CAA	2	6	66113	66118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011726	CTA	2	6	66148	66153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011726	TAC	2	6	66257	66262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011726	AGC	2	6	66311	66316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011726	TCT	2	6	66357	66362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011726	CTA	2	6	66373	66378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011726	AAG	2	6	66497	66502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011726	GGA	2	6	66541	66546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011726	CCG	2	6	68654	68659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011726	ATT	2	6	71266	71271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011726	TAA	3	9	71307	71315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011726	GAT	2	6	71364	71369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011726	AGA	2	6	71392	71397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011726	TAA	2	6	71419	71424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011726	TAA	2	6	77045	77050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011726	AAT	2	6	85616	85621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011726	GGA	2	6	92791	92796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011726	CCT	2	6	92896	92901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011726	CCT	2	6	92910	92915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011726	CCT	2	6	92917	92922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011726	CCT	2	6	92924	92929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011726	CCT	2	6	92931	92936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011726	GGT	2	6	94084	94089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011726	ATT	2	6	94215	94220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011726	TAT	2	6	95498	95503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011726	TGT	2	6	95529	95534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011726	ATG	2	6	95583	95588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011726	GCT	2	6	96237	96242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011726	GTA	2	6	96300	96305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011726	AGA	2	6	96310	96315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011726	TCC	2	6	97000	97005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011726	GAT	2	6	97096	97101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011726	TCG	2	6	97103	97108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011726	ATC	2	6	97121	97126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011726	TAA	2	6	97129	97134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011726	GTA	2	6	99986	99991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011726	TAT	2	6	99992	99997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011726	AGA	2	6	100014	100019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011726	TTG	2	6	102181	102186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011726	ATG	2	6	102191	102196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011726	AAT	3	9	102197	102205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011726	ATT	2	6	105163	105168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011726	ACA	2	6	105285	105290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011726	TAC	2	6	106333	106338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011726	TAA	2	6	106372	106377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011726	TGA	2	6	107212	107217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011726	TAA	2	6	107246	107251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011726	CTA	2	6	107262	107267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011726	CCT	2	6	107306	107311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011726	TTG	2	6	107330	107335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011726	TTA	2	6	108818	108823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011726	AGA	2	6	108852	108857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011726	AGA	2	6	108909	108914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011726	TTC	2	6	108917	108922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011726	CTG	2	6	109035	109040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011726	TAA	2	6	109094	109099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011726	TTA	2	6	111950	111955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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